171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0578 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0578  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 313 aa  640    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0583  beta-lactamase domain protein  47.74 
 
 		 297 aa  281  7.000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000802552  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00755  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  31.13 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3742  Zn-dependent hydrolases  32.63 
 
 		 318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6778  beta-lactamase domain protein  34.17 
 
 		 310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.889748 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2195  beta-lactamase-like protein  32.61 
 
 		 289 aa  116  6e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1646  beta-lactamase domain-containing protein  32.37 
 
 		 292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01180  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  30.6 
 
 		 294 aa  114  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.837421  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1827  beta-lactamase domain-containing protein  30.08 
 
 		 291 aa  112  6e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.021079  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1553  beta-lactamase domain protein  32.3 
 
 		 322 aa  112  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163514  hitchhiker  0.000581399 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1764  Na-translocating NADH-quinone reductase subunit A  34.65 
 
 		 329 aa  111  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.439297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1888  hypothetical protein  29.63 
 
 		 321 aa  109  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1415  beta-lactamase-like protein  31.43 
 
 		 288 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0489899 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2674  beta-lactamase domain protein  29.66 
 
 		 319 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2823  beta-lactamase domain-containing protein  31.19 
 
 		 287 aa  106  6e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.328939  normal  0.0927352 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0353  beta-lactamase-like  31.62 
 
 		 309 aa  105  7e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586247  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2384  beta-lactamase domain-containing protein  32.29 
 
 		 294 aa  105  7e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0462  beta-lactamase-like  34.59 
 
 		 292 aa  104  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3062  beta-lactamase domain-containing protein  30.62 
 
 		 297 aa  103  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2395  beta-lactamase domain-containing protein  30.74 
 
 		 313 aa  102  8e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.335507 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1614  Beta-lactamase-like  30.59 
 
 		 339 aa  102  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.835771  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  32.02 
 
 		 315 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  30.57 
 
 		 315 aa  79.3  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  31.84 
 
 		 321 aa  79  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  31.23 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0080  beta-lactamase domain protein  29.39 
 
 		 319 aa  75.1  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  28.51 
 
 		 349 aa  75.1  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  25.77 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  26.26 
 
 		 310 aa  69.7  0.00000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  26.92 
 
 		 314 aa  69.3  0.00000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1125  beta-lactamase domain protein  30.61 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5952  putative metallo-beta-lactamase family protein  29.13 
 
 		 308 aa  67  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1965  beta-lactamase domain-containing protein  26.32 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  24.69 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  27.17 
 
 		 321 aa  65.9  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1667  metallo-beta-lactamase family protein  23.97 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  29.28 
 
 		 364 aa  63.9  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  28.3 
 
 		 327 aa  64.3  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0250  beta-lactamase domain-containing protein  29.03 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  30.69 
 
 		 351 aa  62  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0248  beta-lactamase domain-containing protein  28.5 
 
 		 246 aa  62  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  25.43 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  29.41 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  29.91 
 
 		 364 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2612  beta-lactamase domain protein  27.31 
 
 		 342 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.584413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1902  beta-lactamase domain-containing protein  30.81 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.392348  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  28.34 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1934  beta-lactamase domain-containing protein  27.07 
 
 		 347 aa  59.3  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1735  beta-lactamase domain protein  26.42 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.593356  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1904  metallo-beta-lactamase family protein  21.99 
 
 		 300 aa  58.5  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224567  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  29.23 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0244  beta-lactamase domain protein  27.63 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0816903 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  27.92 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1344  beta-lactamase domain protein  28.82 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_6889  predicted protein  31.91 
 
 		 227 aa  57  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.359449  normal  0.106822 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  25.21 
 
 		 337 aa  57  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3260  beta-lactamase domain-containing protein  25.9 
 
 		 275 aa  57  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0555  beta-lactamase domain protein  29.56 
 
 		 316 aa  57  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000575755  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2623  beta-lactamase-like  26.15 
 
 		 316 aa  56.2  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1853  beta-lactamase domain-containing protein  25.8 
 
 		 356 aa  55.8  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2289  beta-lactamase domain-containing protein  27.09 
 
 		 320 aa  55.8  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752548  normal  0.139698 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0343  metallo-beta-lactamase family protein  30.57 
 
 		 256 aa  55.5  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  29.49 
 
 		 318 aa  55.8  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2077  beta-lactamase domain-containing protein  23.66 
 
 		 273 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1898  beta-lactamase domain-containing protein  24.11 
 
 		 273 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.337278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  27.12 
 
 		 249 aa  55.5  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1652  beta-lactamase domain-containing protein  25.62 
 
 		 326 aa  55.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.685243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1776  beta-lactamase domain-containing protein  27.84 
 
 		 310 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0922  beta-lactamase-like  27.59 
 
 		 318 aa  54.7  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2112  beta-lactamase domain protein  27.32 
 
 		 310 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  25.69 
 
 		 352 aa  55.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2197  beta-lactamase domain-containing protein  24.51 
 
 		 298 aa  54.3  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0276351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6499  beta-lactamase domain protein  26.43 
 
 		 319 aa  53.9  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.735445 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  30.29 
 
 		 308 aa  53.1  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  26.59 
 
 		 342 aa  53.5  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1621  Beta-lactamase-like  23.25 
 
 		 334 aa  53.1  0.000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.683443  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  27.55 
 
 		 318 aa  53.1  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  26.83 
 
 		 312 aa  52.8  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0684  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.43 
 
 		 246 aa  52.8  0.000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10957  bifunctional 2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase/cyclase/dehydrase  25.83 
 
 		 644 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.761321 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  27 
 
 		 318 aa  52.4  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  26.34 
 
 		 313 aa  52.4  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1033  beta-lactamase domain protein  28.66 
 
 		 333 aa  52  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11942  hypothetical protein  29.56 
 
 		 250 aa  52  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2206  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.27 
 
 		 255 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1308  beta-lactamase domain-containing protein  23.98 
 
 		 246 aa  51.2  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  24.34 
 
 		 333 aa  50.4  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  27.32 
 
 		 313 aa  50.8  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9074  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1 7-dioic acid hydratase (catechol pathway)-like protein  26.36 
 
 		 637 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0471  beta-lactamase domain protein  24.04 
 
 		 346 aa  50.8  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0378  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.53 
 
 		 248 aa  50.4  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  28.16 
 
 		 207 aa  50.1  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  28.04 
 
 		 287 aa  50.1  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3034  beta-lactamase domain-containing protein  27.22 
 
 		 275 aa  50.1  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.641137 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2753  beta-lactamase domain protein  32.89 
 
 		 217 aa  49.7  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  30.25 
 
 		 207 aa  49.7  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0890  beta-lactamase-like  27.78 
 
 		 317 aa  49.7  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2186  beta-lactamase domain protein  26.53 
 
 		 210 aa  49.3  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.704345 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3452  beta-lactamase II  26.55 
 
 		 257 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000101739  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>