139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2197 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2197  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 298 aa  610  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0276351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2077  beta-lactamase domain-containing protein  65.19 
 
 		 273 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1898  beta-lactamase domain-containing protein  64.51 
 
 		 273 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.337278  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01180  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  30.47 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.837421  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0353  beta-lactamase-like  30.37 
 
 		 309 aa  97.1  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586247  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  24.79 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1646  beta-lactamase domain-containing protein  29.41 
 
 		 292 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2195  beta-lactamase-like protein  28.63 
 
 		 289 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3062  beta-lactamase domain-containing protein  26.47 
 
 		 297 aa  79  0.00000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  23.61 
 
 		 299 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  22.92 
 
 		 323 aa  75.5  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  24.88 
 
 		 302 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  22.13 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3742  Zn-dependent hydrolases  26.1 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1888  hypothetical protein  26.69 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6778  beta-lactamase domain protein  26.2 
 
 		 310 aa  69.7  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.889748 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00755  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  23.4 
 
 		 296 aa  68.9  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0462  beta-lactamase-like  27.07 
 
 		 292 aa  68.2  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1415  beta-lactamase-like protein  25.79 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0489899 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2893  beta-lactamase domain protein  26.73 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  25.63 
 
 		 312 aa  66.2  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  27.42 
 
 		 312 aa  65.9  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  20.97 
 
 		 333 aa  65.1  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2395  beta-lactamase domain-containing protein  24.61 
 
 		 313 aa  64.3  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.335507 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1764  Na-translocating NADH-quinone reductase subunit A  26.42 
 
 		 329 aa  63.9  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.439297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1577  beta-lactamase domain protein  21.13 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3186  beta-lactamase domain-containing protein  25.33 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2531  beta-lactamase domain protein  24.44 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  22.93 
 
 		 342 aa  62.8  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0095  beta-lactamase domain-containing protein  25.52 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2384  beta-lactamase domain-containing protein  24.9 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  24.26 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3260  beta-lactamase domain-containing protein  21.79 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2853  beta-lactamase domain-containing protein  34 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000307467 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  23.71 
 
 		 342 aa  60.1  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11942  hypothetical protein  25.11 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  28.33 
 
 		 307 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  28.33 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  24.55 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1614  Beta-lactamase-like  24.69 
 
 		 339 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.835771  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  25.12 
 
 		 332 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  21.78 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  25 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0911  beta-lactamase domain protein  23.81 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2674  beta-lactamase domain protein  24.43 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1871  Beta-lactamase-like  28.51 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  24.24 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2823  beta-lactamase domain-containing protein  23.65 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.328939  normal  0.0927352 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  23.6 
 
 		 337 aa  55.8  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  22.13 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1902  beta-lactamase domain-containing protein  22.78 
 
 		 287 aa  55.8  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.392348  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  24.55 
 
 		 364 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  25 
 
 		 364 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0578  beta-lactamase domain-containing protein  24.51 
 
 		 313 aa  54.3  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2963  beta-lactamase domain-containing protein  23.36 
 
 		 298 aa  54.7  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.955909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  22.61 
 
 		 310 aa  54.7  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  25.31 
 
 		 309 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3125  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 313 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265077  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1827  beta-lactamase domain-containing protein  24.47 
 
 		 291 aa  53.5  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.021079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1103  putative hydrolase  22.82 
 
 		 312 aa  53.1  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197828  normal  0.352936 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0583  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 297 aa  53.5  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000802552  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1168  metallo-beta-lactamase superfamily protein  22.22 
 
 		 390 aa  53.1  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0415868  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  25.89 
 
 		 318 aa  53.1  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1125  beta-lactamase domain protein  23.97 
 
 		 315 aa  52.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  25.49 
 
 		 313 aa  53.1  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  23.81 
 
 		 314 aa  52.8  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1553  beta-lactamase domain protein  21.9 
 
 		 322 aa  52.8  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163514  hitchhiker  0.000581399 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  21.15 
 
 		 321 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  23.14 
 
 		 349 aa  51.6  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0271  beta-lactamase domain protein  21.86 
 
 		 425 aa  52  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000349222  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  26.04 
 
 		 352 aa  51.6  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1292  beta-lactamase domain protein  38.27 
 
 		 656 aa  51.2  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000152038  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2500  beta-lactamase domain protein  24.74 
 
 		 315 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.397877 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2106  beta-lactamase domain protein  24.74 
 
 		 315 aa  50.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.105061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0686  beta-lactamase domain-containing protein  24.3 
 
 		 597 aa  50.8  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.459688 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  22.17 
 
 		 312 aa  50.4  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  25.21 
 
 		 327 aa  50.1  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3514  beta-lactamase domain protein  37.14 
 
 		 657 aa  49.7  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000285828  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1934  beta-lactamase domain-containing protein  24.62 
 
 		 347 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  22.61 
 
 		 313 aa  48.5  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0244  beta-lactamase domain protein  20.99 
 
 		 315 aa  48.5  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0816903 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  23.36 
 
 		 318 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  22.36 
 
 		 319 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2733  beta-lactamase domain-containing protein  26.17 
 
 		 325 aa  47.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  23.9 
 
 		 210 aa  48.1  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5952  putative metallo-beta-lactamase family protein  22.91 
 
 		 308 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  21.53 
 
 		 249 aa  48.1  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0471  beta-lactamase domain protein  24.23 
 
 		 346 aa  47.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5004  beta-lactamase domain-containing protein  23.79 
 
 		 317 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331086  normal  0.0887437 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  22.99 
 
 		 318 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6499  beta-lactamase domain protein  25.67 
 
 		 319 aa  47.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.735445 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2045  metallo-beta-lactamase family protein  32.58 
 
 		 653 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3379  Beta-lactamase-like  35.71 
 
 		 653 aa  47  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361025  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2083  Beta-lactamase-like  25.88 
 
 		 323 aa  47  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3696  beta-lactamase domain-containing protein  32.95 
 
 		 653 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1033  beta-lactamase domain protein  25.57 
 
 		 333 aa  47  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  21.27 
 
 		 319 aa  46.6  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2189  hypothetical protein  23.18 
 
 		 323 aa  46.6  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.887609  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  23.71 
 
 		 319 aa  46.2  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  21.94 
 
 		 319 aa  46.2  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>