More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1026 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  100 
 
 		 312 aa  627  1e-179  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  54.92 
 
 		 342 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3125  beta-lactamase domain-containing protein  54.52 
 
 		 313 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265077  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  53.26 
 
 		 307 aa  299  3e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  52.92 
 
 		 307 aa  297  1e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  50.69 
 
 		 309 aa  297  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0472  hydrolase, putative  49.66 
 
 		 298 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0389397 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2733  beta-lactamase domain-containing protein  49.18 
 
 		 325 aa  282  5.000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0725  beta-lactamase domain-containing protein  45.39 
 
 		 334 aa  269  5e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0290049 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2106  beta-lactamase domain protein  45.7 
 
 		 315 aa  256  4e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.105061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2500  beta-lactamase domain protein  45.36 
 
 		 315 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.397877 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1824  beta-lactamase domain-containing protein  45.45 
 
 		 342 aa  250  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00672926 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4154  beta-lactamase domain-containing protein  45.02 
 
 		 317 aa  249  3e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0686  beta-lactamase domain-containing protein  42.36 
 
 		 597 aa  231  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.459688 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  34.04 
 
 		 314 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  34.22 
 
 		 323 aa  135  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  36.63 
 
 		 327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  34.13 
 
 		 321 aa  123  5e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5952  putative metallo-beta-lactamase family protein  34.35 
 
 		 308 aa  113  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1776  beta-lactamase domain-containing protein  35.98 
 
 		 310 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1965  beta-lactamase domain-containing protein  33.06 
 
 		 320 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2112  beta-lactamase domain protein  35.15 
 
 		 310 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1735  beta-lactamase domain protein  34.13 
 
 		 310 aa  108  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.593356  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 		 349 aa  107  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  32.09 
 
 		 351 aa  107  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  32.73 
 
 		 318 aa  105  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  30.26 
 
 		 305 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  32.99 
 
 		 312 aa  105  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  31.99 
 
 		 318 aa  103  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  27.61 
 
 		 302 aa  103  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  28.14 
 
 		 298 aa  102  7e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  32.36 
 
 		 318 aa  102  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  37.11 
 
 		 315 aa  102  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2189  hypothetical protein  30.88 
 
 		 323 aa  100  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.887609  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0471  beta-lactamase domain protein  35.68 
 
 		 346 aa  101  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  32 
 
 		 318 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  29.19 
 
 		 333 aa  99.8  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  33.48 
 
 		 312 aa  99  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  28.78 
 
 		 299 aa  99.4  8e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  29.79 
 
 		 287 aa  99.4  8e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  32.81 
 
 		 364 aa  99  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  35.02 
 
 		 315 aa  99  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1934  beta-lactamase domain-containing protein  32.03 
 
 		 347 aa  97.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  27.24 
 
 		 332 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2056  Beta-lactamase-like  24.91 
 
 		 340 aa  97.8  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000527783  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  29.8 
 
 		 352 aa  97.8  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  38.14 
 
 		 321 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  32.41 
 
 		 364 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  25.3 
 
 		 342 aa  94.4  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0734  beta-lactamase domain-containing protein  29.24 
 
 		 343 aa  94  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0713703  normal  0.0589281 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0244  beta-lactamase domain protein  34.26 
 
 		 315 aa  94  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0816903 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0095  beta-lactamase domain-containing protein  32.22 
 
 		 315 aa  94  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1103  putative hydrolase  28.47 
 
 		 312 aa  90.5  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197828  normal  0.352936 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0080  beta-lactamase domain protein  28.42 
 
 		 319 aa  89.7  6e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2531  beta-lactamase domain protein  28.38 
 
 		 312 aa  88.6  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0911  beta-lactamase domain protein  28.74 
 
 		 330 aa  89  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  28.46 
 
 		 337 aa  88.2  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1621  Beta-lactamase-like  28.18 
 
 		 334 aa  85.9  9e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.683443  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0555  beta-lactamase domain protein  28.64 
 
 		 316 aa  85.9  9e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000575755  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1231  beta-lactamase domain protein  27.67 
 
 		 318 aa  85.1  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0606732 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1940  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 319 aa  85.1  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.386829  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4537  beta-lactamase domain protein  28.74 
 
 		 314 aa  84  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.630097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2893  beta-lactamase domain protein  28.34 
 
 		 271 aa  84  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  32.18 
 
 		 321 aa  83.6  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3186  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 271 aa  83.6  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4039  Beta-lactamase-like  27.07 
 
 		 337 aa  82  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1308  beta-lactamase domain-containing protein  25.1 
 
 		 246 aa  80.1  0.00000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 		 308 aa  79  0.00000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1577  beta-lactamase domain protein  31.79 
 
 		 272 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  25.63 
 
 		 438 aa  78.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  27.64 
 
 		 249 aa  78.6  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2501  beta-lactamase domain protein  28.51 
 
 		 322 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.541242 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2107  beta-lactamase domain protein  29.32 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  28.12 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1125  beta-lactamase domain protein  29.39 
 
 		 315 aa  75.1  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  29.18 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  31.36 
 
 		 317 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  28.74 
 
 		 312 aa  73.9  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  24.14 
 
 		 310 aa  70.9  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2612  beta-lactamase domain protein  32.35 
 
 		 342 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.584413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  30.51 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1178  beta-lactamase domain-containing protein  27.5 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  30.17 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  30.77 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1880  Beta-lactamase-like  21.74 
 
 		 367 aa  69.3  0.00000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000360179  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  29 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3115  hypothetical protein  29.9 
 
 		 351 aa  68.9  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25410  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  29.32 
 
 		 259 aa  68.9  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2035  beta-lactamase domain-containing protein  31.53 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0248  beta-lactamase domain-containing protein  23.85 
 
 		 246 aa  68.2  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11942  hypothetical protein  27.44 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4160  SoxH protein-like  27.4 
 
 		 312 aa  67.4  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.671969  normal  0.539982 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0666  beta-lactamase-like  27.39 
 
 		 329 aa  67  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257894  normal  0.323841 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  29.83 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0271  beta-lactamase domain protein  26.57 
 
 		 425 aa  66.2  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000349222  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2197  beta-lactamase domain-containing protein  25.63 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0276351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  27.38 
 
 		 318 aa  65.9  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6499  beta-lactamase domain protein  27.88 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.735445 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 321 aa  65.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3402  beta-lactamase domain-containing protein  30.3 
 
 		 243 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.433473  normal  0.430357 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>