More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2963 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2963  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 298 aa  613  9.999999999999999e-175  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.955909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0272  beta-lactamase domain protein  34.83 
 
 		 245 aa  168  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000021825  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1524  beta-lactamase domain-containing protein  36.09 
 
 		 243 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1485  beta-lactamase domain-containing protein  34.96 
 
 		 243 aa  159  4e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000168088  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2285  beta-lactamase-like  33.95 
 
 		 311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0817874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06040  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.93 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.692713 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1619  zinc-dependent hydrolase  37.08 
 
 		 261 aa  109  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1453  Beta-lactamase-like  35.07 
 
 		 241 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0660  beta-lactamase domain-containing protein  29.44 
 
 		 279 aa  96.7  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000276126  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17250  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.06 
 
 		 347 aa  90.5  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.733457 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2620  beta-lactamase domain-containing protein  27.23 
 
 		 253 aa  89  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46150  hypothetical protein  33.65 
 
 		 242 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.217943 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2843  beta-lactamase-like protein  37.01 
 
 		 247 aa  87.4  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3924  hypothetical protein  32.85 
 
 		 242 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1793  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 243 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4871  beta-lactamase domain protein  28.82 
 
 		 240 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.936336  normal  0.586773 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0438  hypothetical protein  31.28 
 
 		 328 aa  80.9  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000571233  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1929  beta-lactamase domain-containing protein  29.39 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.298264 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  30.19 
 
 		 324 aa  77.8  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000197877 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  38.51 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3186  beta-lactamase domain-containing protein  31.58 
 
 		 271 aa  71.6  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2556  beta-lactamase domain-containing protein  29.03 
 
 		 323 aa  71.6  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  30.14 
 
 		 310 aa  68.9  0.00000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4704  beta-lactamase domain protein  28.91 
 
 		 325 aa  68.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4825  beta-lactamase-like  26.24 
 
 		 354 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.601465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1013  beta-lactamase domain protein  28.1 
 
 		 322 aa  66.6  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.151542  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1372  beta-lactamase domain protein  30.84 
 
 		 328 aa  66.6  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  0.529651 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2893  beta-lactamase domain protein  29 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0050  Beta-lactamase-like  30.8 
 
 		 334 aa  65.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2059  beta-lactamase domain protein  26.15 
 
 		 350 aa  65.1  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000271524  normal  0.300872 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4562  Beta-lactamase-like  26.07 
 
 		 354 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.809352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0839  beta-lactamase-like  25.79 
 
 		 354 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.228122 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0066  beta-lactamase domain protein  31.3 
 
 		 334 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391302  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2879  AMP-dependent synthetase and ligase  30.97 
 
 		 862 aa  64.7  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0775  beta-lactamase-like  27.71 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0054  beta-lactamase domain protein  31.17 
 
 		 334 aa  63.5  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  32 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  27.69 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0051  beta-lactamase domain-containing protein  30.04 
 
 		 334 aa  62.4  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1031  beta-lactamase domain protein  28.71 
 
 		 323 aa  62.8  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210455  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  33.03 
 
 		 231 aa  62  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  32.43 
 
 		 206 aa  62  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0923  beta-lactamase domain protein  25.34 
 
 		 354 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526967  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0614  beta-lactamase-like  29.69 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.381863  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0754  beta-lactamase-like  27.87 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1902  beta-lactamase domain-containing protein  28.26 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.392348  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1782  Metallo-beta-lactamase  26.87 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0505  metallo-beta-lactamase family protein  30.04 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0068  metallo-beta-lactamase superfamily protein  33.08 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0554126  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0508  metallo-beta-lactamase family protein  30.04 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  37.23 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  28.35 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4398  quinolone signal response protein  29.49 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.635712  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  31.62 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.88 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.88 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.88 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.88 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.88 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2635  beta-lactamase domain protein  28.04 
 
 		 349 aa  59.3  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  31.62 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  31.62 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1661  beta-lactamase domain protein  32.84 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  31.62 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  32.9 
 
 		 299 aa  58.9  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  30.88 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  31.62 
 
 		 215 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25370  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  28.43 
 
 		 207 aa  58.5  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.555955 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  31.62 
 
 		 215 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2578  beta-lactamase domain protein  28.45 
 
 		 340 aa  58.9  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1736  beta-lactamase domain protein  30.56 
 
 		 198 aa  58.5  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1004  beta-lactamase domain-containing protein  31.08 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.217464 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4296  beta-lactamase-like  27.64 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0804764  normal  0.0768999 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5067  beta-lactamase domain protein  26.11 
 
 		 212 aa  58.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.533186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  31.62 
 
 		 215 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  33.55 
 
 		 214 aa  58.9  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1662  beta-lactamase domain protein  31.65 
 
 		 212 aa  58.9  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  29.81 
 
 		 327 aa  58.9  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0521141 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  29.56 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3260  beta-lactamase domain-containing protein  29.81 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0864  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase superfamily protein  25.79 
 
 		 352 aa  57.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  25.63 
 
 		 342 aa  58.2  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3024  beta-lactamase domain protein  27.13 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0101087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  27.33 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  27.33 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  29.74 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0253  metallo-beta-lactamase family protein  27.24 
 
 		 365 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.921693 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  30.88 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3058  beta-lactamase-like  26.52 
 
 		 329 aa  57.4  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0031  beta-lactamase domain-containing protein  32.33 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.789051  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  27.64 
 
 		 201 aa  57  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  30.32 
 
 		 209 aa  57  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1879  beta-lactamase domain-containing protein  28.51 
 
 		 322 aa  57  0.0000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1653  beta-lactamase domain-containing protein  35.26 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.139658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2141  Beta-lactamase-like  27.93 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0194  beta-lactamase domain-containing protein  30.37 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.00000000306881 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11930  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.15 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.985203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  30.86 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2600  beta-lactamase domain-containing protein  28.05 
 
 		 345 aa  56.6  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  29.75 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>