More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2556 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2556  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 323 aa  675    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  42.37 
 
 		 324 aa  298  1e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000197877 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0438  hypothetical protein  41.49 
 
 		 328 aa  270  2.9999999999999997e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000571233  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4704  beta-lactamase domain protein  36.89 
 
 		 325 aa  249  3e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1031  beta-lactamase domain protein  39.3 
 
 		 323 aa  238  6.999999999999999e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210455  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1013  beta-lactamase domain protein  38.79 
 
 		 322 aa  230  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.151542  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2879  AMP-dependent synthetase and ligase  33.02 
 
 		 862 aa  191  2e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1372  beta-lactamase domain protein  31.87 
 
 		 328 aa  181  1e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  0.529651 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2059  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 350 aa  178  1e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000271524  normal  0.300872 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  34.11 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2457  beta-lactamase domain-containing protein  33.64 
 
 		 327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130811  normal  0.600713 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2650  beta-lactamase domain-containing protein  32.2 
 
 		 324 aa  164  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05440  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  29.5 
 
 		 352 aa  161  2e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.853516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8278  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  29.88 
 
 		 348 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11930  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  27.71 
 
 		 354 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.985203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1439  beta-lactamase domain protein  28.87 
 
 		 329 aa  155  7e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000967067  normal  0.166741 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2888  beta-lactamase domain-containing protein  28.27 
 
 		 368 aa  155  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0158  beta-lactamase domain-containing protein  34.98 
 
 		 314 aa  152  7e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.625085 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3655  beta-lactamase domain protein  30.84 
 
 		 332 aa  152  8e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114597  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8202  beta-lactamase domain-containing protein  32 
 
 		 339 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1879  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 322 aa  150  2e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1728  beta-lactamase domain protein  31.4 
 
 		 324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  31.9 
 
 		 363 aa  143  4e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2131  beta-lactamase domain protein  29.97 
 
 		 337 aa  143  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0784  beta-lactamase domain protein  34.25 
 
 		 354 aa  143  5e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1745  beta-lactamase-like protein  31.19 
 
 		 335 aa  142  7e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.931232  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1004  beta-lactamase domain-containing protein  32.81 
 
 		 320 aa  136  5e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.217464 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08650  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  29.56 
 
 		 346 aa  130  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.637388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1440  beta-lactamase domain-containing protein  29.53 
 
 		 331 aa  129  5.0000000000000004e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.482344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3993  beta-lactamase domain-containing protein  30.79 
 
 		 321 aa  129  7.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582662 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2834  beta-lactamase domain protein  29.18 
 
 		 324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1152  beta-lactamase domain-containing protein  29.84 
 
 		 321 aa  127  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  hitchhiker  0.0056375 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0428  beta-lactamase domain-containing protein  30.24 
 
 		 366 aa  127  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3988  beta-lactamase domain protein  28.44 
 
 		 351 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4516  beta-lactamase domain-containing protein  27 
 
 		 346 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2708  beta-lactamase domain protein  29.43 
 
 		 325 aa  119  9e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0967231  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0310  beta-lactamase-like  27.03 
 
 		 348 aa  107  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1079  beta-lactamase domain protein  27.3 
 
 		 332 aa  107  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0383209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01454  metallo-beta-lactamase family protein  28.83 
 
 		 343 aa  105  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0050  Beta-lactamase-like  26.88 
 
 		 334 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4113  beta-lactamase domain protein  25.84 
 
 		 355 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.011437  normal  0.053603 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5264  beta-lactamase-like  25.47 
 
 		 353 aa  101  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0054  beta-lactamase domain protein  25.31 
 
 		 334 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0923  beta-lactamase domain protein  27.06 
 
 		 354 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526967  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2141  Beta-lactamase-like  27.93 
 
 		 354 aa  97.8  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1322  beta-lactamase domain protein  27.3 
 
 		 329 aa  98.2  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1528  beta-lactamase-like protein  27.36 
 
 		 331 aa  97.8  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0999562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0368  beta-lactamase-like protein  26.28 
 
 		 374 aa  97.1  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.967784  normal  0.392052 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0066  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 334 aa  97.1  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391302  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2272  beta-lactamase domain protein  26.58 
 
 		 324 aa  96.3  7e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3798  beta-lactamase domain protein  26.28 
 
 		 324 aa  96.3  7e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.273419  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4526  beta-lactamase domain protein  28.87 
 
 		 307 aa  96.3  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00779806  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3328  beta-lactamase domain protein  26.28 
 
 		 330 aa  94.7  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0103  Beta-lactamase-like  28.95 
 
 		 341 aa  94.7  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0051  beta-lactamase domain-containing protein  25.91 
 
 		 334 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0680  beta-lactamase domain-containing protein  26.79 
 
 		 365 aa  94.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0468  beta-lactamase domain protein  26.88 
 
 		 348 aa  94.4  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00306027  normal  0.41592 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4562  Beta-lactamase-like  25.46 
 
 		 354 aa  93.2  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.809352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4274  Beta-lactamase-like  27.44 
 
 		 357 aa  92  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2629  Beta-lactamase-like  26.19 
 
 		 342 aa  92  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0839  beta-lactamase-like  26.23 
 
 		 354 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.228122 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0991  hypothetical protein  25.08 
 
 		 317 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2417  beta-lactamase domain-containing protein  25.15 
 
 		 371 aa  90.9  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4932  beta-lactamase domain-containing protein  27.33 
 
 		 335 aa  90.5  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0281  hypothetical protein  25.67 
 
 		 359 aa  90.1  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.18209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0390  beta-lactamase domain protein  30.12 
 
 		 318 aa  90.5  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3968  beta-lactamase domain-containing protein  24.7 
 
 		 317 aa  90.5  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0386675  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4200  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 		 363 aa  89.7  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000948581 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4206  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  24.77 
 
 		 317 aa  89  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0729  beta-lactamase domain protein  28.48 
 
 		 344 aa  89  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3882  Zn-dependent hydrolase  25.08 
 
 		 317 aa  88.2  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2123  beta-lactamase domain-containing protein  26.84 
 
 		 369 aa  87.8  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.747407  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4825  beta-lactamase-like  24.09 
 
 		 354 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.601465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4269  hypothetical protein  24.77 
 
 		 317 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4245  hypothetical protein  24.77 
 
 		 317 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3370  hypothetical protein  26.38 
 
 		 362 aa  87.4  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0139  beta-lactamase domain protein  25.97 
 
 		 359 aa  87.4  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.486193  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3890  zinc metallohydrolase  24.77 
 
 		 317 aa  87  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.489775  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0253  metallo-beta-lactamase family protein  24.84 
 
 		 365 aa  87  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.921693 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4159  hypothetical protein  24.77 
 
 		 317 aa  87  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5569  beta-lactamase domain-containing protein  25.98 
 
 		 363 aa  86.7  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0506555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0352  beta-lactamase domain protein  25.16 
 
 		 323 aa  86.3  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2600  beta-lactamase domain-containing protein  24.54 
 
 		 345 aa  85.9  8e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2578  beta-lactamase domain protein  25.86 
 
 		 340 aa  85.5  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0131  beta-lactamase domain protein  25.36 
 
 		 359 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2974  beta-lactamase domain-containing protein  27.03 
 
 		 384 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2837  beta-lactamase domain-containing protein  27.46 
 
 		 358 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.9285 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0864  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase superfamily protein  25.68 
 
 		 352 aa  84  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0380  beta-lactamase domain-containing protein  27.33 
 
 		 359 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.335712 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4822  beta-lactamase domain-containing protein  24.85 
 
 		 357 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.405979  normal  0.833796 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3844  beta-lactamase-like  24.85 
 
 		 366 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2832  beta-lactamase domain-containing protein  24.62 
 
 		 317 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.422682  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4736  cyclic nucleotide-binding protein  24.32 
 
 		 359 aa  82  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3173  beta-lactamase domain protein  26.79 
 
 		 344 aa  82.4  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1982  beta-lactamase domain-containing protein  26.22 
 
 		 361 aa  80.9  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0400  metallo-beta-lactamase family protein  26.9 
 
 		 359 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0101  beta-lactamase-like protein  24.93 
 
 		 359 aa  79.7  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2311  beta-lactamase-like  26.74 
 
 		 359 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2925  beta-lactamase domain-containing protein  26.74 
 
 		 359 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0433  beta-lactamase domain-containing protein  23.58 
 
 		 340 aa  79.3  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0151814  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>