More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0775 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0775  beta-lactamase-like  100 
 
 
302 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0692  beta-lactamase domain-containing protein  66.11 
 
 
316 aa  423  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0505  metallo-beta-lactamase family protein  65.78 
 
 
301 aa  408  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0508  metallo-beta-lactamase family protein  65.78 
 
 
306 aa  408  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0552  beta-lactamase domain-containing protein  65.1 
 
 
302 aa  395  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.893963 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0725  beta-lactamase domain protein  62.96 
 
 
303 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.264304  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0671  beta-lactamase domain protein  63.05 
 
 
302 aa  384  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.461585  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4394  beta-lactamase domain protein  54.61 
 
 
304 aa  310  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1163  Beta-lactamase-like  52.92 
 
 
310 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0506017  normal  0.1623 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2470  beta-lactamase domain-containing protein  54.17 
 
 
305 aa  307  1.0000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00708378 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2731  beta-lactamase domain-containing protein  55.59 
 
 
307 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.146298 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0613  beta-lactamase-like  52.1 
 
 
305 aa  296  2e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0754  beta-lactamase-like  54.35 
 
 
315 aa  296  4e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1265  beta-lactamase-like  51.75 
 
 
310 aa  295  6e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.581191  normal  0.66012 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1127  metallo-beta-lactamase superfamily protein  56.43 
 
 
285 aa  295  6e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1285  beta-lactamase domain protein  52.13 
 
 
310 aa  294  1e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2452  putative Beta-lactamase  50.85 
 
 
304 aa  294  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3024  beta-lactamase domain protein  54.3 
 
 
310 aa  293  3e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0101087  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2901  beta-lactamase domain-containing protein  53.95 
 
 
310 aa  290  2e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.605946  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3127  beta-lactamase domain protein  53.61 
 
 
310 aa  290  3e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.257865  normal  0.300589 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4296  beta-lactamase-like  51.42 
 
 
308 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0804764  normal  0.0768999 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5004  beta-lactamase domain-containing protein  53.26 
 
 
317 aa  285  5e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331086  normal  0.0887437 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0801  beta-lactamase domain-containing protein  48.12 
 
 
301 aa  280  2e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451978  normal  0.510072 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0953  beta-lactamase domain-containing protein  48.43 
 
 
308 aa  271  1e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0361  beta-lactamase-like protein  50.17 
 
 
306 aa  266  2e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1084  beta-lactamase domain protein  47.86 
 
 
302 aa  249  3e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1316  beta-lactamase domain-containing protein  45.89 
 
 
297 aa  249  4e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.078247  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0859  beta-lactamase domain-containing protein  47 
 
 
304 aa  247  2e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4714  beta-lactamase domain-containing protein  49.43 
 
 
312 aa  244  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644544  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0086  beta-lactamase-like  46.81 
 
 
311 aa  243  3e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1837  beta-lactamase domain-containing protein  46.6 
 
 
303 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1441  beta-lactamase domain-containing protein  46.42 
 
 
313 aa  230  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.610229  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1480  beta-lactamase-like  42.42 
 
 
307 aa  221  9e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.245912  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0204  metallo-beta-lactamase family protein  46.6 
 
 
303 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2717  beta-lactamase domain-containing protein  43.75 
 
 
278 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1920  hypothetical protein  39.72 
 
 
301 aa  192  8e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000181581  hitchhiker  0.000000000000329346 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1832  beta-lactamase-like  42.37 
 
 
294 aa  189  7e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.930975  normal  0.178967 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1772  beta-lactamase domain-containing protein  42.55 
 
 
288 aa  181  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.32284 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3305  beta-lactamase domain protein  39.71 
 
 
282 aa  176  4e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0149024  normal  0.0144108 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4249  NUDIX hydrolase:Beta-lactamase-like  39.1 
 
 
566 aa  169  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1452  beta-lactamase domain-containing protein  39.29 
 
 
556 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.463729  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1644  beta-lactamase-like protein  37.28 
 
 
566 aa  155  8e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.162683  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3801  beta-lactamase domain-containing protein  36.27 
 
 
545 aa  155  9e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3441  beta-lactamase domain-containing protein  39.65 
 
 
544 aa  155  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3001  beta-lactamase domain protein  39.36 
 
 
568 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3691  beta-lactamase domain-containing protein  39.01 
 
 
568 aa  150  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.781768  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1055  beta-lactamase-like  39.56 
 
 
550 aa  146  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.128997 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0203  beta-lactamase domain-containing protein  37.5 
 
 
263 aa  145  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0208476  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1888  beta-lactamase domain-containing protein  38.38 
 
 
559 aa  143  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.378711 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0874  beta-lactamase domain protein  37.05 
 
 
557 aa  142  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0793  beta-lactamase domain-containing protein  39.35 
 
 
556 aa  142  5e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.541294  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0467  metallo-beta-lactamase family protein  37.6 
 
 
262 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.56187 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3446  beta-lactamase-like  36.01 
 
 
562 aa  137  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13708  hydrolase  35.27 
 
 
264 aa  126  5e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0451158 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0116  putative hydrolase  33.95 
 
 
284 aa  122  9e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4851  beta-lactamase domain protein  32.98 
 
 
296 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4749  beta-lactamase domain protein  34.71 
 
 
288 aa  119  9e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8910  beta-lactamase domain protein  33.46 
 
 
264 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5314  beta-lactamase domain protein  33.84 
 
 
268 aa  114  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.498114 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2528  beta-lactamase domain-containing protein  36.26 
 
 
260 aa  112  7.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00565773  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1889  beta-lactamase domain protein  31.47 
 
 
286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1541  beta-lactamase domain protein  34.33 
 
 
267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.485434 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2265  beta-lactamase domain protein  33.46 
 
 
275 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000365974 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1997  beta-lactamase domain-containing protein  32.68 
 
 
268 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4236  Beta-lactamase-like  35.71 
 
 
500 aa  109  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0248  beta-lactamase domain protein  33.22 
 
 
266 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5436  beta-lactamase domain-containing protein  33.22 
 
 
257 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.538479 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1854  beta-lactamase domain protein  31.5 
 
 
272 aa  105  8e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189866  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0330  beta-lactamase domain-containing protein  34.42 
 
 
259 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478372  normal  0.100644 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0504  beta-lactamase domain protein  32.51 
 
 
267 aa  104  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0630883  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1370  beta-lactamase domain-containing protein  32.95 
 
 
257 aa  104  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.157662 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3933  beta-lactamase domain protein  32.16 
 
 
276 aa  102  7e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.997989  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5206  beta-lactamase domain-containing protein  30.94 
 
 
259 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000287947 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26240  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  35.57 
 
 
273 aa  101  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.810697  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4819  beta-lactamase-like protein  30.94 
 
 
259 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4905  beta-lactamase domain-containing protein  30.94 
 
 
259 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.38972 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25410  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.29 
 
 
259 aa  100  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19280  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  34.51 
 
 
271 aa  101  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4392  beta-lactamase domain protein  34.74 
 
 
497 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0338  beta-lactamase domain-containing protein  35.79 
 
 
255 aa  100  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4788  beta-lactamase domain-containing protein  35.52 
 
 
275 aa  99  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440018 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4369  beta-lactamase domain protein  34.74 
 
 
497 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4385  beta-lactamase domain-containing protein  35.43 
 
 
484 aa  97.1  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.113297 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0716  beta-lactamase domain protein  35.98 
 
 
270 aa  96.3  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0641  beta-lactamase domain protein  31.33 
 
 
290 aa  95.5  9e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.117018  normal  0.604387 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05524  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12940)  27.84 
 
 
291 aa  93.2  5e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1303  beta-lactamase domain protein  29.92 
 
 
262 aa  91.3  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2833  beta-lactamase domain protein  28 
 
 
277 aa  90.5  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.705023  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1063  beta-lactamase domain-containing protein  29.89 
 
 
255 aa  88.6  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3208  beta-lactamase domain protein  30.86 
 
 
258 aa  87  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.229767  normal  0.168477 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36150  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.91 
 
 
258 aa  87  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4347  beta-lactamase domain-containing protein  32.56 
 
 
275 aa  85.9  9e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4284  beta-lactamase-like  31.06 
 
 
289 aa  85.1  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1276  beta-lactamase domain protein  31.92 
 
 
290 aa  82.4  0.000000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0675547  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0512  beta-lactamase domain protein  29.87 
 
 
315 aa  82  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10245  predicted protein  26.32 
 
 
285 aa  81.3  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00334407  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08650  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  26.54 
 
 
346 aa  78.2  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.637388  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1469  beta-lactamase domain-containing protein  27.76 
 
 
321 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00149  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14570)  25.78 
 
 
307 aa  77  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4516  beta-lactamase domain-containing protein  28.25 
 
 
346 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>