More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4296 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4296  beta-lactamase-like  100 
 
 		 308 aa  629  1e-179  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0804764  normal  0.0768999 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1163  Beta-lactamase-like  80.79 
 
 		 310 aa  511  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0506017  normal  0.1623 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1285  beta-lactamase domain protein  78.06 
 
 		 310 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2452  putative Beta-lactamase  80.4 
 
 		 304 aa  500  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1265  beta-lactamase-like  77.96 
 
 		 310 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.581191  normal  0.66012 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0754  beta-lactamase-like  77.56 
 
 		 315 aa  471  1e-132  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0613  beta-lactamase-like  74.43 
 
 		 305 aa  467  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2470  beta-lactamase domain-containing protein  55.92 
 
 		 305 aa  332  4e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708378 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4394  beta-lactamase domain protein  55.08 
 
 		 304 aa  328  6e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2731  beta-lactamase domain-containing protein  56.49 
 
 		 307 aa  326  3e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.146298 
 
 
-
 
NC_004310  BR0505  metallo-beta-lactamase family protein  54.21 
 
 		 301 aa  318  1e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0508  metallo-beta-lactamase family protein  54.21 
 
 		 306 aa  318  1e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0692  beta-lactamase domain-containing protein  53.74 
 
 		 316 aa  315  7e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0801  beta-lactamase domain-containing protein  50.5 
 
 		 301 aa  305  5.0000000000000004e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451978  normal  0.510072 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0552  beta-lactamase domain-containing protein  52.19 
 
 		 302 aa  305  6e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.893963 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0671  beta-lactamase domain protein  52.86 
 
 		 302 aa  300  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.461585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3024  beta-lactamase domain protein  54.8 
 
 		 310 aa  300  3e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0101087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0725  beta-lactamase domain protein  51.77 
 
 		 303 aa  296  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.264304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2901  beta-lactamase domain-containing protein  54.45 
 
 		 310 aa  295  8e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.605946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3127  beta-lactamase domain protein  54.09 
 
 		 310 aa  294  2e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.257865  normal  0.300589 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0775  beta-lactamase-like  51.42 
 
 		 302 aa  288  1e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5004  beta-lactamase domain-containing protein  49.5 
 
 		 317 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331086  normal  0.0887437 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1084  beta-lactamase domain protein  47.37 
 
 		 302 aa  271  1e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1316  beta-lactamase domain-containing protein  47.32 
 
 		 297 aa  270  2.9999999999999997e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.078247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0953  beta-lactamase domain-containing protein  46.37 
 
 		 308 aa  261  1e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0361  beta-lactamase-like protein  46.58 
 
 		 306 aa  255  6e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1127  metallo-beta-lactamase superfamily protein  50.55 
 
 		 285 aa  248  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4714  beta-lactamase domain-containing protein  45.33 
 
 		 312 aa  248  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0859  beta-lactamase domain-containing protein  44.85 
 
 		 304 aa  244  9.999999999999999e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1441  beta-lactamase domain-containing protein  45.08 
 
 		 313 aa  229  5e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.610229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0086  beta-lactamase-like  46.04 
 
 		 311 aa  227  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1837  beta-lactamase domain-containing protein  47.29 
 
 		 303 aa  225  7e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0204  metallo-beta-lactamase family protein  47.65 
 
 		 303 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1832  beta-lactamase-like  46.76 
 
 		 294 aa  214  1.9999999999999998e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.930975  normal  0.178967 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1480  beta-lactamase-like  40.83 
 
 		 307 aa  208  8e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.245912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1920  hypothetical protein  43.12 
 
 		 301 aa  195  9e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000181581  hitchhiker  0.000000000000329346 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1772  beta-lactamase domain-containing protein  44.16 
 
 		 288 aa  194  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.32284 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2717  beta-lactamase domain-containing protein  39.01 
 
 		 278 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4249  NUDIX hydrolase:Beta-lactamase-like  39.34 
 
 		 566 aa  156  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1644  beta-lactamase-like protein  37.37 
 
 		 566 aa  151  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.162683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3305  beta-lactamase domain protein  38.17 
 
 		 282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0149024  normal  0.0144108 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3801  beta-lactamase domain-containing protein  33.83 
 
 		 545 aa  145  6e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1452  beta-lactamase domain-containing protein  37.59 
 
 		 556 aa  138  8.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.463729  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0203  beta-lactamase domain-containing protein  33.84 
 
 		 263 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0208476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0793  beta-lactamase domain-containing protein  36.75 
 
 		 556 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.541294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8910  beta-lactamase domain protein  34.28 
 
 		 264 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4749  beta-lactamase domain protein  34.3 
 
 		 288 aa  124  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3001  beta-lactamase domain protein  34.27 
 
 		 568 aa  124  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3691  beta-lactamase domain-containing protein  34.27 
 
 		 568 aa  123  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.781768  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0467  metallo-beta-lactamase family protein  34.35 
 
 		 262 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.56187 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3441  beta-lactamase domain-containing protein  33.1 
 
 		 544 aa  119  6e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1888  beta-lactamase domain-containing protein  32.73 
 
 		 559 aa  116  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.378711 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0874  beta-lactamase domain protein  32.18 
 
 		 557 aa  113  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0116  putative hydrolase  31.25 
 
 		 284 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4819  beta-lactamase-like protein  29.23 
 
 		 259 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4905  beta-lactamase domain-containing protein  29.23 
 
 		 259 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.38972 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13708  hydrolase  31.5 
 
 		 264 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0451158 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10245  predicted protein  31.07 
 
 		 285 aa  109  6e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00334407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5206  beta-lactamase domain-containing protein  28.85 
 
 		 259 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000287947 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05524  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12940)  27.97 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1997  beta-lactamase domain-containing protein  30.89 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2265  beta-lactamase domain protein  32.33 
 
 		 275 aa  107  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000365974 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1370  beta-lactamase domain-containing protein  30.77 
 
 		 257 aa  106  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.157662 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4788  beta-lactamase domain-containing protein  31.34 
 
 		 275 aa  105  7e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440018 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5314  beta-lactamase domain protein  29.85 
 
 		 268 aa  105  9e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.498114 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3446  beta-lactamase-like  29.9 
 
 		 562 aa  104  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0716  beta-lactamase domain protein  34.47 
 
 		 270 aa  104  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2528  beta-lactamase domain-containing protein  32.32 
 
 		 260 aa  104  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00565773  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1854  beta-lactamase domain protein  30.51 
 
 		 272 aa  103  4e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25410  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.4 
 
 		 259 aa  103  5e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1055  beta-lactamase-like  31.07 
 
 		 550 aa  102  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.128997 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0330  beta-lactamase domain-containing protein  32.96 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478372  normal  0.100644 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0248  beta-lactamase domain protein  31.87 
 
 		 266 aa  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1276  beta-lactamase domain protein  32.57 
 
 		 290 aa  100  3e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0675547  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5436  beta-lactamase domain-containing protein  29.23 
 
 		 257 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538479 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0504  beta-lactamase domain protein  30.47 
 
 		 267 aa  99.8  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0630883  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1541  beta-lactamase domain protein  32.31 
 
 		 267 aa  99.8  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.485434 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3208  beta-lactamase domain protein  29.64 
 
 		 258 aa  99  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.229767  normal  0.168477 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2833  beta-lactamase domain protein  28.91 
 
 		 277 aa  98.6  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.705023  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4347  beta-lactamase domain-containing protein  32.49 
 
 		 275 aa  98.2  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0338  beta-lactamase domain-containing protein  33.82 
 
 		 255 aa  97.8  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1889  beta-lactamase domain protein  29.63 
 
 		 286 aa  97.4  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3933  beta-lactamase domain protein  29.09 
 
 		 276 aa  96.7  5e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.997989  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4851  beta-lactamase domain protein  29.89 
 
 		 296 aa  96.3  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19280  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  29.96 
 
 		 271 aa  89.4  7e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36150  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.22 
 
 		 258 aa  85.9  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0641  beta-lactamase domain protein  29.93 
 
 		 290 aa  85.9  7e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.117018  normal  0.604387 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06001  metallo-beta-lactamase domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G00120)  28.95 
 
 		 309 aa  85.9  9e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.355889  normal  0.401572 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4284  beta-lactamase-like  29.79 
 
 		 289 aa  85.1  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07070  conserved hypothetical protein  29.86 
 
 		 340 aa  83.6  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0787298 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0512  beta-lactamase domain protein  29.67 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00149  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14570)  29.31 
 
 		 307 aa  77  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4704  beta-lactamase domain protein  26.03 
 
 		 325 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1063  beta-lactamase domain-containing protein  28.68 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1303  beta-lactamase domain protein  26.88 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1661  beta-lactamase domain protein  31.56 
 
 		 241 aa  72.8  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2059  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 350 aa  72  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000271524  normal  0.300872 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4385  beta-lactamase domain-containing protein  30.77 
 
 		 484 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.113297 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  30.46 
 
 		 205 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4516  beta-lactamase domain-containing protein  28.08 
 
 		 346 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>