More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1285 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1285  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 310 aa  630  1e-179  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1163  Beta-lactamase-like  85.11 
 
 		 310 aa  548  1e-155  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0506017  normal  0.1623 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1265  beta-lactamase-like  86.41 
 
 		 310 aa  548  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.581191  normal  0.66012 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4296  beta-lactamase-like  78.06 
 
 		 308 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0804764  normal  0.0768999 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2452  putative Beta-lactamase  78.67 
 
 		 304 aa  487  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0613  beta-lactamase-like  72.49 
 
 		 305 aa  460  9.999999999999999e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0754  beta-lactamase-like  74.68 
 
 		 315 aa  460  9.999999999999999e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2470  beta-lactamase domain-containing protein  55.74 
 
 		 305 aa  341  7e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708378 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4394  beta-lactamase domain protein  54.69 
 
 		 304 aa  330  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2731  beta-lactamase domain-containing protein  54.87 
 
 		 307 aa  324  1e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.146298 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0692  beta-lactamase domain-containing protein  53.4 
 
 		 316 aa  316  4e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0801  beta-lactamase domain-containing protein  51.66 
 
 		 301 aa  315  6e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451978  normal  0.510072 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0508  metallo-beta-lactamase family protein  52.53 
 
 		 306 aa  312  3.9999999999999997e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0505  metallo-beta-lactamase family protein  52.53 
 
 		 301 aa  312  4.999999999999999e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0552  beta-lactamase domain-containing protein  52.03 
 
 		 302 aa  310  1e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.893963 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3024  beta-lactamase domain protein  53.47 
 
 		 310 aa  308  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0101087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2901  beta-lactamase domain-containing protein  53.47 
 
 		 310 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.605946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0671  beta-lactamase domain protein  51.99 
 
 		 302 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.461585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3127  beta-lactamase domain protein  53.12 
 
 		 310 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.257865  normal  0.300589 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0725  beta-lactamase domain protein  50.33 
 
 		 303 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.264304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0775  beta-lactamase-like  52.13 
 
 		 302 aa  294  1e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1084  beta-lactamase domain protein  50.16 
 
 		 302 aa  293  3e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5004  beta-lactamase domain-containing protein  51.23 
 
 		 317 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331086  normal  0.0887437 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1316  beta-lactamase domain-containing protein  48.49 
 
 		 297 aa  280  1e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.078247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0953  beta-lactamase domain-containing protein  45.33 
 
 		 308 aa  258  1e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0859  beta-lactamase domain-containing protein  44.52 
 
 		 304 aa  254  2.0000000000000002e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0361  beta-lactamase-like protein  46.71 
 
 		 306 aa  252  7e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1127  metallo-beta-lactamase superfamily protein  48.74 
 
 		 285 aa  251  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4714  beta-lactamase domain-containing protein  45.99 
 
 		 312 aa  241  7.999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0086  beta-lactamase-like  46.26 
 
 		 311 aa  231  1e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1480  beta-lactamase-like  40.45 
 
 		 307 aa  223  3e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.245912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1837  beta-lactamase domain-containing protein  44.01 
 
 		 303 aa  219  5e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1441  beta-lactamase domain-containing protein  43.05 
 
 		 313 aa  217  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.610229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1832  beta-lactamase-like  46.07 
 
 		 294 aa  214  1.9999999999999998e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.930975  normal  0.178967 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0204  metallo-beta-lactamase family protein  44.01 
 
 		 303 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1920  hypothetical protein  41.05 
 
 		 301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000181581  hitchhiker  0.000000000000329346 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1772  beta-lactamase domain-containing protein  40.28 
 
 		 288 aa  191  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.32284 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2717  beta-lactamase domain-containing protein  38.3 
 
 		 278 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4249  NUDIX hydrolase:Beta-lactamase-like  37.72 
 
 		 566 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1452  beta-lactamase domain-containing protein  39.56 
 
 		 556 aa  156  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.463729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3305  beta-lactamase domain protein  39.69 
 
 		 282 aa  155  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0149024  normal  0.0144108 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1644  beta-lactamase-like protein  36.52 
 
 		 566 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.162683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0793  beta-lactamase domain-containing protein  39.71 
 
 		 556 aa  142  7e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.541294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3001  beta-lactamase domain protein  37.37 
 
 		 568 aa  138  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3691  beta-lactamase domain-containing protein  37.37 
 
 		 568 aa  137  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.781768  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3801  beta-lactamase domain-containing protein  32.34 
 
 		 545 aa  136  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0203  beta-lactamase domain-containing protein  34.1 
 
 		 263 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0208476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3441  beta-lactamase domain-containing protein  34.78 
 
 		 544 aa  125  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1888  beta-lactamase domain-containing protein  35.38 
 
 		 559 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.378711 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0874  beta-lactamase domain protein  33.93 
 
 		 557 aa  123  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4749  beta-lactamase domain protein  32.75 
 
 		 288 aa  120  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8910  beta-lactamase domain protein  33.21 
 
 		 264 aa  119  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1055  beta-lactamase-like  33.7 
 
 		 550 aa  117  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.128997 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0467  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 		 262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.56187 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13708  hydrolase  33.08 
 
 		 264 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0451158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4819  beta-lactamase-like protein  31.8 
 
 		 259 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4905  beta-lactamase domain-containing protein  31.8 
 
 		 259 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.38972 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5206  beta-lactamase domain-containing protein  31.8 
 
 		 259 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000287947 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0116  putative hydrolase  32.13 
 
 		 284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3446  beta-lactamase-like  32.97 
 
 		 562 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0248  beta-lactamase domain protein  34.31 
 
 		 266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0716  beta-lactamase domain protein  34.85 
 
 		 270 aa  112  8.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1370  beta-lactamase domain-containing protein  31.54 
 
 		 257 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.157662 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2265  beta-lactamase domain protein  33.08 
 
 		 275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000365974 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5436  beta-lactamase domain-containing protein  32.57 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538479 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0504  beta-lactamase domain protein  31.9 
 
 		 267 aa  110  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0630883  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4788  beta-lactamase domain-containing protein  31.91 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440018 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5314  beta-lactamase domain protein  31.34 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.498114 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2528  beta-lactamase domain-containing protein  33.58 
 
 		 260 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00565773  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05524  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12940)  30.13 
 
 		 291 aa  106  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3933  beta-lactamase domain protein  31.12 
 
 		 276 aa  106  6e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.997989  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25410  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.86 
 
 		 259 aa  105  8e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3208  beta-lactamase domain protein  31.62 
 
 		 258 aa  104  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.229767  normal  0.168477 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10245  predicted protein  29.64 
 
 		 285 aa  103  3e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00334407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1541  beta-lactamase domain protein  31.25 
 
 		 267 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.485434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0330  beta-lactamase domain-containing protein  32.96 
 
 		 259 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478372  normal  0.100644 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1997  beta-lactamase domain-containing protein  29.46 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1854  beta-lactamase domain protein  30.15 
 
 		 272 aa  100  3e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1889  beta-lactamase domain protein  28.52 
 
 		 286 aa  99.4  7e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1276  beta-lactamase domain protein  30.88 
 
 		 290 aa  97.8  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0675547  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4347  beta-lactamase domain-containing protein  32.16 
 
 		 275 aa  95.9  8e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2833  beta-lactamase domain protein  29.84 
 
 		 277 aa  93.6  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.705023  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4851  beta-lactamase domain protein  30.15 
 
 		 296 aa  92.8  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19280  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  33.19 
 
 		 271 aa  91.7  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4284  beta-lactamase-like  30.82 
 
 		 289 aa  90.1  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06001  metallo-beta-lactamase domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G00120)  29 
 
 		 309 aa  86.7  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.355889  normal  0.401572 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1063  beta-lactamase domain-containing protein  30.62 
 
 		 255 aa  85.9  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0641  beta-lactamase domain protein  28.33 
 
 		 290 aa  84.3  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.117018  normal  0.604387 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0338  beta-lactamase domain-containing protein  31.64 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07070  conserved hypothetical protein  28.63 
 
 		 340 aa  82  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0787298 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36150  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  29.54 
 
 		 258 aa  79.7  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0512  beta-lactamase domain protein  26.6 
 
 		 315 aa  79  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4385  beta-lactamase domain-containing protein  28.11 
 
 		 484 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.113297 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1303  beta-lactamase domain protein  28.74 
 
 		 262 aa  75.9  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00149  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14570)  28.99 
 
 		 307 aa  75.1  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  30.58 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4236  Beta-lactamase-like  28.62 
 
 		 500 aa  73.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26240  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.6 
 
 		 273 aa  73.2  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.810697  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3268  Beta-lactamase-like  30.37 
 
 		 216 aa  72  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0425  beta-lactamase domain protein  28.74 
 
 		 253 aa  71.2  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.246435 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>