More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0552 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0552  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 302 aa  609  1e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.893963 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0725  beta-lactamase domain protein  69.21 
 
 		 303 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.264304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0671  beta-lactamase domain protein  69.77 
 
 		 302 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.461585  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0505  metallo-beta-lactamase family protein  65.42 
 
 		 301 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0508  metallo-beta-lactamase family protein  65.08 
 
 		 306 aa  405  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0692  beta-lactamase domain-containing protein  63.61 
 
 		 316 aa  402  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0775  beta-lactamase-like  65.1 
 
 		 302 aa  395  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1127  metallo-beta-lactamase superfamily protein  60 
 
 		 285 aa  322  3e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2470  beta-lactamase domain-containing protein  56.06 
 
 		 305 aa  320  1.9999999999999998e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708378 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2731  beta-lactamase domain-containing protein  55.85 
 
 		 307 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.146298 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1163  Beta-lactamase-like  52.19 
 
 		 310 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0506017  normal  0.1623 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4394  beta-lactamase domain protein  56.01 
 
 		 304 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3127  beta-lactamase domain protein  54.33 
 
 		 310 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.257865  normal  0.300589 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3024  beta-lactamase domain protein  54.67 
 
 		 310 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0101087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1285  beta-lactamase domain protein  52.03 
 
 		 310 aa  310  1e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2901  beta-lactamase domain-containing protein  54.33 
 
 		 310 aa  311  1e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.605946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2452  putative Beta-lactamase  52.36 
 
 		 304 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1265  beta-lactamase-like  51.85 
 
 		 310 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.581191  normal  0.66012 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4296  beta-lactamase-like  52.19 
 
 		 308 aa  305  6e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0804764  normal  0.0768999 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0613  beta-lactamase-like  52.19 
 
 		 305 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5004  beta-lactamase domain-containing protein  54.03 
 
 		 317 aa  300  3e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331086  normal  0.0887437 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0801  beta-lactamase domain-containing protein  49.32 
 
 		 301 aa  298  8e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451978  normal  0.510072 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0754  beta-lactamase-like  53.07 
 
 		 315 aa  298  9e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0953  beta-lactamase domain-containing protein  47.93 
 
 		 308 aa  277  2e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1084  beta-lactamase domain protein  51.43 
 
 		 302 aa  275  6e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1316  beta-lactamase domain-containing protein  47.32 
 
 		 297 aa  266  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.078247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0361  beta-lactamase-like protein  47.02 
 
 		 306 aa  256  3e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0859  beta-lactamase domain-containing protein  45.57 
 
 		 304 aa  253  4.0000000000000004e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0086  beta-lactamase-like  46.15 
 
 		 311 aa  238  1e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4714  beta-lactamase domain-containing protein  46.1 
 
 		 312 aa  237  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1441  beta-lactamase domain-containing protein  45.12 
 
 		 313 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.610229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1480  beta-lactamase-like  41.89 
 
 		 307 aa  231  9e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.245912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1837  beta-lactamase domain-containing protein  44.44 
 
 		 303 aa  226  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0204  metallo-beta-lactamase family protein  44.44 
 
 		 303 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1772  beta-lactamase domain-containing protein  43.66 
 
 		 288 aa  208  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.32284 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2717  beta-lactamase domain-containing protein  40.2 
 
 		 278 aa  196  3e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1832  beta-lactamase-like  42.61 
 
 		 294 aa  194  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.930975  normal  0.178967 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1920  hypothetical protein  39.02 
 
 		 301 aa  187  3e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000181581  hitchhiker  0.000000000000329346 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3305  beta-lactamase domain protein  40.22 
 
 		 282 aa  182  5.0000000000000004e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0149024  normal  0.0144108 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4249  NUDIX hydrolase:Beta-lactamase-like  39.58 
 
 		 566 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1644  beta-lactamase-like protein  39.72 
 
 		 566 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.162683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3801  beta-lactamase domain-containing protein  37.73 
 
 		 545 aa  159  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1452  beta-lactamase domain-containing protein  38.21 
 
 		 556 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.463729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3441  beta-lactamase domain-containing protein  36.84 
 
 		 544 aa  147  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0793  beta-lactamase domain-containing protein  36.68 
 
 		 556 aa  145  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.541294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3001  beta-lactamase domain protein  36.4 
 
 		 568 aa  142  7e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3691  beta-lactamase domain-containing protein  36.04 
 
 		 568 aa  140  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.781768  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1541  beta-lactamase domain protein  36.84 
 
 		 267 aa  138  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.485434 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0874  beta-lactamase domain protein  36.79 
 
 		 557 aa  134  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1055  beta-lactamase-like  34.92 
 
 		 550 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.128997 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0467  metallo-beta-lactamase family protein  33.6 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.56187 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1888  beta-lactamase domain-containing protein  35 
 
 		 559 aa  127  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.378711 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3446  beta-lactamase-like  33.92 
 
 		 562 aa  126  5e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0203  beta-lactamase domain-containing protein  30.8 
 
 		 263 aa  125  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0208476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0116  putative hydrolase  31.85 
 
 		 284 aa  124  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5206  beta-lactamase domain-containing protein  32.42 
 
 		 259 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000287947 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13708  hydrolase  32.97 
 
 		 264 aa  123  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0451158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4819  beta-lactamase-like protein  32.42 
 
 		 259 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4905  beta-lactamase domain-containing protein  32.42 
 
 		 259 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.38972 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4749  beta-lactamase domain protein  34.31 
 
 		 288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5314  beta-lactamase domain protein  31.48 
 
 		 268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.498114 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8910  beta-lactamase domain protein  32.85 
 
 		 264 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4851  beta-lactamase domain protein  30.83 
 
 		 296 aa  112  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1854  beta-lactamase domain protein  28.77 
 
 		 272 aa  109  6e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1370  beta-lactamase domain-containing protein  31.29 
 
 		 257 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.157662 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2265  beta-lactamase domain protein  32.97 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000365974 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2528  beta-lactamase domain-containing protein  32.31 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00565773  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5436  beta-lactamase domain-containing protein  29.79 
 
 		 257 aa  106  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538479 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1997  beta-lactamase domain-containing protein  30.11 
 
 		 268 aa  105  9e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4788  beta-lactamase domain-containing protein  31.27 
 
 		 275 aa  103  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440018 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1889  beta-lactamase domain protein  30.11 
 
 		 286 aa  102  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0330  beta-lactamase domain-containing protein  33.58 
 
 		 259 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478372  normal  0.100644 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3933  beta-lactamase domain protein  30.91 
 
 		 276 aa  98.2  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.997989  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3208  beta-lactamase domain protein  31.35 
 
 		 258 aa  97.8  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.229767  normal  0.168477 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1276  beta-lactamase domain protein  31.82 
 
 		 290 aa  97.1  3e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0675547  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0641  beta-lactamase domain protein  32.19 
 
 		 290 aa  96.7  5e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.117018  normal  0.604387 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0504  beta-lactamase domain protein  27.92 
 
 		 267 aa  96.3  5e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0630883  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25410  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.25 
 
 		 259 aa  96.7  5e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0248  beta-lactamase domain protein  31.94 
 
 		 266 aa  96.3  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19280  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.9 
 
 		 271 aa  95.9  8e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4347  beta-lactamase domain-containing protein  31.58 
 
 		 275 aa  94.7  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0338  beta-lactamase domain-containing protein  34.32 
 
 		 255 aa  91.7  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0716  beta-lactamase domain protein  31.97 
 
 		 270 aa  90.9  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05524  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12940)  25.94 
 
 		 291 aa  90.1  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4236  Beta-lactamase-like  32.17 
 
 		 500 aa  89.4  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1303  beta-lactamase domain protein  26.59 
 
 		 262 aa  87.4  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1063  beta-lactamase domain-containing protein  29.73 
 
 		 255 aa  87.4  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0512  beta-lactamase domain protein  29.02 
 
 		 315 aa  87  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4369  beta-lactamase domain protein  32.56 
 
 		 497 aa  87  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2833  beta-lactamase domain protein  26.51 
 
 		 277 aa  87.4  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.705023  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4392  beta-lactamase domain protein  31.78 
 
 		 497 aa  87  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4516  beta-lactamase domain-containing protein  29.18 
 
 		 346 aa  85.9  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0425  beta-lactamase domain protein  31.64 
 
 		 253 aa  84  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4284  beta-lactamase-like  30.69 
 
 		 289 aa  79.3  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10245  predicted protein  25.95 
 
 		 285 aa  79.7  0.00000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00334407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26240  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.69 
 
 		 273 aa  78.6  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.810697  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06001  metallo-beta-lactamase domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G00120)  25.89 
 
 		 309 aa  75.1  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.355889  normal  0.401572 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36150  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  29.79 
 
 		 258 aa  74.3  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  33.66 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  30.45 
 
 		 363 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>