More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1163 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1163  Beta-lactamase-like  100 
 
 		 310 aa  630  1e-180  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0506017  normal  0.1623 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1265  beta-lactamase-like  89.35 
 
 		 310 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.581191  normal  0.66012 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1285  beta-lactamase domain protein  85.11 
 
 		 310 aa  548  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4296  beta-lactamase-like  80.79 
 
 		 308 aa  511  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0804764  normal  0.0768999 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2452  putative Beta-lactamase  82.12 
 
 		 304 aa  513  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0754  beta-lactamase-like  76.64 
 
 		 315 aa  478  1e-134  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0613  beta-lactamase-like  74.83 
 
 		 305 aa  473  1e-132  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2470  beta-lactamase domain-containing protein  55.12 
 
 		 305 aa  334  9e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708378 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4394  beta-lactamase domain protein  54.97 
 
 		 304 aa  330  1e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0692  beta-lactamase domain-containing protein  54.82 
 
 		 316 aa  324  1e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0801  beta-lactamase domain-containing protein  52.65 
 
 		 301 aa  319  3e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451978  normal  0.510072 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2731  beta-lactamase domain-containing protein  55.05 
 
 		 307 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.146298 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0508  metallo-beta-lactamase family protein  51.97 
 
 		 306 aa  318  6e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0505  metallo-beta-lactamase family protein  52.53 
 
 		 301 aa  318  7e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3024  beta-lactamase domain protein  53.2 
 
 		 310 aa  318  9e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0101087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0725  beta-lactamase domain protein  52.49 
 
 		 303 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.264304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0552  beta-lactamase domain-containing protein  52.19 
 
 		 302 aa  314  9.999999999999999e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.893963 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0775  beta-lactamase-like  52.92 
 
 		 302 aa  310  2e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0671  beta-lactamase domain protein  52.36 
 
 		 302 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.461585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2901  beta-lactamase domain-containing protein  50.97 
 
 		 310 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.605946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3127  beta-lactamase domain protein  50.65 
 
 		 310 aa  306  3e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.257865  normal  0.300589 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1084  beta-lactamase domain protein  48.85 
 
 		 302 aa  291  1e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5004  beta-lactamase domain-containing protein  51.02 
 
 		 317 aa  290  2e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331086  normal  0.0887437 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1316  beta-lactamase domain-containing protein  47.49 
 
 		 297 aa  278  1e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.078247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1127  metallo-beta-lactamase superfamily protein  49.82 
 
 		 285 aa  256  4e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4714  beta-lactamase domain-containing protein  47.29 
 
 		 312 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0361  beta-lactamase-like protein  45.07 
 
 		 306 aa  251  8.000000000000001e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0859  beta-lactamase domain-containing protein  45.51 
 
 		 304 aa  249  3e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0953  beta-lactamase domain-containing protein  43.4 
 
 		 308 aa  249  5e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1837  beta-lactamase domain-containing protein  45.45 
 
 		 303 aa  233  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0086  beta-lactamase-like  43.88 
 
 		 311 aa  231  9e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0204  metallo-beta-lactamase family protein  45.45 
 
 		 303 aa  226  4e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1441  beta-lactamase domain-containing protein  44.56 
 
 		 313 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.610229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1480  beta-lactamase-like  40.07 
 
 		 307 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.245912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1832  beta-lactamase-like  45.32 
 
 		 294 aa  209  5e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.930975  normal  0.178967 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1920  hypothetical protein  40.48 
 
 		 301 aa  202  7e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000181581  hitchhiker  0.000000000000329346 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1772  beta-lactamase domain-containing protein  41.03 
 
 		 288 aa  193  3e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.32284 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2717  beta-lactamase domain-containing protein  39.93 
 
 		 278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4249  NUDIX hydrolase:Beta-lactamase-like  37.87 
 
 		 566 aa  155  9e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3305  beta-lactamase domain protein  39.69 
 
 		 282 aa  152  5.9999999999999996e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0149024  normal  0.0144108 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1452  beta-lactamase domain-containing protein  39.78 
 
 		 556 aa  151  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.463729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1644  beta-lactamase-like protein  36.65 
 
 		 566 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.162683  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0203  beta-lactamase domain-containing protein  36.02 
 
 		 263 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0208476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3001  beta-lactamase domain protein  36.33 
 
 		 568 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3691  beta-lactamase domain-containing protein  36.33 
 
 		 568 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.781768  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3801  beta-lactamase domain-containing protein  32.58 
 
 		 545 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0793  beta-lactamase domain-containing protein  37.18 
 
 		 556 aa  133  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.541294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3441  beta-lactamase domain-containing protein  35.02 
 
 		 544 aa  130  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8910  beta-lactamase domain protein  34.47 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13708  hydrolase  31.94 
 
 		 264 aa  125  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0451158 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1888  beta-lactamase domain-containing protein  35.4 
 
 		 559 aa  125  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.378711 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0116  putative hydrolase  33.09 
 
 		 284 aa  122  6e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4749  beta-lactamase domain protein  32.44 
 
 		 288 aa  122  6e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0467  metallo-beta-lactamase family protein  34.5 
 
 		 262 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.56187 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1370  beta-lactamase domain-containing protein  34.1 
 
 		 257 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.157662 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0874  beta-lactamase domain protein  33.21 
 
 		 557 aa  121  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1055  beta-lactamase-like  33.7 
 
 		 550 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.128997 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3446  beta-lactamase-like  32.13 
 
 		 562 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5206  beta-lactamase domain-containing protein  30.77 
 
 		 259 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000287947 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4819  beta-lactamase-like protein  30.77 
 
 		 259 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4905  beta-lactamase domain-containing protein  30.77 
 
 		 259 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.38972 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5436  beta-lactamase domain-containing protein  33.21 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538479 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1854  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189866  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5314  beta-lactamase domain protein  32.46 
 
 		 268 aa  114  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.498114 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0504  beta-lactamase domain protein  31.54 
 
 		 267 aa  113  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0630883  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2265  beta-lactamase domain protein  34.57 
 
 		 275 aa  113  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000365974 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0330  beta-lactamase domain-containing protein  34.83 
 
 		 259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478372  normal  0.100644 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05524  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12940)  29.83 
 
 		 291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1997  beta-lactamase domain-containing protein  31.01 
 
 		 268 aa  110  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1889  beta-lactamase domain protein  29.86 
 
 		 286 aa  109  7.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0248  beta-lactamase domain protein  33.58 
 
 		 266 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4788  beta-lactamase domain-containing protein  31.29 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440018 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2528  beta-lactamase domain-containing protein  32.83 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00565773  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25410  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  28.47 
 
 		 259 aa  107  3e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10245  predicted protein  30.71 
 
 		 285 aa  106  5e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00334407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0716  beta-lactamase domain protein  31.68 
 
 		 270 aa  104  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3208  beta-lactamase domain protein  31.23 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.229767  normal  0.168477 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1276  beta-lactamase domain protein  33.21 
 
 		 290 aa  100  2e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0675547  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3933  beta-lactamase domain protein  30.04 
 
 		 276 aa  100  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.997989  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4347  beta-lactamase domain-containing protein  31.65 
 
 		 275 aa  100  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4284  beta-lactamase-like  31.33 
 
 		 289 aa  97.8  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2833  beta-lactamase domain protein  31.52 
 
 		 277 aa  95.9  7e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.705023  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19280  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.89 
 
 		 271 aa  94.4  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4851  beta-lactamase domain protein  28.41 
 
 		 296 aa  93.6  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06001  metallo-beta-lactamase domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G00120)  30.3 
 
 		 309 aa  92.8  7e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.355889  normal  0.401572 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1541  beta-lactamase domain protein  29.69 
 
 		 267 aa  92.4  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.485434 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1063  beta-lactamase domain-containing protein  31.78 
 
 		 255 aa  90.5  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0338  beta-lactamase domain-containing protein  32.97 
 
 		 255 aa  89  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0641  beta-lactamase domain protein  29.69 
 
 		 290 aa  87  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.117018  normal  0.604387 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07070  conserved hypothetical protein  28.45 
 
 		 340 aa  81.6  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0787298 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1303  beta-lactamase domain protein  30.47 
 
 		 262 aa  80.5  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00149  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14570)  28.51 
 
 		 307 aa  80.1  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36150  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.11 
 
 		 258 aa  80.1  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8278  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  29.34 
 
 		 348 aa  79.7  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0044  metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.22 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3822  metallo-beta-lactamase family protein  31.22 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2909  metallo-beta-lactamase family protein  31.22 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.457315  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2969  metallo-beta-lactamase family protein  31.22 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1632  metallo-beta-lactamase family protein  31.22 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3400  metallo-beta-lactamase family protein  31.22 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00696268  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>