More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2470 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2470  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
305 aa  605  9.999999999999999e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00708378 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4394  beta-lactamase domain protein  60.33 
 
 
304 aa  346  3e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0613  beta-lactamase-like  58.47 
 
 
305 aa  343  2e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1285  beta-lactamase domain protein  55.74 
 
 
310 aa  341  7e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0754  beta-lactamase-like  59.27 
 
 
315 aa  340  1e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2731  beta-lactamase domain-containing protein  59.74 
 
 
307 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.146298 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1163  Beta-lactamase-like  55.12 
 
 
310 aa  334  7.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0506017  normal  0.1623 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2452  putative Beta-lactamase  56.95 
 
 
304 aa  332  4e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4296  beta-lactamase-like  55.92 
 
 
308 aa  332  4e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0804764  normal  0.0768999 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0671  beta-lactamase domain protein  57.14 
 
 
302 aa  332  6e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.461585  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1265  beta-lactamase-like  54.79 
 
 
310 aa  329  3e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.581191  normal  0.66012 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0552  beta-lactamase domain-containing protein  56.06 
 
 
302 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.893963 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0725  beta-lactamase domain protein  53.47 
 
 
303 aa  316  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.264304  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2901  beta-lactamase domain-containing protein  57.68 
 
 
310 aa  311  7.999999999999999e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.605946  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3127  beta-lactamase domain protein  57.34 
 
 
310 aa  310  1e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.257865  normal  0.300589 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5004  beta-lactamase domain-containing protein  57.91 
 
 
317 aa  308  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331086  normal  0.0887437 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3024  beta-lactamase domain protein  56.21 
 
 
310 aa  308  9e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0101087  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0775  beta-lactamase-like  54.17 
 
 
302 aa  307  1.0000000000000001e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0692  beta-lactamase domain-containing protein  55.4 
 
 
316 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0505  metallo-beta-lactamase family protein  54.36 
 
 
301 aa  303  2.0000000000000002e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0508  metallo-beta-lactamase family protein  53.95 
 
 
306 aa  303  2.0000000000000002e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1084  beta-lactamase domain protein  51.16 
 
 
302 aa  295  9e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0801  beta-lactamase domain-containing protein  46.71 
 
 
301 aa  277  1e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451978  normal  0.510072 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0953  beta-lactamase domain-containing protein  48.29 
 
 
308 aa  276  3e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1316  beta-lactamase domain-containing protein  47.49 
 
 
297 aa  275  9e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.078247  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0859  beta-lactamase domain-containing protein  48.68 
 
 
304 aa  274  1.0000000000000001e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4714  beta-lactamase domain-containing protein  49.65 
 
 
312 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644544  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0361  beta-lactamase-like protein  50.34 
 
 
306 aa  267  2e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0086  beta-lactamase-like  48.75 
 
 
311 aa  244  9e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1127  metallo-beta-lactamase superfamily protein  49.26 
 
 
285 aa  240  2.9999999999999997e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1441  beta-lactamase domain-containing protein  49.28 
 
 
313 aa  230  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.610229  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1837  beta-lactamase domain-containing protein  46.81 
 
 
303 aa  229  3e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0204  metallo-beta-lactamase family protein  46.58 
 
 
303 aa  222  7e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1832  beta-lactamase-like  45.16 
 
 
294 aa  205  7e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.930975  normal  0.178967 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1480  beta-lactamase-like  41.64 
 
 
307 aa  202  7e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.245912  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1772  beta-lactamase domain-containing protein  41.88 
 
 
288 aa  193  3e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.32284 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1920  hypothetical protein  40.34 
 
 
301 aa  192  7e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000181581  hitchhiker  0.000000000000329346 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2717  beta-lactamase domain-containing protein  43.82 
 
 
278 aa  191  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3305  beta-lactamase domain protein  40.28 
 
 
282 aa  183  3e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0149024  normal  0.0144108 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4249  NUDIX hydrolase:Beta-lactamase-like  39.72 
 
 
566 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3801  beta-lactamase domain-containing protein  37.96 
 
 
545 aa  154  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1452  beta-lactamase domain-containing protein  38.29 
 
 
556 aa  152  5e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.463729  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1644  beta-lactamase-like protein  37.45 
 
 
566 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.162683  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3001  beta-lactamase domain protein  38.85 
 
 
568 aa  144  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3691  beta-lactamase domain-containing protein  38.57 
 
 
568 aa  143  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.781768  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3441  beta-lactamase domain-containing protein  36.36 
 
 
544 aa  142  7e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4749  beta-lactamase domain protein  36.62 
 
 
288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0793  beta-lactamase domain-containing protein  35.84 
 
 
556 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.541294  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0467  metallo-beta-lactamase family protein  34.62 
 
 
262 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.56187 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0874  beta-lactamase domain protein  35.1 
 
 
557 aa  130  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3446  beta-lactamase-like  33.45 
 
 
562 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0203  beta-lactamase domain-containing protein  32.09 
 
 
263 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0208476  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1055  beta-lactamase-like  33.09 
 
 
550 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.128997 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1541  beta-lactamase domain protein  35.69 
 
 
267 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.485434 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13708  hydrolase  32.48 
 
 
264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0451158 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1888  beta-lactamase domain-containing protein  36.14 
 
 
559 aa  119  7.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.378711 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10245  predicted protein  30.74 
 
 
285 aa  118  9.999999999999999e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00334407  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0248  beta-lactamase domain protein  35.03 
 
 
266 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4851  beta-lactamase domain protein  31.64 
 
 
296 aa  117  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8910  beta-lactamase domain protein  32.59 
 
 
264 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5206  beta-lactamase domain-containing protein  32.2 
 
 
259 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000287947 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4788  beta-lactamase domain-containing protein  33.69 
 
 
275 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440018 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4819  beta-lactamase-like protein  31.82 
 
 
259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4905  beta-lactamase domain-containing protein  31.82 
 
 
259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.38972 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25410  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  33.46 
 
 
259 aa  112  6e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2528  beta-lactamase domain-containing protein  34.31 
 
 
260 aa  109  7.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00565773  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0330  beta-lactamase domain-containing protein  32.97 
 
 
259 aa  108  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478372  normal  0.100644 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0116  putative hydrolase  29.41 
 
 
284 aa  108  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2265  beta-lactamase domain protein  30.94 
 
 
275 aa  106  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000365974 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5436  beta-lactamase domain-containing protein  30.11 
 
 
257 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.538479 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1997  beta-lactamase domain-containing protein  31.85 
 
 
268 aa  104  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1370  beta-lactamase domain-containing protein  29.66 
 
 
257 aa  103  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.157662 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3933  beta-lactamase domain protein  29.49 
 
 
276 aa  102  6e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.997989  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4284  beta-lactamase-like  31.15 
 
 
289 aa  100  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4347  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
275 aa  101  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3208  beta-lactamase domain protein  31.84 
 
 
258 aa  101  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.229767  normal  0.168477 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0716  beta-lactamase domain protein  34.43 
 
 
270 aa  99  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05524  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12940)  27.27 
 
 
291 aa  97.1  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1889  beta-lactamase domain protein  29.61 
 
 
286 aa  95.9  8e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0504  beta-lactamase domain protein  29.93 
 
 
267 aa  95.1  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0630883  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5314  beta-lactamase domain protein  27.64 
 
 
268 aa  94.7  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.498114 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1854  beta-lactamase domain protein  30.11 
 
 
272 aa  93.2  4e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189866  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06001  metallo-beta-lactamase domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G00120)  28.45 
 
 
309 aa  92.8  6e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.355889  normal  0.401572 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00149  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14570)  31.2 
 
 
307 aa  92.8  6e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19280  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.48 
 
 
271 aa  92.4  8e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4392  beta-lactamase domain protein  36.41 
 
 
497 aa  92.4  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26240  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.72 
 
 
273 aa  92  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.810697  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2833  beta-lactamase domain protein  29.96 
 
 
277 aa  91.7  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.705023  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4236  Beta-lactamase-like  33.73 
 
 
500 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4369  beta-lactamase domain protein  35.92 
 
 
497 aa  90.1  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1063  beta-lactamase domain-containing protein  31.06 
 
 
255 aa  89.4  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0338  beta-lactamase domain-containing protein  32.73 
 
 
255 aa  88.6  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1276  beta-lactamase domain protein  32.7 
 
 
290 aa  88.2  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0675547  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07070  conserved hypothetical protein  26.41 
 
 
340 aa  86.3  5e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0787298 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0425  beta-lactamase domain protein  30.27 
 
 
253 aa  86.3  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0512  beta-lactamase domain protein  29.77 
 
 
315 aa  85.9  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0641  beta-lactamase domain protein  32.34 
 
 
290 aa  81.6  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.117018  normal  0.604387 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1303  beta-lactamase domain protein  29.57 
 
 
262 aa  80.5  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36150  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  29.71 
 
 
258 aa  79.3  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4516  beta-lactamase domain-containing protein  28.17 
 
 
346 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>