More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0641 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0641  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 290 aa  560  1e-158  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.117018  normal  0.604387 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2833  beta-lactamase domain protein  50.35 
 
 		 277 aa  229  5e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.705023  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1303  beta-lactamase domain protein  50.18 
 
 		 262 aa  218  1e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3208  beta-lactamase domain protein  48.88 
 
 		 258 aa  210  2e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.229767  normal  0.168477 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1084  beta-lactamase domain protein  30.66 
 
 		 302 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4249  NUDIX hydrolase:Beta-lactamase-like  29.63 
 
 		 566 aa  103  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0512  beta-lactamase domain protein  32.62 
 
 		 315 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1316  beta-lactamase domain-containing protein  32.76 
 
 		 297 aa  100  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.078247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2717  beta-lactamase domain-containing protein  33.8 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4749  beta-lactamase domain protein  35.54 
 
 		 288 aa  100  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0775  beta-lactamase-like  31.33 
 
 		 302 aa  98.2  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0953  beta-lactamase domain-containing protein  28.45 
 
 		 308 aa  97.1  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4236  Beta-lactamase-like  35.36 
 
 		 500 aa  96.7  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0725  beta-lactamase domain protein  29.55 
 
 		 303 aa  96.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.264304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0552  beta-lactamase domain-containing protein  32.19 
 
 		 302 aa  96.3  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.893963 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0361  beta-lactamase-like protein  32.19 
 
 		 306 aa  96.3  5e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0859  beta-lactamase domain-containing protein  28.99 
 
 		 304 aa  95.5  9e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1854  beta-lactamase domain protein  34.08 
 
 		 272 aa  95.5  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0613  beta-lactamase-like  31.21 
 
 		 305 aa  94.4  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1889  beta-lactamase domain protein  31.64 
 
 		 286 aa  94.7  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0801  beta-lactamase domain-containing protein  29.61 
 
 		 301 aa  94.4  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451978  normal  0.510072 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0754  beta-lactamase-like  30.77 
 
 		 315 aa  93.6  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1265  beta-lactamase-like  29.69 
 
 		 310 aa  92.4  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.581191  normal  0.66012 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4369  beta-lactamase domain protein  34.6 
 
 		 497 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0671  beta-lactamase domain protein  29.71 
 
 		 302 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.461585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1644  beta-lactamase-like protein  30.94 
 
 		 566 aa  91.3  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.162683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1480  beta-lactamase-like  27.51 
 
 		 307 aa  91.3  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.245912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4394  beta-lactamase domain protein  31.78 
 
 		 304 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1541  beta-lactamase domain protein  32.55 
 
 		 267 aa  90.1  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.485434 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4392  beta-lactamase domain protein  33.84 
 
 		 497 aa  89.7  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2452  putative Beta-lactamase  28.97 
 
 		 304 aa  89.4  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3024  beta-lactamase domain protein  31.76 
 
 		 310 aa  89  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0101087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1163  Beta-lactamase-like  30.38 
 
 		 310 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0506017  normal  0.1623 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2901  beta-lactamase domain-containing protein  31.47 
 
 		 310 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.605946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1285  beta-lactamase domain protein  29.39 
 
 		 310 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4296  beta-lactamase-like  30.61 
 
 		 308 aa  86.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0804764  normal  0.0768999 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1997  beta-lactamase domain-containing protein  33.04 
 
 		 268 aa  86.3  5e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3801  beta-lactamase domain-containing protein  29.78 
 
 		 545 aa  86.3  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3127  beta-lactamase domain protein  30.4 
 
 		 310 aa  86.3  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.257865  normal  0.300589 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4851  beta-lactamase domain protein  31.84 
 
 		 296 aa  85.9  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2731  beta-lactamase domain-containing protein  32.89 
 
 		 307 aa  85.9  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.146298 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4385  beta-lactamase domain-containing protein  34.47 
 
 		 484 aa  85.9  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.113297 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5314  beta-lactamase domain protein  34.98 
 
 		 268 aa  85.1  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.498114 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3305  beta-lactamase domain protein  29.64 
 
 		 282 aa  84.7  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0149024  normal  0.0144108 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25410  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  35.27 
 
 		 259 aa  82.8  0.000000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1832  beta-lactamase-like  29.59 
 
 		 294 aa  82.8  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.930975  normal  0.178967 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1441  beta-lactamase domain-containing protein  28.62 
 
 		 313 aa  82.4  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.610229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5004  beta-lactamase domain-containing protein  31.78 
 
 		 317 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331086  normal  0.0887437 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2470  beta-lactamase domain-containing protein  32.34 
 
 		 305 aa  81.6  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708378 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0086  beta-lactamase-like  29.02 
 
 		 311 aa  80.5  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1837  beta-lactamase domain-containing protein  28.52 
 
 		 303 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0467  metallo-beta-lactamase family protein  33.18 
 
 		 262 aa  79.7  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.56187 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0204  metallo-beta-lactamase family protein  28.52 
 
 		 303 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1127  metallo-beta-lactamase superfamily protein  32.92 
 
 		 285 aa  79.3  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1772  beta-lactamase domain-containing protein  29.89 
 
 		 288 aa  79  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.32284 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5436  beta-lactamase domain-containing protein  29.44 
 
 		 257 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538479 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0203  beta-lactamase domain-containing protein  33.64 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0208476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19280  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  37.61 
 
 		 271 aa  75.9  0.0000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1063  beta-lactamase domain-containing protein  31.03 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0692  beta-lactamase domain-containing protein  27.47 
 
 		 316 aa  75.1  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4714  beta-lactamase domain-containing protein  30.11 
 
 		 312 aa  75.1  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4284  beta-lactamase-like  34.25 
 
 		 289 aa  73.6  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10245  predicted protein  28.06 
 
 		 285 aa  73.6  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00334407  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3933  beta-lactamase domain protein  32.77 
 
 		 276 aa  73.6  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.997989  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0505  metallo-beta-lactamase family protein  27.21 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1370  beta-lactamase domain-containing protein  28.97 
 
 		 257 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.157662 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0508  metallo-beta-lactamase family protein  27.21 
 
 		 306 aa  72.4  0.000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3001  beta-lactamase domain protein  27.6 
 
 		 568 aa  72  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2528  beta-lactamase domain-containing protein  29.17 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00565773  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3691  beta-lactamase domain-containing protein  27.6 
 
 		 568 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.781768  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0116  putative hydrolase  32.14 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4788  beta-lactamase domain-containing protein  30.08 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440018 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3441  beta-lactamase domain-containing protein  28.62 
 
 		 544 aa  70.9  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05524  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12940)  27.88 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0468  beta-lactamase domain protein  30.22 
 
 		 348 aa  70.1  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00306027  normal  0.41592 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1920  hypothetical protein  29 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000181581  hitchhiker  0.000000000000329346 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0463  beta-lactamase domain protein  31.61 
 
 		 192 aa  68.6  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00512512  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0248  beta-lactamase domain protein  32.56 
 
 		 266 aa  68.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2513  beta-lactamase domain protein  31.63 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4347  beta-lactamase domain-containing protein  31.86 
 
 		 275 aa  67  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0874  beta-lactamase domain protein  29.17 
 
 		 557 aa  67  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  31.1 
 
 		 480 aa  66.6  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2265  beta-lactamase domain protein  29.25 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000365974 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8910  beta-lactamase domain protein  33.49 
 
 		 264 aa  65.5  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1452  beta-lactamase domain-containing protein  28.32 
 
 		 556 aa  65.5  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.463729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3798  beta-lactamase domain protein  27.86 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.273419  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0716  beta-lactamase domain protein  34.86 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  20.82 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1322  beta-lactamase domain protein  28.25 
 
 		 329 aa  62.8  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4819  beta-lactamase-like protein  27.78 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4905  beta-lactamase domain-containing protein  27.78 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.38972 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0504  beta-lactamase domain protein  30.56 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0630883  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3993  beta-lactamase domain-containing protein  26.39 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582662 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1888  beta-lactamase domain-containing protein  26.92 
 
 		 559 aa  61.6  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.378711 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5206  beta-lactamase domain-containing protein  27.31 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000287947 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3014  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.309827  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  23.83 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0793  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 556 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.541294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13708  hydrolase  27.57 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0451158 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0199  diphthine synthase  27.23 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000243979  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>