More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3993 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3993  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
321 aa  653    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000582662 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1152  beta-lactamase domain-containing protein  82.76 
 
 
321 aa  549  1e-155  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  hitchhiker  0.0056375 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1439  beta-lactamase domain protein  48.53 
 
 
329 aa  268  8.999999999999999e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000967067  normal  0.166741 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2834  beta-lactamase domain protein  41.69 
 
 
324 aa  255  7e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2650  beta-lactamase domain-containing protein  42.86 
 
 
324 aa  246  4e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1745  beta-lactamase-like protein  44.73 
 
 
335 aa  229  5e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.931232  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1728  beta-lactamase domain protein  39.47 
 
 
324 aa  181  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4825  beta-lactamase-like  35.85 
 
 
354 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.601465  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0839  beta-lactamase-like  33.95 
 
 
354 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.228122 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4562  Beta-lactamase-like  33.44 
 
 
354 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.809352  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0103  Beta-lactamase-like  34.16 
 
 
341 aa  165  8e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0923  beta-lactamase domain protein  32.81 
 
 
354 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526967  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1528  beta-lactamase-like protein  33.23 
 
 
331 aa  161  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0999562  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1440  beta-lactamase domain-containing protein  32.3 
 
 
331 aa  161  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.482344  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4736  cyclic nucleotide-binding protein  35 
 
 
359 aa  161  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2629  Beta-lactamase-like  32.69 
 
 
342 aa  159  7e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3844  beta-lactamase-like  34.06 
 
 
366 aa  157  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0864  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase superfamily protein  32.51 
 
 
352 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4822  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
357 aa  157  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.405979  normal  0.833796 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0729  beta-lactamase domain protein  33.12 
 
 
344 aa  155  6e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1982  beta-lactamase domain-containing protein  32.42 
 
 
361 aa  151  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0310  beta-lactamase-like  33.44 
 
 
348 aa  151  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0139  beta-lactamase domain protein  32.82 
 
 
359 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.486193  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2417  beta-lactamase domain-containing protein  31.27 
 
 
371 aa  150  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146205  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0131  beta-lactamase domain protein  32.82 
 
 
359 aa  149  5e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0281  hypothetical protein  32.21 
 
 
359 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.18209  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5264  beta-lactamase-like  33.96 
 
 
353 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01454  metallo-beta-lactamase family protein  30.31 
 
 
343 aa  146  4.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0347  metallo-beta-lactamase family protein  32.1 
 
 
326 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607947  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0093  metallo-beta-lactamase family protein  31.52 
 
 
383 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2635  beta-lactamase domain protein  31.89 
 
 
349 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3089  metallo-beta-lactamase family protein  31.52 
 
 
359 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3370  hypothetical protein  32.73 
 
 
362 aa  144  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2007  metallo-beta-lactamase family protein  31.52 
 
 
359 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0420  metallo-beta-lactamase family protein  31.52 
 
 
359 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611131  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2281  metallo-beta-lactamase family protein  31.52 
 
 
359 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.858667  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0400  metallo-beta-lactamase family protein  31.52 
 
 
359 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4516  beta-lactamase domain-containing protein  34.85 
 
 
346 aa  142  8e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0132  Beta-lactamase-like  32.33 
 
 
358 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0582  metallo-beta-lactamase family protein  31.6 
 
 
331 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4193  beta-lactamase-like  29.81 
 
 
394 aa  140  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0101  beta-lactamase-like protein  30.29 
 
 
359 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3086  metallo-beta-lactamase family protein  29.94 
 
 
349 aa  139  6e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.825394  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5569  beta-lactamase domain-containing protein  30.43 
 
 
363 aa  138  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0506555  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  29.47 
 
 
324 aa  138  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000197877 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2974  beta-lactamase domain-containing protein  31.12 
 
 
384 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2837  beta-lactamase domain-containing protein  31.12 
 
 
358 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.9285 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0182  beta-lactamase domain-containing protein  30.4 
 
 
356 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4932  beta-lactamase domain-containing protein  30.65 
 
 
335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6268  Beta-lactamase-like  30.61 
 
 
359 aa  134  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2123  beta-lactamase domain-containing protein  30.77 
 
 
369 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.747407  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2311  beta-lactamase-like  30.91 
 
 
359 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2925  beta-lactamase domain-containing protein  30.91 
 
 
359 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0465  beta-lactamase domain protein  30.98 
 
 
357 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0380  beta-lactamase domain-containing protein  30.3 
 
 
359 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.335712 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2940  beta-lactamase domain-containing protein  30.3 
 
 
359 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.571743 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0777  beta-lactamase domain-containing protein  30.16 
 
 
352 aa  130  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.493847  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4251  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  30.98 
 
 
357 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.342604  normal  0.241726 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3058  beta-lactamase-like  28.88 
 
 
329 aa  129  7.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2556  beta-lactamase domain-containing protein  30.79 
 
 
323 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  26.67 
 
 
310 aa  129  8.000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3893  beta-lactamase-like  29.11 
 
 
349 aa  128  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.042904 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4274  Beta-lactamase-like  28.75 
 
 
357 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4704  beta-lactamase domain protein  30.36 
 
 
325 aa  126  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0741  putative metallo-beta-lactamase family protein  30 
 
 
344 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.844995  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2461  beta-lactamase domain-containing protein  28.7 
 
 
344 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.889355 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2397  beta-lactamase domain-containing protein  29.7 
 
 
344 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.21584  normal  0.814785 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4200  beta-lactamase domain-containing protein  33.13 
 
 
363 aa  122  6e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000948581 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2888  beta-lactamase domain-containing protein  32.39 
 
 
368 aa  122  8e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0433  beta-lactamase domain-containing protein  28.3 
 
 
340 aa  122  9e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0151814  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0680  beta-lactamase domain-containing protein  29.38 
 
 
365 aa  121  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8278  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  30.16 
 
 
348 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2141  Beta-lactamase-like  29.02 
 
 
354 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0253  metallo-beta-lactamase family protein  28.7 
 
 
365 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.921693 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2059  beta-lactamase domain protein  30.89 
 
 
350 aa  120  3.9999999999999996e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000271524  normal  0.300872 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4113  beta-lactamase domain protein  29.06 
 
 
355 aa  119  6e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.011437  normal  0.053603 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0050  Beta-lactamase-like  30.91 
 
 
334 aa  119  9e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2457  beta-lactamase domain-containing protein  32.7 
 
 
327 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130811  normal  0.600713 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0438  hypothetical protein  28.94 
 
 
328 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000571233  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0066  beta-lactamase domain protein  30.18 
 
 
334 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391302  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4696  beta-lactamase domain-containing protein  29.31 
 
 
400 aa  116  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.750931  normal  0.0866563 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0051  beta-lactamase domain-containing protein  31.1 
 
 
334 aa  116  6e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0054  beta-lactamase domain protein  30.18 
 
 
334 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0158  beta-lactamase domain-containing protein  29.78 
 
 
314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.625085 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3968  beta-lactamase domain-containing protein  27.91 
 
 
317 aa  113  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0386675  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1004  beta-lactamase domain-containing protein  28.66 
 
 
320 aa  112  6e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.217464 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4269  hypothetical protein  28.53 
 
 
317 aa  112  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08650  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.21 
 
 
346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.637388  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4206  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  28.22 
 
 
317 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1031  beta-lactamase domain protein  28.35 
 
 
323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210455  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2272  beta-lactamase domain protein  28.53 
 
 
324 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2832  beta-lactamase domain-containing protein  28 
 
 
317 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.422682  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0991  hypothetical protein  27.91 
 
 
317 aa  110  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3890  zinc metallohydrolase  28.22 
 
 
317 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.489775  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4159  hypothetical protein  28.22 
 
 
317 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3882  Zn-dependent hydrolase  28.17 
 
 
317 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4245  hypothetical protein  27.91 
 
 
317 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8202  beta-lactamase domain-containing protein  28.88 
 
 
339 aa  108  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0368  beta-lactamase-like protein  30.09 
 
 
374 aa  108  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.967784  normal  0.392052 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0352  beta-lactamase domain protein  27.5 
 
 
323 aa  106  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>