More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8278 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8278  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  100 
 
 		 348 aa  685    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2888  beta-lactamase domain-containing protein  72.05 
 
 		 368 aa  500  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2457  beta-lactamase domain-containing protein  50.77 
 
 		 327 aa  308  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130811  normal  0.600713 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  46.95 
 
 		 363 aa  274  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3988  beta-lactamase domain protein  42.9 
 
 		 351 aa  266  4e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3655  beta-lactamase domain protein  45.85 
 
 		 332 aa  265  1e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114597  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8202  beta-lactamase domain-containing protein  45.77 
 
 		 339 aa  262  6.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2131  beta-lactamase domain protein  43.3 
 
 		 337 aa  231  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4516  beta-lactamase domain-containing protein  42.15 
 
 		 346 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  30.03 
 
 		 324 aa  182  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000197877 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1728  beta-lactamase domain protein  34.45 
 
 		 324 aa  163  4.0000000000000004e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0158  beta-lactamase domain-containing protein  35.91 
 
 		 314 aa  160  3e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.625085 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08650  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  37.38 
 
 		 346 aa  159  8e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.637388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2556  beta-lactamase domain-containing protein  29.88 
 
 		 323 aa  157  3e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1879  beta-lactamase domain-containing protein  33.13 
 
 		 322 aa  152  1e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2834  beta-lactamase domain protein  32.92 
 
 		 324 aa  151  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1440  beta-lactamase domain-containing protein  35.51 
 
 		 331 aa  151  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.482344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0438  hypothetical protein  29.34 
 
 		 328 aa  150  3e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000571233  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2708  beta-lactamase domain protein  29.85 
 
 		 325 aa  149  9e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0967231  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  27.41 
 
 		 310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4704  beta-lactamase domain protein  28.4 
 
 		 325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2650  beta-lactamase domain-containing protein  30.56 
 
 		 324 aa  141  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1004  beta-lactamase domain-containing protein  31.37 
 
 		 320 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.217464 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2059  beta-lactamase domain protein  32.15 
 
 		 350 aa  140  3.9999999999999997e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000271524  normal  0.300872 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0784  beta-lactamase domain protein  33.65 
 
 		 354 aa  138  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1745  beta-lactamase-like protein  34.02 
 
 		 335 aa  136  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.931232  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0428  beta-lactamase domain-containing protein  32.27 
 
 		 366 aa  137  4e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1031  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210455  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1152  beta-lactamase domain-containing protein  32.05 
 
 		 321 aa  132  7.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  hitchhiker  0.0056375 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1439  beta-lactamase domain protein  32.27 
 
 		 329 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000967067  normal  0.166741 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1013  beta-lactamase domain protein  27.63 
 
 		 322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.151542  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4113  beta-lactamase domain protein  31 
 
 		 355 aa  127  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.011437  normal  0.053603 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3993  beta-lactamase domain-containing protein  30.16 
 
 		 321 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582662 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0050  Beta-lactamase-like  32.19 
 
 		 334 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2879  AMP-dependent synthetase and ligase  30.95 
 
 		 862 aa  116  6.9999999999999995e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3798  beta-lactamase domain protein  31.03 
 
 		 324 aa  115  8.999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.273419  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1528  beta-lactamase-like protein  30.55 
 
 		 331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0999562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0777  beta-lactamase domain-containing protein  30.56 
 
 		 352 aa  111  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.493847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0066  beta-lactamase domain protein  30.31 
 
 		 334 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391302  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0054  beta-lactamase domain protein  30.31 
 
 		 334 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0051  beta-lactamase domain-containing protein  31.71 
 
 		 334 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5264  beta-lactamase-like  28.75 
 
 		 353 aa  109  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1079  beta-lactamase domain protein  29.86 
 
 		 332 aa  109  9.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0383209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4932  beta-lactamase domain-containing protein  31.6 
 
 		 335 aa  107  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2629  Beta-lactamase-like  31.82 
 
 		 342 aa  107  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0310  beta-lactamase-like  28.61 
 
 		 348 aa  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05440  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  27.49 
 
 		 352 aa  105  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.853516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1372  beta-lactamase domain protein  28.84 
 
 		 328 aa  103  4e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  0.529651 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0680  beta-lactamase domain-containing protein  31.61 
 
 		 365 aa  100  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2272  beta-lactamase domain protein  26.9 
 
 		 324 aa  100  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3168  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 337 aa  99.8  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00770543  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0352  beta-lactamase domain protein  26.5 
 
 		 323 aa  98.6  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2578  beta-lactamase domain protein  31.62 
 
 		 340 aa  99  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01454  metallo-beta-lactamase family protein  28.88 
 
 		 343 aa  95.5  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1322  beta-lactamase domain protein  33.2 
 
 		 329 aa  94  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11930  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  25.71 
 
 		 354 aa  94  4e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.985203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5569  beta-lactamase domain-containing protein  31.53 
 
 		 363 aa  93.6  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0506555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4696  beta-lactamase domain-containing protein  31.72 
 
 		 400 aa  93.2  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.750931  normal  0.0866563 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2123  beta-lactamase domain-containing protein  28.76 
 
 		 369 aa  92  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.747407  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0468  beta-lactamase domain protein  30.3 
 
 		 348 aa  90.5  4e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00306027  normal  0.41592 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1316  beta-lactamase domain-containing protein  29.27 
 
 		 297 aa  90.1  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.078247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3173  beta-lactamase domain protein  28.18 
 
 		 344 aa  88.6  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4274  Beta-lactamase-like  27.19 
 
 		 357 aa  89  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1928  beta-lactamase domain protein  28.08 
 
 		 315 aa  88.6  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3328  beta-lactamase domain protein  31.02 
 
 		 330 aa  88.6  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0923  beta-lactamase domain protein  26.44 
 
 		 354 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526967  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0390  beta-lactamase domain protein  28.05 
 
 		 318 aa  86.7  6e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2417  beta-lactamase domain-containing protein  30.08 
 
 		 371 aa  85.9  9e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4269  hypothetical protein  23.66 
 
 		 317 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0839  beta-lactamase-like  26.43 
 
 		 354 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.228122 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0864  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase superfamily protein  27.95 
 
 		 352 aa  85.1  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4206  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  25.19 
 
 		 317 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3882  Zn-dependent hydrolase  25.57 
 
 		 317 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4562  Beta-lactamase-like  26.81 
 
 		 354 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.809352  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3890  zinc metallohydrolase  26.49 
 
 		 317 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.489775  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1982  beta-lactamase domain-containing protein  28.08 
 
 		 361 aa  83.6  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4736  cyclic nucleotide-binding protein  28.98 
 
 		 359 aa  83.6  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4159  hypothetical protein  26.49 
 
 		 317 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0368  beta-lactamase-like protein  33.08 
 
 		 374 aa  82.8  0.000000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.967784  normal  0.392052 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4825  beta-lactamase-like  29.43 
 
 		 354 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.601465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5004  beta-lactamase domain-containing protein  32.08 
 
 		 317 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331086  normal  0.0887437 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0991  hypothetical protein  25.19 
 
 		 317 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3968  beta-lactamase domain-containing protein  25.67 
 
 		 317 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0386675  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2901  beta-lactamase domain-containing protein  32.39 
 
 		 310 aa  79.7  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.605946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1163  Beta-lactamase-like  29.34 
 
 		 310 aa  79.7  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0506017  normal  0.1623 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0741  putative metallo-beta-lactamase family protein  30.04 
 
 		 344 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.844995  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3127  beta-lactamase domain protein  31.34 
 
 		 310 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.257865  normal  0.300589 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2281  metallo-beta-lactamase family protein  29.89 
 
 		 359 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.858667  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0093  metallo-beta-lactamase family protein  29.89 
 
 		 383 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0420  metallo-beta-lactamase family protein  29.89 
 
 		 359 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611131  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4245  hypothetical protein  24.43 
 
 		 317 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3089  metallo-beta-lactamase family protein  29.89 
 
 		 359 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0400  metallo-beta-lactamase family protein  30.17 
 
 		 359 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2007  metallo-beta-lactamase family protein  29.89 
 
 		 359 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0347  metallo-beta-lactamase family protein  31.02 
 
 		 326 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607947  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1644  beta-lactamase-like protein  27.69 
 
 		 566 aa  77  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.162683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0101  beta-lactamase-like protein  29.12 
 
 		 359 aa  77  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2397  beta-lactamase domain-containing protein  29.67 
 
 		 344 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.21584  normal  0.814785 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2600  beta-lactamase domain-containing protein  25.61 
 
 		 345 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0103  Beta-lactamase-like  27.01 
 
 		 341 aa  76.6  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>