More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_05440 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_05440  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  100 
 
 		 352 aa  726    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.853516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1372  beta-lactamase domain protein  46.01 
 
 		 328 aa  304  1.0000000000000001e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  0.529651 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11930  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  43.17 
 
 		 354 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.985203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2879  AMP-dependent synthetase and ligase  33.93 
 
 		 862 aa  181  2e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2556  beta-lactamase domain-containing protein  29.5 
 
 		 323 aa  161  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0438  hypothetical protein  29.6 
 
 		 328 aa  160  3e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000571233  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  29.43 
 
 		 324 aa  153  5e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000197877 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1031  beta-lactamase domain protein  29.23 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210455  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  33.77 
 
 		 310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1013  beta-lactamase domain protein  27.18 
 
 		 322 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.151542  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4704  beta-lactamase domain protein  30.25 
 
 		 325 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2059  beta-lactamase domain protein  26.4 
 
 		 350 aa  110  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000271524  normal  0.300872 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2888  beta-lactamase domain-containing protein  27.36 
 
 		 368 aa  108  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8278  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  27.49 
 
 		 348 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2834  beta-lactamase domain protein  25.23 
 
 		 324 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3655  beta-lactamase domain protein  24.84 
 
 		 332 aa  99.8  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114597  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4113  beta-lactamase domain protein  25.6 
 
 		 355 aa  97.1  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.011437  normal  0.053603 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0310  beta-lactamase-like  26.79 
 
 		 348 aa  95.9  9e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1439  beta-lactamase domain protein  27.71 
 
 		 329 aa  95.9  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000967067  normal  0.166741 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0158  beta-lactamase domain-containing protein  27.88 
 
 		 314 aa  94.7  2e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.625085 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3798  beta-lactamase domain protein  29.25 
 
 		 324 aa  92.4  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.273419  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2457  beta-lactamase domain-containing protein  24.77 
 
 		 327 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130811  normal  0.600713 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8202  beta-lactamase domain-containing protein  26.65 
 
 		 339 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0428  beta-lactamase domain-containing protein  26.74 
 
 		 366 aa  89.4  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1879  beta-lactamase domain-containing protein  27.08 
 
 		 322 aa  88.2  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2131  beta-lactamase domain protein  26.25 
 
 		 337 aa  87.4  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  27.02 
 
 		 363 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0103  Beta-lactamase-like  25.6 
 
 		 341 aa  84  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0784  beta-lactamase domain protein  26.59 
 
 		 354 aa  83.6  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08650  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  25 
 
 		 346 aa  81.3  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.637388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1004  beta-lactamase domain-containing protein  25.47 
 
 		 320 aa  81.3  0.00000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.217464 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1728  beta-lactamase domain protein  27.6 
 
 		 324 aa  80.9  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0050  Beta-lactamase-like  25.6 
 
 		 334 aa  80.1  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01454  metallo-beta-lactamase family protein  25.66 
 
 		 343 aa  79  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3988  beta-lactamase domain protein  24.11 
 
 		 351 aa  78.2  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0054  beta-lactamase domain protein  25.6 
 
 		 334 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0352  beta-lactamase domain protein  27.14 
 
 		 323 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1152  beta-lactamase domain-containing protein  25.37 
 
 		 321 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  hitchhiker  0.0056375 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2417  beta-lactamase domain-containing protein  25.81 
 
 		 371 aa  75.1  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4274  Beta-lactamase-like  24.44 
 
 		 357 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4516  beta-lactamase domain-containing protein  23.39 
 
 		 346 aa  73.9  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5569  beta-lactamase domain-containing protein  25.52 
 
 		 363 aa  73.6  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0506555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0066  beta-lactamase domain protein  24.4 
 
 		 334 aa  73.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391302  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1440  beta-lactamase domain-containing protein  26.4 
 
 		 331 aa  73.6  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.482344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0131  beta-lactamase domain protein  24.59 
 
 		 359 aa  73.2  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5264  beta-lactamase-like  22.46 
 
 		 353 aa  73.2  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0777  beta-lactamase domain-containing protein  23.42 
 
 		 352 aa  72.4  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.493847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0680  beta-lactamase domain-containing protein  24.59 
 
 		 365 aa  72.4  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4526  beta-lactamase domain protein  27.23 
 
 		 307 aa  72  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00779806  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0281  hypothetical protein  25.36 
 
 		 359 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.18209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3993  beta-lactamase domain-containing protein  25.73 
 
 		 321 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582662 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2629  Beta-lactamase-like  25.15 
 
 		 342 aa  71.6  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2123  beta-lactamase domain-containing protein  27.24 
 
 		 369 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.747407  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4822  beta-lactamase domain-containing protein  24.93 
 
 		 357 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.405979  normal  0.833796 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0132  Beta-lactamase-like  24.14 
 
 		 358 aa  69.3  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0139  beta-lactamase domain protein  24.31 
 
 		 359 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.486193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4825  beta-lactamase-like  25.39 
 
 		 354 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.601465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1889  beta-lactamase domain protein  28.88 
 
 		 286 aa  68.6  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1322  beta-lactamase domain protein  25.71 
 
 		 329 aa  67.8  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0864  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase superfamily protein  22.26 
 
 		 352 aa  67.8  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1480  beta-lactamase-like  25 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.245912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  27.63 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0101  beta-lactamase-like protein  23.82 
 
 		 359 aa  67  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1991  beta-lactamase domain protein  29.65 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1982  beta-lactamase domain-containing protein  24.77 
 
 		 361 aa  65.9  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3173  beta-lactamase domain protein  24.64 
 
 		 344 aa  65.1  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0512  beta-lactamase domain protein  24.14 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1745  beta-lactamase-like protein  23.9 
 
 		 335 aa  65.1  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.931232  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2184  beta-lactamase domain-containing protein  27.54 
 
 		 215 aa  64.7  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0861591  normal  0.0986326 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4562  Beta-lactamase-like  23.71 
 
 		 354 aa  63.9  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.809352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1528  beta-lactamase-like protein  24.72 
 
 		 331 aa  63.9  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0999562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0521  beta-lactamase domain protein  29.77 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000535463  hitchhiker  0.000000708931 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2272  beta-lactamase domain protein  23.95 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2832  beta-lactamase domain-containing protein  25.66 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.422682  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3370  hypothetical protein  25.27 
 
 		 362 aa  62.4  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2141  Beta-lactamase-like  23.55 
 
 		 354 aa  62.4  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0839  beta-lactamase-like  25.6 
 
 		 354 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.228122 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2974  beta-lactamase domain-containing protein  28.89 
 
 		 384 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2837  beta-lactamase domain-containing protein  29.44 
 
 		 358 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.9285 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2650  beta-lactamase domain-containing protein  21.92 
 
 		 324 aa  62.4  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0253  metallo-beta-lactamase family protein  24.84 
 
 		 365 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.921693 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0729  beta-lactamase domain protein  26.3 
 
 		 344 aa  61.2  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  28.04 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1530  beta-lactamase domain protein  26.36 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.788095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  29.24 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6268  Beta-lactamase-like  27.87 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0380  beta-lactamase domain-containing protein  28.33 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.335712 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2311  beta-lactamase-like  27.87 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2925  beta-lactamase domain-containing protein  27.87 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0203  beta-lactamase domain-containing protein  25.38 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0208476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1453  Beta-lactamase-like  36.11 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46150  hypothetical protein  36.36 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.217943 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1772  beta-lactamase domain-containing protein  22.59 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.32284 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3924  hypothetical protein  39.02 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0462  metallo-beta-lactamase family protein  25.47 
 
 		 269 aa  59.3  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000870775  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3968  beta-lactamase domain-containing protein  23.96 
 
 		 317 aa  58.9  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0386675  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1793  beta-lactamase domain-containing protein  35.58 
 
 		 243 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0923  beta-lactamase domain protein  26.24 
 
 		 354 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526967  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0007  beta-lactamase domain protein  25.34 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.963887 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0991  hypothetical protein  24.05 
 
 		 317 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>