More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1152 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1152  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
321 aa  657    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  hitchhiker  0.0056375 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3993  beta-lactamase domain-containing protein  82.76 
 
 
321 aa  549  1e-155  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000582662 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1439  beta-lactamase domain protein  47.88 
 
 
329 aa  270  2e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000967067  normal  0.166741 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2650  beta-lactamase domain-containing protein  42.35 
 
 
324 aa  256  3e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2834  beta-lactamase domain protein  42.35 
 
 
324 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1745  beta-lactamase-like protein  43.31 
 
 
335 aa  225  8e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.931232  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1728  beta-lactamase domain protein  38.28 
 
 
324 aa  179  5.999999999999999e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0839  beta-lactamase-like  34.19 
 
 
354 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.228122 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4825  beta-lactamase-like  34.5 
 
 
354 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.601465  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1440  beta-lactamase domain-containing protein  31.95 
 
 
331 aa  169  5e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.482344  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0923  beta-lactamase domain protein  33.01 
 
 
354 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526967  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4562  Beta-lactamase-like  32.91 
 
 
354 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.809352  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2629  Beta-lactamase-like  33.33 
 
 
342 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1528  beta-lactamase-like protein  35.13 
 
 
331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0999562  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0103  Beta-lactamase-like  33.44 
 
 
341 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0864  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase superfamily protein  32.59 
 
 
352 aa  158  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3844  beta-lactamase-like  31.97 
 
 
366 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1982  beta-lactamase domain-containing protein  33.23 
 
 
361 aa  153  2.9999999999999998e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4822  beta-lactamase domain-containing protein  32.83 
 
 
357 aa  152  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.405979  normal  0.833796 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01454  metallo-beta-lactamase family protein  30 
 
 
343 aa  152  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0131  beta-lactamase domain protein  33.54 
 
 
359 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0139  beta-lactamase domain protein  33.75 
 
 
359 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.486193  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0310  beta-lactamase-like  31.21 
 
 
348 aa  150  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4736  cyclic nucleotide-binding protein  31.06 
 
 
359 aa  150  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0281  hypothetical protein  33.44 
 
 
359 aa  149  6e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.18209  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0729  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
344 aa  149  7e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2417  beta-lactamase domain-containing protein  31.06 
 
 
371 aa  146  5e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146205  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0132  Beta-lactamase-like  32.04 
 
 
358 aa  142  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4516  beta-lactamase domain-containing protein  35.64 
 
 
346 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3086  metallo-beta-lactamase family protein  31.11 
 
 
349 aa  140  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.825394  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6268  Beta-lactamase-like  31.33 
 
 
359 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0777  beta-lactamase domain-containing protein  30.41 
 
 
352 aa  140  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.493847  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5264  beta-lactamase-like  32.24 
 
 
353 aa  140  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0182  beta-lactamase domain-containing protein  32.22 
 
 
356 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2635  beta-lactamase domain protein  30.82 
 
 
349 aa  139  6e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2311  beta-lactamase-like  31.33 
 
 
359 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2925  beta-lactamase domain-containing protein  31.33 
 
 
359 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0380  beta-lactamase domain-containing protein  31.02 
 
 
359 aa  139  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.335712 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4932  beta-lactamase domain-containing protein  32.49 
 
 
335 aa  139  7e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2974  beta-lactamase domain-containing protein  31.42 
 
 
384 aa  139  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2281  metallo-beta-lactamase family protein  31.46 
 
 
359 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.858667  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0582  metallo-beta-lactamase family protein  32.08 
 
 
331 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0420  metallo-beta-lactamase family protein  31.46 
 
 
359 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611131  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3089  metallo-beta-lactamase family protein  31.46 
 
 
359 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2007  metallo-beta-lactamase family protein  31.46 
 
 
359 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0093  metallo-beta-lactamase family protein  31.46 
 
 
383 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0347  metallo-beta-lactamase family protein  31.65 
 
 
326 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607947  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0400  metallo-beta-lactamase family protein  31.46 
 
 
359 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2940  beta-lactamase domain-containing protein  31.33 
 
 
359 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.571743 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3893  beta-lactamase-like  27.81 
 
 
349 aa  136  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.042904 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2837  beta-lactamase domain-containing protein  31.42 
 
 
358 aa  135  8e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.9285 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0101  beta-lactamase-like protein  29.62 
 
 
359 aa  134  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4193  beta-lactamase-like  29.81 
 
 
394 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5569  beta-lactamase domain-containing protein  30.94 
 
 
363 aa  134  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0506555  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3370  hypothetical protein  32.12 
 
 
362 aa  132  6e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8278  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  32.05 
 
 
348 aa  132  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0465  beta-lactamase domain protein  31.5 
 
 
357 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2888  beta-lactamase domain-containing protein  34.84 
 
 
368 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4251  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.5 
 
 
357 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.342604  normal  0.241726 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4274  Beta-lactamase-like  29.91 
 
 
357 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2059  beta-lactamase domain protein  31.56 
 
 
350 aa  130  4.0000000000000003e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000271524  normal  0.300872 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  27.38 
 
 
324 aa  129  5.0000000000000004e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000197877 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  27.22 
 
 
310 aa  129  7.000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2457  beta-lactamase domain-containing protein  33.13 
 
 
327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130811  normal  0.600713 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3058  beta-lactamase-like  28.62 
 
 
329 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2556  beta-lactamase domain-containing protein  29.84 
 
 
323 aa  127  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0433  beta-lactamase domain-containing protein  30.46 
 
 
340 aa  125  7e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0151814  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2397  beta-lactamase domain-containing protein  30.94 
 
 
344 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.21584  normal  0.814785 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0741  putative metallo-beta-lactamase family protein  31.46 
 
 
344 aa  125  9e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.844995  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4113  beta-lactamase domain protein  29.56 
 
 
355 aa  125  9e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.011437  normal  0.053603 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0438  hypothetical protein  29.56 
 
 
328 aa  125  9e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000571233  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2141  Beta-lactamase-like  30.19 
 
 
354 aa  125  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2123  beta-lactamase domain-containing protein  31.02 
 
 
369 aa  124  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.747407  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2461  beta-lactamase domain-containing protein  30.25 
 
 
344 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.889355 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4704  beta-lactamase domain protein  28.36 
 
 
325 aa  123  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0050  Beta-lactamase-like  31.4 
 
 
334 aa  122  9e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1004  beta-lactamase domain-containing protein  28.13 
 
 
320 aa  122  9e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.217464 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0680  beta-lactamase domain-containing protein  29.5 
 
 
365 aa  120  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4696  beta-lactamase domain-containing protein  30.45 
 
 
400 aa  120  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.750931  normal  0.0866563 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0352  beta-lactamase domain protein  27.78 
 
 
323 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0158  beta-lactamase domain-containing protein  29.52 
 
 
314 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.625085 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0066  beta-lactamase domain protein  29.14 
 
 
334 aa  116  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391302  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0054  beta-lactamase domain protein  29.14 
 
 
334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2272  beta-lactamase domain protein  28.04 
 
 
324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1031  beta-lactamase domain protein  27.61 
 
 
323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210455  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08650  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.09 
 
 
346 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.637388  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0051  beta-lactamase domain-containing protein  28.23 
 
 
334 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4200  beta-lactamase domain-containing protein  32.34 
 
 
363 aa  114  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000948581 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8202  beta-lactamase domain-containing protein  29.62 
 
 
339 aa  113  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0368  beta-lactamase-like protein  31.23 
 
 
374 aa  110  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.967784  normal  0.392052 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1013  beta-lactamase domain protein  26.33 
 
 
322 aa  110  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.151542  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3655  beta-lactamase domain protein  27.81 
 
 
332 aa  109  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114597  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0991  hypothetical protein  26.03 
 
 
317 aa  106  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4206  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  25.71 
 
 
317 aa  106  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4269  hypothetical protein  26.56 
 
 
317 aa  106  6e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0253  metallo-beta-lactamase family protein  27.53 
 
 
365 aa  106  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.921693 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0428  beta-lactamase domain-containing protein  31.97 
 
 
366 aa  106  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3890  zinc metallohydrolase  25.71 
 
 
317 aa  105  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.489775  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4159  hypothetical protein  25.71 
 
 
317 aa  105  9e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3882  Zn-dependent hydrolase  25.16 
 
 
317 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>