More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1453 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1453  Beta-lactamase-like  100 
 
 
241 aa  495  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46150  hypothetical protein  79.17 
 
 
242 aa  410  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.217943 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3924  hypothetical protein  78.75 
 
 
242 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1793  beta-lactamase domain-containing protein  80.42 
 
 
243 aa  407  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2843  beta-lactamase-like protein  58.55 
 
 
247 aa  281  5.000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1929  beta-lactamase domain-containing protein  43.53 
 
 
255 aa  201  6e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.298264 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4871  beta-lactamase domain protein  36.4 
 
 
240 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.936336  normal  0.586773 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1619  zinc-dependent hydrolase  31.25 
 
 
261 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2620  beta-lactamase domain-containing protein  31.02 
 
 
253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2963  beta-lactamase domain-containing protein  35.07 
 
 
298 aa  97.4  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.955909  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17250  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.16 
 
 
347 aa  93.2  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.733457 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06040  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.13 
 
 
303 aa  93.2  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.692713 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2285  beta-lactamase-like  27.14 
 
 
311 aa  85.1  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0817874  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0660  beta-lactamase domain-containing protein  33.55 
 
 
279 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000276126  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  30.61 
 
 
213 aa  79.3  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0272  beta-lactamase domain protein  26.42 
 
 
245 aa  73.6  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000021825  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1485  beta-lactamase domain-containing protein  28.28 
 
 
243 aa  72.8  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000168088  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  29.29 
 
 
211 aa  72.8  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  28.28 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  32.75 
 
 
214 aa  69.3  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1524  beta-lactamase domain-containing protein  28.72 
 
 
243 aa  68.6  0.00000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2888  beta-lactamase domain protein  30.69 
 
 
296 aa  67.4  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  31.45 
 
 
205 aa  67  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  25.74 
 
 
212 aa  65.9  0.0000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  26.84 
 
 
324 aa  65.5  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000197877 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2954  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 
214 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25370  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.87 
 
 
207 aa  63.9  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.555955 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  28.08 
 
 
210 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0890  glyoxylase II family protein  27.88 
 
 
218 aa  63.5  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389063  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  28.09 
 
 
215 aa  63.5  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  26.92 
 
 
206 aa  62.8  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1402  beta-lactamase domain-containing protein  28.42 
 
 
204 aa  62.4  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147744  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0052  beta-lactamase domain-containing protein  36.48 
 
 
200 aa  62.4  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0336  beta-lactamase domain-containing protein  33.96 
 
 
330 aa  62  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1782  Metallo-beta-lactamase  23.86 
 
 
217 aa  61.2  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  28.34 
 
 
212 aa  61.6  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10570  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  28.76 
 
 
218 aa  60.8  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.193193  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3722  beta-lactamase domain-containing protein  28.27 
 
 
206 aa  60.5  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0418  beta-lactamase domain protein  25.15 
 
 
212 aa  60.1  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05440  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  36.11 
 
 
352 aa  60.1  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.853516  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  33.87 
 
 
210 aa  60.5  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2893  beta-lactamase domain protein  31.05 
 
 
271 aa  60.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  27.32 
 
 
315 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4704  beta-lactamase domain protein  24.77 
 
 
325 aa  59.3  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2512  beta-lactamase domain protein  32.14 
 
 
214 aa  59.3  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0050  Beta-lactamase-like  29.06 
 
 
334 aa  59.3  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2397  putative hydrolase  30.7 
 
 
210 aa  59.3  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  25.61 
 
 
215 aa  59.3  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  25.61 
 
 
215 aa  59.3  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  25.61 
 
 
215 aa  59.3  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  25.61 
 
 
215 aa  59.3  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  25.61 
 
 
215 aa  59.3  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1411  beta-lactamase domain-containing protein  24.31 
 
 
214 aa  58.9  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.557584  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  29.81 
 
 
209 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  27.57 
 
 
206 aa  58.5  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1760  Zn-dependent hydrolase including glyoxylases  25.71 
 
 
229 aa  58.5  0.00000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0614  beta-lactamase-like  28.63 
 
 
314 aa  58.2  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.381863  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1345  beta-lactamase domain-containing protein  28.81 
 
 
230 aa  58.2  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2827  beta-lactamase domain-containing protein  24.31 
 
 
214 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0208272 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  29.52 
 
 
205 aa  58.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  28.21 
 
 
198 aa  57.8  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2403  metallo-beta-lactamase family protein  28.29 
 
 
213 aa  57.8  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  28.77 
 
 
208 aa  57.4  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  30.61 
 
 
210 aa  57  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3936  putative hydrolase  30 
 
 
211 aa  57.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0630  hypothetical protein  29.17 
 
 
214 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003129  hydroxyacylglutathione hydrolase  24.05 
 
 
216 aa  57  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000730462  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15320  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  41.38 
 
 
204 aa  57  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0054  beta-lactamase domain protein  29.44 
 
 
334 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  28.8 
 
 
209 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  28.8 
 
 
209 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1813  beta-lactamase domain protein  31.03 
 
 
318 aa  57  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846092  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0394  putative metallo-beta-lactamase family protein  25.93 
 
 
215 aa  57  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  31.86 
 
 
251 aa  57  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0066  beta-lactamase domain protein  28.08 
 
 
334 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391302  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1500  beta-lactamase domain-containing protein  25.61 
 
 
214 aa  57  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0860  metallo-beta-lactamase family protein  27.88 
 
 
211 aa  57  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18790  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  29.63 
 
 
208 aa  56.6  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.659057 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  30.09 
 
 
321 aa  57  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02708  hypothetical protein  25.77 
 
 
218 aa  56.6  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  24.39 
 
 
215 aa  56.6  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  23.08 
 
 
215 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  23.08 
 
 
215 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1435  beta-lactamase domain-containing protein  25.61 
 
 
214 aa  56.6  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0282  beta-lactamase domain-containing protein  28.05 
 
 
240 aa  56.6  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1755  beta-lactamase domain-containing protein  26.11 
 
 
235 aa  55.8  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.622383  normal  0.422321 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1067  hypothetical protein  26.04 
 
 
309 aa  55.8  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.21331  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  25.16 
 
 
209 aa  55.8  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  28.91 
 
 
210 aa  55.8  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  25.95 
 
 
215 aa  55.8  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0850  Beta-lactamase-like  22.33 
 
 
197 aa  55.8  0.0000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  23.08 
 
 
215 aa  55.8  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  23.08 
 
 
215 aa  55.8  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  23.08 
 
 
215 aa  55.5  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  23.08 
 
 
215 aa  55.5  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  23.08 
 
 
215 aa  55.5  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2751  beta-lactamase domain-containing protein  23.76 
 
 
214 aa  55.5  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  23.08 
 
 
215 aa  55.8  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1493  beta-lactamase domain-containing protein  25.41 
 
 
214 aa  55.5  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1076  metallo-beta-lactamase family protein  24.88 
 
 
196 aa  55.5  0.0000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.253465  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>