More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1793 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1793  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 243 aa  496  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3924  hypothetical protein  86.67 
 
 		 242 aa  434  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46150  hypothetical protein  87.08 
 
 		 242 aa  435  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.217943 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1453  Beta-lactamase-like  80.42 
 
 		 241 aa  407  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2843  beta-lactamase-like protein  58.05 
 
 		 247 aa  273  1.0000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1929  beta-lactamase domain-containing protein  43.92 
 
 		 255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.298264 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4871  beta-lactamase domain protein  38.75 
 
 		 240 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.936336  normal  0.586773 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2620  beta-lactamase domain-containing protein  31.94 
 
 		 253 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1619  zinc-dependent hydrolase  30.32 
 
 		 261 aa  111  8.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17250  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.54 
 
 		 347 aa  93.6  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.733457 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2963  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 298 aa  85.5  8e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.955909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2285  beta-lactamase-like  27.91 
 
 		 311 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0817874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0660  beta-lactamase domain-containing protein  32.58 
 
 		 279 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000276126  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06040  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  29.69 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.692713 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  34.47 
 
 		 214 aa  82  0.000000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  31.68 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1485  beta-lactamase domain-containing protein  26.41 
 
 		 243 aa  75.1  0.0000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000168088  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0272  beta-lactamase domain protein  26.84 
 
 		 245 aa  73.9  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000021825  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  27.83 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 205 aa  71.6  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25370  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.47 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.555955 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2888  beta-lactamase domain protein  31.37 
 
 		 296 aa  69.3  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  29.36 
 
 		 324 aa  68.6  0.00000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000197877 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1524  beta-lactamase domain-containing protein  27.53 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  29.89 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  29.61 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  31.61 
 
 		 206 aa  67  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  29.27 
 
 		 215 aa  67  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  31.65 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  43.56 
 
 		 363 aa  65.5  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  31.29 
 
 		 213 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0050  Beta-lactamase-like  33.85 
 
 		 334 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1782  Metallo-beta-lactamase  24.16 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  27.67 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0336  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 330 aa  63.2  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2954  beta-lactamase domain-containing protein  26.78 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3722  beta-lactamase domain-containing protein  32.12 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0418  beta-lactamase domain protein  29.07 
 
 		 212 aa  62  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1306  metallo-beta-lactamase family protein  30.85 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2403  metallo-beta-lactamase family protein  27.52 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2512  beta-lactamase domain protein  31.84 
 
 		 214 aa  61.6  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1402  beta-lactamase domain-containing protein  36.36 
 
 		 204 aa  61.6  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0066  beta-lactamase domain protein  32.81 
 
 		 334 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391302  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0054  beta-lactamase domain protein  32.47 
 
 		 334 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  31.21 
 
 		 210 aa  61.6  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  26.7 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1411  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.557584  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  28.87 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  25.62 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2827  beta-lactamase domain-containing protein  25.14 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0208272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4164  beta-lactamase domain protein  30.93 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420537  normal  0.04389 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  30.24 
 
 		 329 aa  59.7  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1067  hypothetical protein  28.77 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.21331  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0890  glyoxylase II family protein  25.77 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389063  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05440  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  35.58 
 
 		 352 aa  58.9  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.853516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  29.7 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1755  beta-lactamase domain-containing protein  25.7 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.622383  normal  0.422321 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1635  beta-lactamase domain-containing protein  26.17 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.702342  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  28.67 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7673  metallo-hydrolase/oxidoreductase domain-containing protein  25.58 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  28.12 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  29.87 
 
 		 198 aa  58.5  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1713  metallo-beta-lactamase family protein  25.36 
 
 		 212 aa  58.5  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  30.28 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  32.65 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  28.48 
 
 		 213 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2428  beta-lactamase domain-containing protein  25.81 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2751  beta-lactamase domain-containing protein  24.59 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1480  Zn-dependent hydrolases including glyoxylases-like protein  26.48 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0630  hypothetical protein  29.17 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0282  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1625  beta-lactamase domain protein  24.59 
 
 		 214 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.224285  normal  0.185558 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0068  metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.79 
 
 		 212 aa  57  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0554126  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003129  hydroxyacylglutathione hydrolase  22.91 
 
 		 216 aa  57  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000730462  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2734  beta-lactamase domain-containing protein  24.59 
 
 		 214 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3936  putative hydrolase  38.14 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1493  beta-lactamase domain-containing protein  23.63 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  30.28 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0394  putative metallo-beta-lactamase family protein  29.75 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  28.8 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0267  beta-lactamase domain-containing protein  25.53 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1500  beta-lactamase domain-containing protein  25.77 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  28.8 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10570  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  29.82 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.193193  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2879  beta-lactamase domain protein  32.17 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.191235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0909  beta-lactamase domain protein  31.03 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324643  normal  0.0194681 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  28.9 
 
 		 323 aa  55.5  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0285  beta-lactamase domain-containing protein  25.53 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394027  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1813  beta-lactamase domain protein  29.67 
 
 		 318 aa  55.1  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846092  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2233  Beta-lactamase-like  25.58 
 
 		 316 aa  55.1  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000172042  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1435  beta-lactamase domain-containing protein  25.77 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3173  beta-lactamase domain protein  37.5 
 
 		 344 aa  55.5  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0220  beta-lactamase domain protein  28.28 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  30.3 
 
 		 321 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2269  beta-lactamase domain-containing protein  25.81 
 
 		 214 aa  55.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.289735 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5067  beta-lactamase domain-containing protein  32.48 
 
 		 215 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.512117  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0317  beta-lactamase domain-containing protein  27.71 
 
 		 214 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0043  beta-lactamase domain-containing protein  32.24 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0052  beta-lactamase domain-containing protein  32.63 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2821  beta-lactamase-like  25.53 
 
 		 237 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>