More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1524 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1524  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
243 aa  497  1e-140  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1485  beta-lactamase domain-containing protein  88.07 
 
 
243 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000168088  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0272  beta-lactamase domain protein  63.11 
 
 
245 aa  325  6e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000021825  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2963  beta-lactamase domain-containing protein  36.09 
 
 
298 aa  163  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.955909  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0660  beta-lactamase domain-containing protein  39.84 
 
 
279 aa  99.4  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000276126  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1619  zinc-dependent hydrolase  31.41 
 
 
261 aa  94  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2285  beta-lactamase-like  35.44 
 
 
311 aa  87  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0817874  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06040  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  28.19 
 
 
303 aa  84.7  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.692713 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2620  beta-lactamase domain-containing protein  30.65 
 
 
253 aa  84.7  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4871  beta-lactamase domain protein  30.95 
 
 
240 aa  83.6  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.936336  normal  0.586773 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  31.58 
 
 
209 aa  78.6  0.00000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2843  beta-lactamase-like protein  26.2 
 
 
247 aa  72.4  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1929  beta-lactamase domain-containing protein  25.98 
 
 
255 aa  70.5  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.298264 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3924  hypothetical protein  28.99 
 
 
242 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46150  hypothetical protein  30.34 
 
 
242 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.217943 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1453  Beta-lactamase-like  28.72 
 
 
241 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1793  beta-lactamase domain-containing protein  27.53 
 
 
243 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  32.97 
 
 
213 aa  67  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  27.47 
 
 
215 aa  67  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  29.79 
 
 
214 aa  66.6  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  33.15 
 
 
329 aa  65.5  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  25.91 
 
 
324 aa  64.3  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000197877 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0471  beta-lactamase domain protein  32.2 
 
 
346 aa  62.8  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  30.67 
 
 
212 aa  62.8  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0614  beta-lactamase-like  25.27 
 
 
314 aa  63.2  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.381863  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11930  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  27.96 
 
 
354 aa  62.4  0.000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.985203  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02708  hypothetical protein  32.03 
 
 
218 aa  62  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1084  beta-lactamase domain protein  27.38 
 
 
302 aa  61.6  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2640  beta-lactamase domain protein  29.47 
 
 
206 aa  61.6  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0543  beta-lactamase domain protein  27.81 
 
 
263 aa  60.5  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0412  beta-lactamase domain-containing protein  31.94 
 
 
192 aa  60.1  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5067  beta-lactamase domain protein  25.26 
 
 
212 aa  59.3  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.533186  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17250  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.03 
 
 
347 aa  59.3  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.733457 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  27.44 
 
 
231 aa  59.3  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0443  beta-lactamase domain protein  26.49 
 
 
208 aa  58.9  0.00000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3268  Beta-lactamase-like  34.07 
 
 
216 aa  58.9  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0016  beta-lactamase domain protein  26.34 
 
 
246 aa  58.5  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000373362  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.37 
 
 
215 aa  58.5  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.37 
 
 
215 aa  58.5  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.37 
 
 
215 aa  58.5  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.37 
 
 
215 aa  58.5  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.37 
 
 
215 aa  58.5  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  29.8 
 
 
210 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  27.96 
 
 
211 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  30.43 
 
 
215 aa  57  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3722  beta-lactamase domain-containing protein  25.79 
 
 
206 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0093  beta-lactamase domain protein  25.5 
 
 
210 aa  57.4  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  31.11 
 
 
215 aa  57  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2879  AMP-dependent synthetase and ligase  25.63 
 
 
862 aa  56.6  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003129  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.69 
 
 
216 aa  56.6  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000730462  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  34.33 
 
 
217 aa  56.2  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18790  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.59 
 
 
208 aa  56.6  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.659057 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1454  beta-lactamase domain-containing protein  27.49 
 
 
259 aa  55.8  0.0000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0539  Zn-dependent hydrolase, including glyoxylase  26.39 
 
 
210 aa  56.2  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0442594  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1765  beta-lactamase domain protein  28.11 
 
 
201 aa  55.8  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2512  beta-lactamase domain protein  28.41 
 
 
214 aa  55.8  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  24.86 
 
 
206 aa  55.8  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  28.26 
 
 
287 aa  55.5  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  27.54 
 
 
206 aa  55.5  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0120  beta-lactamase domain-containing protein  28.19 
 
 
214 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  27.54 
 
 
206 aa  55.5  0.0000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3446  beta-lactamase-like  29.53 
 
 
562 aa  55.5  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3638  beta-lactamase domain-containing protein  29.93 
 
 
286 aa  55.1  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.573408  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3268  hypothetical protein  28.97 
 
 
224 aa  54.7  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1211  beta-lactamase domain protein  29.8 
 
 
211 aa  54.7  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000331215  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25370  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  28.28 
 
 
207 aa  54.7  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.555955 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1004  beta-lactamase domain-containing protein  29.94 
 
 
320 aa  54.7  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.217464 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0044  metallo-beta-lactamase superfamily protein  33.33 
 
 
214 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1162  beta-lactamase domain-containing protein  26.64 
 
 
234 aa  54.7  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  30.37 
 
 
215 aa  55.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  26.84 
 
 
363 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1782  beta-lactamase domain protein  29.86 
 
 
215 aa  55.1  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3024  beta-lactamase domain protein  26.54 
 
 
310 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0101087  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3004  beta-lactamase domain-containing protein  27.57 
 
 
204 aa  54.7  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.985459  normal  0.107301 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1495  beta-lactamase-like  31.88 
 
 
322 aa  54.7  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5004  beta-lactamase domain-containing protein  28.07 
 
 
317 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331086  normal  0.0887437 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21860  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  31.91 
 
 
574 aa  54.7  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  30.37 
 
 
215 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3822  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 
214 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  30.37 
 
 
215 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  30.37 
 
 
215 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3127  beta-lactamase domain protein  26.83 
 
 
310 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.257865  normal  0.300589 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0890  glyoxylase II family protein  33.59 
 
 
218 aa  54.3  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389063  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2903  beta-lactamase domain protein  26.32 
 
 
202 aa  53.9  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1171  beta-lactamase domain protein  26.6 
 
 
303 aa  54.3  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361402  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2909  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 
214 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.457315  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  30.37 
 
 
215 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0093  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.08 
 
 
255 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.117082 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  29.37 
 
 
209 aa  53.9  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  30.37 
 
 
215 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1299  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.24 
 
 
258 aa  53.9  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.744991  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  27.22 
 
 
212 aa  54.3  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  30.37 
 
 
215 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2578  beta-lactamase domain protein  24.58 
 
 
340 aa  54.3  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3400  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 
214 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00696268  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1632  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 
214 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3903  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 
214 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2969  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 
214 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0213  beta-lactamase domain-containing protein  30.82 
 
 
214 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.325973 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  30.07 
 
 
205 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>