237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0471 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0471  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 346 aa  694    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  52.82 
 
 		 352 aa  349  5e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  46.88 
 
 		 315 aa  239  5.999999999999999e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  46.01 
 
 		 327 aa  238  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  41.5 
 
 		 351 aa  236  4e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  39.26 
 
 		 314 aa  224  2e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  45.58 
 
 		 315 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5952  putative metallo-beta-lactamase family protein  46.95 
 
 		 308 aa  221  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  39.83 
 
 		 364 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  39.26 
 
 		 364 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1934  beta-lactamase domain-containing protein  37.71 
 
 		 347 aa  216  4e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  45.55 
 
 		 321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0244  beta-lactamase domain protein  39.36 
 
 		 315 aa  206  7e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0816903 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  39.3 
 
 		 349 aa  205  1e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1776  beta-lactamase domain-containing protein  41.2 
 
 		 310 aa  204  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2112  beta-lactamase domain protein  42.7 
 
 		 310 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1965  beta-lactamase domain-containing protein  38.78 
 
 		 320 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1735  beta-lactamase domain protein  42.05 
 
 		 310 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.593356  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2189  hypothetical protein  34.43 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.887609  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  38.43 
 
 		 307 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  34.78 
 
 		 309 aa  119  7e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  37.65 
 
 		 307 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3125  beta-lactamase domain-containing protein  38.89 
 
 		 313 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265077  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  30.42 
 
 		 337 aa  109  9.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3115  hypothetical protein  31.35 
 
 		 351 aa  108  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  28.83 
 
 		 305 aa  107  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  26.37 
 
 		 310 aa  106  8e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2733  beta-lactamase domain-containing protein  34.33 
 
 		 325 aa  103  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 299 aa  102  8e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  29.58 
 
 		 302 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  35.68 
 
 		 312 aa  101  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  27.96 
 
 		 332 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  30.1 
 
 		 287 aa  100  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0080  beta-lactamase domain protein  33.1 
 
 		 319 aa  100  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0472  hydrolase, putative  29.47 
 
 		 298 aa  99  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0389397 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  28.79 
 
 		 298 aa  98.2  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0095  beta-lactamase domain-containing protein  32.86 
 
 		 315 aa  98.2  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0725  beta-lactamase domain-containing protein  31.4 
 
 		 334 aa  97.4  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0290049 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1621  Beta-lactamase-like  30.15 
 
 		 334 aa  94.7  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.683443  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  32.75 
 
 		 342 aa  94.7  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  25.27 
 
 		 438 aa  94.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  28.12 
 
 		 318 aa  90.1  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4154  beta-lactamase domain-containing protein  33.01 
 
 		 317 aa  89.4  9e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0686  beta-lactamase domain-containing protein  31.6 
 
 		 597 aa  87.4  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.459688 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2106  beta-lactamase domain protein  29.93 
 
 		 315 aa  86.7  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.105061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1231  beta-lactamase domain protein  27.97 
 
 		 318 aa  86.7  6e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0606732 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  31.06 
 
 		 318 aa  86.3  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  29.86 
 
 		 318 aa  86.7  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2500  beta-lactamase domain protein  29.93 
 
 		 315 aa  86.7  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.397877 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  30.68 
 
 		 318 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2056  Beta-lactamase-like  25.43 
 
 		 340 aa  85.9  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000527783  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4039  Beta-lactamase-like  27 
 
 		 337 aa  85.1  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  31.72 
 
 		 321 aa  84.7  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1824  beta-lactamase domain-containing protein  27.99 
 
 		 342 aa  85.1  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00672926 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1103  putative hydrolase  26.28 
 
 		 312 aa  83.6  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197828  normal  0.352936 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2107  beta-lactamase domain protein  26.82 
 
 		 309 aa  82.8  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  28.04 
 
 		 312 aa  82.8  0.000000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2501  beta-lactamase domain protein  26.82 
 
 		 322 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.541242 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  31.2 
 
 		 312 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  29.76 
 
 		 323 aa  82  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3814  beta-lactamase domain-containing protein  26.94 
 
 		 316 aa  80.1  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.360876  normal  0.263273 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4160  SoxH protein-like  27.65 
 
 		 312 aa  79.7  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.671969  normal  0.539982 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  27.27 
 
 		 333 aa  79.3  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0911  beta-lactamase domain protein  26.09 
 
 		 330 aa  79.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  28.35 
 
 		 321 aa  78.6  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  29.21 
 
 		 321 aa  76.3  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0555  beta-lactamase domain protein  28.33 
 
 		 316 aa  76.3  0.0000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000575755  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2623  beta-lactamase-like  24.83 
 
 		 316 aa  75.5  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.533019 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  27.55 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1667  metallo-beta-lactamase family protein  25.87 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3306  beta-lactamase domain protein  29.69 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1435  beta-lactamase-like  26.38 
 
 		 316 aa  72.8  0.000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.388274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  30.61 
 
 		 319 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  30.61 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  30.26 
 
 		 319 aa  71.6  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1577  beta-lactamase domain protein  31.84 
 
 		 272 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  30.15 
 
 		 319 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  30.61 
 
 		 336 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  30.61 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  26.72 
 
 		 321 aa  70.5  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  30.61 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  26.72 
 
 		 332 aa  70.5  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  30.61 
 
 		 339 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  26.4 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  30.61 
 
 		 339 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2531  beta-lactamase domain protein  27.78 
 
 		 312 aa  69.7  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  32.86 
 
 		 335 aa  69.7  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  32.86 
 
 		 335 aa  69.7  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4537  beta-lactamase domain protein  27.94 
 
 		 314 aa  69.3  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.630097  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1904  metallo-beta-lactamase family protein  24.91 
 
 		 300 aa  68.6  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224567  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3492  beta-lactamase domain-containing protein  30.09 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520693  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  31.12 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  31.12 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  31.16 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.56 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.231237 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  27.48 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  30.65 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  30.65 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0890  beta-lactamase-like  27 
 
 		 317 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0734  beta-lactamase domain-containing protein  25.69 
 
 		 343 aa  67.8  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0713703  normal  0.0589281 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>