79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1495 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1495  beta-lactamase-like  100 
 
 		 322 aa  674    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1122  beta-lactamase-like protein  47.45 
 
 		 322 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000282936  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1284  metallo-beta-lactamase family protein  47.71 
 
 		 325 aa  314  9.999999999999999e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3638  beta-lactamase domain-containing protein  35.82 
 
 		 286 aa  190  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.573408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1837  beta-lactamase domain protein  34.43 
 
 		 299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0614  beta-lactamase-like  36.24 
 
 		 314 aa  181  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.381863  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2285  beta-lactamase-like  27.12 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0817874  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1619  zinc-dependent hydrolase  26.47 
 
 		 261 aa  65.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1485  beta-lactamase domain-containing protein  30.81 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000168088  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0272  beta-lactamase domain protein  29.48 
 
 		 245 aa  58.9  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000021825  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  31.78 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.755925 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8910  beta-lactamase domain protein  26.11 
 
 		 264 aa  57  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4851  beta-lactamase domain protein  27.36 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1524  beta-lactamase domain-containing protein  31.88 
 
 		 243 aa  54.7  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25410  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  27.94 
 
 		 259 aa  54.7  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1453  Beta-lactamase-like  30.77 
 
 		 241 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2843  beta-lactamase-like protein  25.27 
 
 		 247 aa  53.9  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  28.4 
 
 		 323 aa  53.5  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2963  beta-lactamase domain-containing protein  27.56 
 
 		 298 aa  52  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.955909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  26.02 
 
 		 215 aa  51.6  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3080  beta-lactamase-like  32.18 
 
 		 255 aa  50.1  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120215  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1936  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  32.18 
 
 		 257 aa  48.9  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1863  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.18 
 
 		 260 aa  48.5  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1997  beta-lactamase domain-containing protein  23.12 
 
 		 268 aa  48.9  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1958  beta-lactamase domain-containing protein  25.9 
 
 		 209 aa  47.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46150  hypothetical protein  25.15 
 
 		 242 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.217943 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06040  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  26.59 
 
 		 303 aa  48.1  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.692713 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0793  beta-lactamase domain-containing protein  24.36 
 
 		 556 aa  47.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.541294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1782  Metallo-beta-lactamase  27.08 
 
 		 217 aa  48.5  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1793  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 243 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0923  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.89 
 
 		 260 aa  48.5  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.319486  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3924  hypothetical protein  25.77 
 
 		 242 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4871  beta-lactamase domain protein  24.85 
 
 		 240 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.936336  normal  0.586773 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  26.02 
 
 		 215 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  26.02 
 
 		 215 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  26.02 
 
 		 215 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  26.02 
 
 		 215 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  26.02 
 
 		 215 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4293  beta-lactamase domain protein  32.29 
 
 		 376 aa  47  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3433  beta-lactamase-like protein  28.85 
 
 		 222 aa  46.6  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111848  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0203  beta-lactamase domain-containing protein  26.63 
 
 		 263 aa  46.6  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0208476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  24.69 
 
 		 321 aa  46.6  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4261  beta-lactamase domain protein  28.38 
 
 		 369 aa  46.2  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1452  beta-lactamase domain-containing protein  27.14 
 
 		 556 aa  46.2  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.463729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0068  metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.05 
 
 		 212 aa  46.2  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0554126  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0378  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.03 
 
 		 248 aa  45.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0467  metallo-beta-lactamase family protein  25.77 
 
 		 262 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.56187 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1257  hydroxyacylglutathione hydrolase (glyoxalase II)  28.12 
 
 		 254 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  26.02 
 
 		 215 aa  45.8  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0536  beta-lactamase domain protein  26.62 
 
 		 226 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0161694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  25.2 
 
 		 215 aa  45.4  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2620  beta-lactamase domain-containing protein  22.13 
 
 		 253 aa  45.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1866  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.61 
 
 		 255 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1339  beta-lactamase-like protein  26.49 
 
 		 192 aa  45.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0512  beta-lactamase domain protein  26.4 
 
 		 315 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0116  putative hydrolase  27.7 
 
 		 284 aa  43.9  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  26.51 
 
 		 213 aa  43.9  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1782  beta-lactamase domain protein  26.83 
 
 		 215 aa  44.3  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0374  beta-lactamase-like  26.21 
 
 		 222 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.834872 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  36.36 
 
 		 213 aa  43.5  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1544  beta-lactamase domain protein  23.19 
 
 		 294 aa  43.9  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.393561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2059  beta-lactamase domain-containing protein  27.21 
 
 		 310 aa  43.9  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0322253 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1258  hydroxyacylglutathione hydrolase (glyoxalase II)  27.34 
 
 		 254 aa  43.9  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3054  metallo-beta-lactamase family protein  29.81 
 
 		 214 aa  43.9  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5314  beta-lactamase domain protein  24.34 
 
 		 268 aa  43.9  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.498114 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3268  Beta-lactamase-like  26.92 
 
 		 216 aa  43.5  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  25.2 
 
 		 215 aa  43.5  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  25.2 
 
 		 215 aa  43.5  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  25.2 
 
 		 215 aa  43.5  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  25.2 
 
 		 215 aa  43.5  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  25.17 
 
 		 214 aa  43.5  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  25.2 
 
 		 215 aa  43.1  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  25.2 
 
 		 215 aa  43.1  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  25.2 
 
 		 215 aa  43.1  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5001  beta-lactamase domain protein  22.22 
 
 		 350 aa  43.1  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0521507  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1251  beta-lactamase domain-containing protein  29.58 
 
 		 196 aa  42.7  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.809975  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2790  beta-lactamase domain protein  31.96 
 
 		 246 aa  42.7  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00776  probable metallo-beta-lactamase  26.17 
 
 		 213 aa  42.7  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11813  Rhodanese-like protein  26.09 
 
 		 442 aa  42.7  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154405  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>