75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0614 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0614  beta-lactamase-like  100 
 
 
314 aa  627  1e-179  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.381863  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1837  beta-lactamase domain protein  44.81 
 
 
299 aa  208  8e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3638  beta-lactamase domain-containing protein  43.53 
 
 
286 aa  207  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.573408  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1495  beta-lactamase-like  35.2 
 
 
322 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1284  metallo-beta-lactamase family protein  39.15 
 
 
325 aa  185  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1122  beta-lactamase-like protein  40.25 
 
 
322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000282936  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2285  beta-lactamase-like  24.81 
 
 
311 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0817874  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1619  zinc-dependent hydrolase  25 
 
 
261 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0272  beta-lactamase domain protein  22.39 
 
 
245 aa  64.7  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000021825  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1524  beta-lactamase domain-containing protein  25.27 
 
 
243 aa  63.5  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2963  beta-lactamase domain-containing protein  28.9 
 
 
298 aa  62.4  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.955909  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1485  beta-lactamase domain-containing protein  24.23 
 
 
243 aa  59.7  0.00000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000168088  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1453  Beta-lactamase-like  29.63 
 
 
241 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06040  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  28.24 
 
 
303 aa  56.6  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.692713 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2620  beta-lactamase domain-containing protein  25.45 
 
 
253 aa  56.6  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3924  hypothetical protein  30.37 
 
 
242 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2552  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.64 
 
 
256 aa  56.2  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.964384  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  31.37 
 
 
213 aa  55.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46150  hypothetical protein  29.44 
 
 
242 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.217943 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  30.41 
 
 
287 aa  54.3  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0083  Beta-lactamase-like  28.48 
 
 
304 aa  52.8  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2691  putative hydroxyacylglutathione hydrolase  35.16 
 
 
256 aa  52  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.25235  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0515  beta-lactamase domain-containing protein  29.73 
 
 
308 aa  52  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0129365 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0531  beta-lactamase domain protein  29.73 
 
 
308 aa  51.6  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03750  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  29.5 
 
 
228 aa  51.2  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0915981 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0660  beta-lactamase domain-containing protein  25.9 
 
 
279 aa  51.2  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000276126  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2397  putative hydrolase  28.92 
 
 
210 aa  51.6  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1793  beta-lactamase domain-containing protein  27.1 
 
 
243 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0923  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.97 
 
 
260 aa  50.8  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.319486  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1936  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  31.87 
 
 
257 aa  48.1  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1863  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.87 
 
 
260 aa  48.1  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  28.77 
 
 
329 aa  47.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  27.53 
 
 
323 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  31.06 
 
 
208 aa  47.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1560  beta-lactamase domain-containing protein  26.46 
 
 
205 aa  47  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1123  beta-lactamase domain-containing protein  27.51 
 
 
204 aa  47  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0591  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.38 
 
 
258 aa  47  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0121  beta-lactamase-like protein  27.35 
 
 
309 aa  46.6  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.381436  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  29.79 
 
 
214 aa  46.6  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1889  beta-lactamase domain protein  30.37 
 
 
286 aa  46.2  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  32.8 
 
 
309 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  29.11 
 
 
302 aa  46.2  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  29.59 
 
 
217 aa  45.8  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1678  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.65 
 
 
256 aa  45.4  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1975  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.89 
 
 
259 aa  45.8  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1743  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.31 
 
 
259 aa  45.8  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0994564 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4036  glyoxalase II  30.19 
 
 
256 aa  45.4  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  28.12 
 
 
299 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0834  beta-lactamase domain-containing protein  25.4 
 
 
205 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3080  beta-lactamase-like  34.04 
 
 
255 aa  45.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120215  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2186  beta-lactamase domain protein  28.12 
 
 
210 aa  45.1  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.704345 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18790  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.37 
 
 
208 aa  44.3  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.659057 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0343  metallo-beta-lactamase family protein  32.98 
 
 
256 aa  44.3  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  22.73 
 
 
211 aa  44.3  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0467  metallo-beta-lactamase family protein  30 
 
 
262 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.56187 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1196  beta-lactamase domain protein  30.43 
 
 
235 aa  43.9  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.269825  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1782  Metallo-beta-lactamase  24.31 
 
 
217 aa  43.9  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1986  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.07 
 
 
278 aa  43.9  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10570  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  24.71 
 
 
218 aa  43.9  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.193193  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0909  beta-lactamase domain protein  35.71 
 
 
213 aa  43.5  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324643  normal  0.0194681 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  27.45 
 
 
215 aa  43.1  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.755925 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0378  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.71 
 
 
248 aa  43.1  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1117  beta-lactamase domain-containing protein  26.21 
 
 
205 aa  43.1  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2843  beta-lactamase-like protein  26.22 
 
 
247 aa  43.1  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4851  beta-lactamase domain protein  28.46 
 
 
296 aa  43.1  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2903  beta-lactamase domain protein  29.09 
 
 
202 aa  43.1  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0756  beta-lactamase domain protein  24.08 
 
 
306 aa  42.7  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  24.82 
 
 
215 aa  42.7  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  24.82 
 
 
215 aa  42.7  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  24.82 
 
 
215 aa  42.7  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  24.82 
 
 
215 aa  42.7  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  24.82 
 
 
215 aa  42.4  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  24.82 
 
 
215 aa  42.7  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  24.82 
 
 
215 aa  42.7  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2260  beta-lactamase domain-containing protein  27.21 
 
 
234 aa  42.4  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>