More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2260 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2260  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 234 aa  480  1e-135  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1986  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.76 
 
 		 278 aa  112  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0397  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  33.62 
 
 		 250 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0561  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.62 
 
 		 250 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2563  metallo-beta-lactamase family protein  32.62 
 
 		 267 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2438  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.4 
 
 		 259 aa  107  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2116  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.1 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2530  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.1 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.785477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1481  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.48 
 
 		 250 aa  106  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00263805  normal  0.131466 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1403  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.7 
 
 		 258 aa  105  8e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0310666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1462  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.27 
 
 		 240 aa  103  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0144845  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0179  beta-lactamase domain-containing protein  37.63 
 
 		 213 aa  102  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0498  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.44 
 
 		 256 aa  101  9e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0378559  normal  0.142728 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1776  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.13 
 
 		 267 aa  101  9e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000249519  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2510  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.08 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.484378  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0508  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.19 
 
 		 255 aa  99.4  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.11609  normal  0.0226917 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2733  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.63 
 
 		 259 aa  99  6e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.725936  normal  0.296553 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1750  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.38 
 
 		 263 aa  98.6  7e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000000022513  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1828  putative hydroxyacylglutathione hydrolase GloB  33.64 
 
 		 252 aa  98.2  9e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1984  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.78 
 
 		 255 aa  97.8  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.543925  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2651  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.79 
 
 		 258 aa  97.8  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0421465 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4897  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.14 
 
 		 257 aa  97.8  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2529  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.13 
 
 		 259 aa  97.4  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.366844  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0934  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.56 
 
 		 259 aa  96.7  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.421322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0591  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.31 
 
 		 258 aa  96.7  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2187  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.06 
 
 		 266 aa  96.3  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2898  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.03 
 
 		 257 aa  95.9  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00113363  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1235  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.12 
 
 		 256 aa  96.3  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0229191  normal  0.0959861 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2327  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.3 
 
 		 263 aa  95.9  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000811011  hitchhiker  0.0000970016 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2055  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.93 
 
 		 263 aa  95.5  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.413941  normal  0.0872893 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1975  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.27 
 
 		 259 aa  95.1  7e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0125  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  33.5 
 
 		 218 aa  95.1  9e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.477047  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2381  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.28 
 
 		 256 aa  95.1  9e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.239292 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01981  Hydroxyacylglutathione hydrolase  31.58 
 
 		 263 aa  94.7  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0160657  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2552  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.74 
 
 		 256 aa  94.7  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.964384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2064  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.29 
 
 		 257 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.455867  normal  0.0515167 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2338  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.91 
 
 		 259 aa  93.6  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2011  hydroxyacylglutathione hydrolase  30 
 
 		 263 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000146784  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002770  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.73 
 
 		 252 aa  93.2  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.18088  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03213  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.63 
 
 		 252 aa  93.2  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0917  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.19 
 
 		 258 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0932864 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1996  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.44 
 
 		 263 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0422138  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1979  Hydroxyacylglutathione hydrolase  33.18 
 
 		 255 aa  93.2  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1743  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.82 
 
 		 259 aa  92.8  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0994564 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1894  Hydroxyacylglutathione hydrolase  33.64 
 
 		 255 aa  92.4  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.323846  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2059  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.04 
 
 		 263 aa  92  7e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000134001  decreased coverage  0.000104727 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1866  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.89 
 
 		 255 aa  91.7  9e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2206  beta-lactamase-like protein  32.91 
 
 		 266 aa  91.7  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00363789  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1863  hydroxyacylglutathione hydrolase  31 
 
 		 260 aa  90.9  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2291  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.62 
 
 		 257 aa  90.9  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.276958  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1972  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.41 
 
 		 245 aa  91.3  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.293472 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0422  metallo-beta-lactamase family protein  32.65 
 
 		 257 aa  91.3  1e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0543677  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1765  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.65 
 
 		 257 aa  91.3  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1578  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.82 
 
 		 256 aa  90.9  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156565 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2238  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.95 
 
 		 295 aa  90.9  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000229962  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_004310  BR1936  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  31 
 
 		 257 aa  90.9  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3714  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  31.06 
 
 		 259 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.610808  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1621  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.88 
 
 		 264 aa  90.5  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2369  beta-lactamase domain-containing protein  27.91 
 
 		 267 aa  90.5  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000987439  normal  0.0208559 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0343  metallo-beta-lactamase family protein  31.14 
 
 		 256 aa  90.1  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0373  beta-lactamase-like protein  32.88 
 
 		 255 aa  89.7  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.717136 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2063  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.22 
 
 		 255 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.136922  hitchhiker  0.00967552 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  39.29 
 
 		 213 aa  90.1  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1678  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.23 
 
 		 256 aa  89.7  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0923  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.3 
 
 		 260 aa  89.7  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.319486  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1022  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.13 
 
 		 269 aa  90.1  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2611  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.17 
 
 		 263 aa  89.4  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00328129  normal  0.860285 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1665  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.55 
 
 		 256 aa  89.4  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2161  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.49 
 
 		 295 aa  89.4  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000853605  normal  0.0597088 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3076  metallo-beta-lactamase family protein  34.08 
 
 		 207 aa  89  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000251801  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1761  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.21 
 
 		 259 aa  89  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427726  normal  0.639702 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1595  Beta-lactamase-like  30.4 
 
 		 265 aa  89  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0926  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.68 
 
 		 268 aa  89  6e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2720  beta-lactamase domain protein  35.08 
 
 		 213 aa  89  6e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.373354  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5360  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.96 
 
 		 263 aa  88.6  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0246  beta-lactamase domain protein  32.39 
 
 		 213 aa  88.6  7e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1944  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.53 
 
 		 255 aa  89  7e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29620  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.44 
 
 		 258 aa  88.6  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0944915  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  36.63 
 
 		 209 aa  88.6  8e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31656  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.64 
 
 		 255 aa  88.6  8e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.976065  normal  0.697857 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3270  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.61 
 
 		 256 aa  88.6  9e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0282  beta-lactamase domain protein  34.55 
 
 		 213 aa  87.8  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.396725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2207  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.36 
 
 		 259 aa  88.2  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.181464  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1515  putative hydroxyacylglutathione hydrolase protein  32.46 
 
 		 284 aa  87.4  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16683  glyoxalase  31.08 
 
 		 262 aa  87.4  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2691  putative hydroxyacylglutathione hydrolase  29.15 
 
 		 256 aa  87.4  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.25235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0297  Hydroxyacylglutathione hydrolase  33.78 
 
 		 239 aa  87.4  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000396762  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2401  putative metallo-beta-lactamase  29.28 
 
 		 252 aa  86.3  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1572  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.8 
 
 		 266 aa  86.3  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2871  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.65 
 
 		 263 aa  86.3  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00247676  normal  0.571794 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1895  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.64 
 
 		 257 aa  85.9  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00137094  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3786  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.35 
 
 		 257 aa  86.3  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.554974 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1733  beta-lactamase-like protein  35.29 
 
 		 232 aa  85.9  5e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000811303 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1536  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.68 
 
 		 263 aa  85.5  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0733967  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0328  Beta-lactamase-like  28.45 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.309918  normal  0.439224 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2798  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.33 
 
 		 272 aa  84.3  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.233678 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1007  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.94 
 
 		 251 aa  84  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1884  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.64 
 
 		 258 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000396006  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2841  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.95 
 
 		 250 aa  83.2  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  36.26 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>