More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1515 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc1515  putative hydroxyacylglutathione hydrolase protein  100 
 
 
284 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2039  hydroxyacylglutathione hydrolase  83.87 
 
 
279 aa  457  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1731  hydroxyacylglutathione hydrolase  82.73 
 
 
279 aa  450  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00595225  normal  0.648796 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2187  hydroxyacylglutathione hydrolase  68.28 
 
 
266 aa  349  3e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2206  beta-lactamase-like protein  68.66 
 
 
266 aa  346  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00363789  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1258  hydroxyacylglutathione hydrolase  57.09 
 
 
273 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000343  normal  0.124604 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0870  hydroxyacylglutathione hydrolase  55.89 
 
 
267 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139904  normal  0.346308 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2033  hydroxyacylglutathione hydrolase  59.09 
 
 
268 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000269745  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1022  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.37 
 
 
269 aa  281  7.000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4429  hydroxyacylglutathione hydrolase  57.41 
 
 
268 aa  280  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156624  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2871  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.99 
 
 
263 aa  278  6e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00247676  normal  0.571794 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0806  hydroxyacylglutathione hydrolase  56.72 
 
 
273 aa  278  9e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0137889  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1287  hydroxyacylglutathione hydrolase  56.72 
 
 
273 aa  278  9e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000101374  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1164  hydroxyacylglutathione hydrolase  58.24 
 
 
260 aa  277  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000229771  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1176  hydroxyacylglutathione hydrolase  57.09 
 
 
273 aa  276  3e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000239023  normal  0.0635677 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2651  hydroxyacylglutathione hydrolase  57.2 
 
 
258 aa  275  6e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0421465 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2529  hydroxyacylglutathione hydrolase  58.33 
 
 
259 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.366844  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2788  hydroxyacylglutathione hydrolase  56.65 
 
 
268 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000589518  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2291  hydroxyacylglutathione hydrolase  54.2 
 
 
257 aa  271  1e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.276958  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1621  hydroxyacylglutathione hydrolase  52.42 
 
 
264 aa  269  2.9999999999999997e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002770  hydroxyacylglutathione hydrolase  51.49 
 
 
252 aa  267  1e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.18088  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01981  Hydroxyacylglutathione hydrolase  49.81 
 
 
263 aa  268  1e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0160657  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1468  metallo-beta-lactamase family protein  55.13 
 
 
268 aa  264  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.176854  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0558  hydroxyacylglutathione hydrolase  55.13 
 
 
268 aa  264  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0765  hydroxyacylglutathione hydrolase  55.13 
 
 
268 aa  264  1e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0594  hydroxyacylglutathione hydrolase  55.13 
 
 
268 aa  264  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03213  hydroxyacylglutathione hydrolase  51.12 
 
 
252 aa  264  1e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1275  hydroxyacylglutathione hydrolase  55.13 
 
 
268 aa  264  1e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.987461  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1828  putative hydroxyacylglutathione hydrolase GloB  50.75 
 
 
252 aa  263  3e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1253  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.23 
 
 
263 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.100506  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2401  putative metallo-beta-lactamase  50.75 
 
 
252 aa  261  1e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1895  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.94 
 
 
257 aa  261  1e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00137094  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1678  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.38 
 
 
256 aa  258  8e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1999  metallo-beta-lactamase family protein  47.19 
 
 
265 aa  256  2e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2530  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.73 
 
 
257 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.785477  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2116  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.73 
 
 
257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1972  hydroxyacylglutathione hydrolase  54.69 
 
 
245 aa  253  3e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.293472 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2338  hydroxyacylglutathione hydrolase  56.44 
 
 
259 aa  251  8.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0591  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.21 
 
 
258 aa  251  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3716  hydroxyacylglutathione hydrolase  51.48 
 
 
259 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.420034  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3469  hydroxyacylglutathione hydrolase  51.47 
 
 
259 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4144  hydroxyacylglutathione hydrolase  51.1 
 
 
259 aa  248  6e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2563  metallo-beta-lactamase family protein  48.54 
 
 
267 aa  248  6e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1975  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.58 
 
 
259 aa  248  1e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1602  hydroxyacylglutathione hydrolase  55.13 
 
 
268 aa  247  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1743  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.58 
 
 
259 aa  248  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0994564 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1498  metallo-beta-lactamase family protein  55.13 
 
 
268 aa  247  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.950921  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1721  hydroxyacylglutathione hydrolase  51.1 
 
 
259 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.918855  normal  0.991139 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2369  beta-lactamase domain-containing protein  47.81 
 
 
267 aa  247  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000987439  normal  0.0208559 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29620  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.37 
 
 
258 aa  245  4.9999999999999997e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0944915  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2161  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.12 
 
 
295 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000853605  normal  0.0597088 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2327  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.08 
 
 
263 aa  241  9e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000811011  hitchhiker  0.0000970016 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0843  hydroxyacylglutathione hydrolase  51.56 
 
 
223 aa  241  1e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.55491 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2238  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.12 
 
 
295 aa  241  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000229962  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2064  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.74 
 
 
257 aa  241  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.455867  normal  0.0515167 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4897  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.03 
 
 
257 aa  239  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1994  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.58 
 
 
256 aa  239  2.9999999999999997e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.452581  normal  0.438487 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1996  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.35 
 
 
263 aa  239  5e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0422138  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1481  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.62 
 
 
250 aa  238  9e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00263805  normal  0.131466 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2059  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.72 
 
 
263 aa  236  2e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000134001  decreased coverage  0.000104727 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2011  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.35 
 
 
263 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000146784  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1595  Beta-lactamase-like  48.21 
 
 
265 aa  235  5.0000000000000005e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0328  Beta-lactamase-like  47.23 
 
 
257 aa  235  7e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.309918  normal  0.439224 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0498  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.7 
 
 
256 aa  233  2.0000000000000002e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0378559  normal  0.142728 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3483  hydroxyacylglutathione hydrolase  51.11 
 
 
258 aa  231  9e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1536  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.59 
 
 
263 aa  229  3e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0733967  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1776  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.48 
 
 
267 aa  229  5e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000249519  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2184  Beta-lactamase-like  51.48 
 
 
255 aa  227  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1989  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.01 
 
 
272 aa  227  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000136825  hitchhiker  0.000132084 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3714  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  47.6 
 
 
259 aa  225  6e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.610808  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1765  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.54 
 
 
257 aa  224  1e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0422  metallo-beta-lactamase family protein  43.54 
 
 
257 aa  224  1e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0543677  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2021  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.75 
 
 
258 aa  224  1e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000360558  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2611  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.95 
 
 
263 aa  223  3e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00328129  normal  0.860285 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1761  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.49 
 
 
259 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427726  normal  0.639702 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4875  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.76 
 
 
257 aa  222  7e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0842  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.96 
 
 
254 aa  221  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1403  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.41 
 
 
258 aa  221  9.999999999999999e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0310666  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1462  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.8 
 
 
240 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0144845  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0561  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.19 
 
 
250 aa  218  1e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0397  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  47.19 
 
 
250 aa  218  1e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0934  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.06 
 
 
259 aa  218  1e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.421322  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2207  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.32 
 
 
259 aa  218  1e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.181464  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1944  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.78 
 
 
255 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3665  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.54 
 
 
257 aa  215  7e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.952724  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1884  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.06 
 
 
258 aa  215  7e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000396006  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1299  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.49 
 
 
258 aa  214  9.999999999999999e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.744991  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1364  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.49 
 
 
258 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3138  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.8 
 
 
251 aa  212  5.999999999999999e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.319275  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1257  hydroxyacylglutathione hydrolase (glyoxalase II)  38.75 
 
 
254 aa  210  2e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1432  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.91 
 
 
259 aa  210  2e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.949505  normal  0.289854 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2898  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.91 
 
 
257 aa  210  2e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00113363  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2445  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.17 
 
 
257 aa  210  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1258  hydroxyacylglutathione hydrolase (glyoxalase II)  39.48 
 
 
254 aa  209  4e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2406  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.51 
 
 
263 aa  208  9e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000139632  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2841  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.35 
 
 
250 aa  206  3e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1587  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.36 
 
 
255 aa  206  4e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.325978  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2114  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.8 
 
 
260 aa  205  7e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000176506  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5360  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.56 
 
 
263 aa  205  7e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1038  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.59 
 
 
259 aa  205  8e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.769751 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>