More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2438 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_2438  hydroxyacylglutathione hydrolase  100 
 
 
259 aa  523  1e-147  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2510  hydroxyacylglutathione hydrolase  91.12 
 
 
259 aa  481  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.484378  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2733  hydroxyacylglutathione hydrolase  91.12 
 
 
259 aa  480  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.725936  normal  0.296553 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0917  hydroxyacylglutathione hydrolase  76.17 
 
 
258 aa  393  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0932864 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2063  hydroxyacylglutathione hydrolase  75.2 
 
 
255 aa  390  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.136922  hitchhiker  0.00967552 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0448  hydroxyacylglutathione hydrolase  74.02 
 
 
255 aa  383  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.533461  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3080  beta-lactamase-like  47.43 
 
 
255 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120215  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2552  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.22 
 
 
256 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.964384  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2019  hydroxyacylglutathione hydrolase  51.78 
 
 
282 aa  250  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.612705  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0093  hydroxyacylglutathione hydrolase  50 
 
 
255 aa  249  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.117082 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0069  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.39 
 
 
255 aa  248  6e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0614  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.6 
 
 
255 aa  246  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.362443  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0373  beta-lactamase-like protein  48.81 
 
 
255 aa  245  4.9999999999999997e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.717136 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0430  hydroxyacylglutathione hydrolase  50 
 
 
256 aa  244  8e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.255177 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4036  glyoxalase II  45.1 
 
 
256 aa  244  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1898  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.24 
 
 
256 aa  242  3e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1936  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  48.22 
 
 
257 aa  241  7e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1863  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.22 
 
 
260 aa  241  7e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0508  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.21 
 
 
255 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.11609  normal  0.0226917 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7609  putative hydroxyacylglutathione hydrolase (glyoxalase II)  47.64 
 
 
255 aa  239  4e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0185313  normal  0.217404 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0466  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.21 
 
 
255 aa  235  7e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.991116  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1578  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.85 
 
 
256 aa  233  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.156565 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3582  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.43 
 
 
256 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.148531 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2381  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.43 
 
 
256 aa  230  1e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.239292 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1042  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.48 
 
 
256 aa  229  4e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3875  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.43 
 
 
256 aa  228  8e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.197853  normal  0.0865176 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0923  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.74 
 
 
260 aa  225  4e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.319486  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2064  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.38 
 
 
257 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.455867  normal  0.0515167 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2206  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.06 
 
 
255 aa  211  9e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1321  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.66 
 
 
254 aa  207  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47741  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0343  metallo-beta-lactamase family protein  44.67 
 
 
256 aa  203  2e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0969  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.69 
 
 
255 aa  202  6e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2294  putative hydroxyacylglutathione hydrolase (glyoxalase II) (GLX II) protein  42.29 
 
 
255 aa  201  8e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.198098  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1986  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.08 
 
 
278 aa  198  6e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3813  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.66 
 
 
248 aa  197  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2651  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.43 
 
 
258 aa  196  3e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0421465 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1721  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.44 
 
 
259 aa  195  7e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.918855  normal  0.991139 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2691  putative hydroxyacylglutathione hydrolase  40.08 
 
 
256 aa  194  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.25235  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4144  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.65 
 
 
259 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29620  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.43 
 
 
258 aa  192  6e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0944915  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3714  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  41.83 
 
 
259 aa  192  6e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.610808  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3716  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.65 
 
 
259 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.420034  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3270  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.45 
 
 
256 aa  191  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3483  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.2 
 
 
258 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16683  glyoxalase  39.6 
 
 
262 aa  188  5.999999999999999e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2798  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.15 
 
 
272 aa  188  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.233678 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1761  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.04 
 
 
259 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427726  normal  0.639702 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1663  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.81 
 
 
242 aa  186  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.44689 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3469  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.86 
 
 
259 aa  185  6e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0378  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.86 
 
 
248 aa  184  9e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1403  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.27 
 
 
258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0310666  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2184  Beta-lactamase-like  42.97 
 
 
255 aa  180  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3064  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.2 
 
 
242 aa  175  8e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00018038  normal  0.0339192 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4875  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.25 
 
 
257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2091  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.08 
 
 
271 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.700035  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5360  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.06 
 
 
263 aa  172  5.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1944  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.74 
 
 
255 aa  171  7.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002770  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.58 
 
 
252 aa  170  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.18088  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2445  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.68 
 
 
257 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0684  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.15 
 
 
246 aa  169  3e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1678  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.81 
 
 
256 aa  168  6e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1515  putative hydroxyacylglutathione hydrolase protein  42.62 
 
 
284 aa  168  7e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0498  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.95 
 
 
256 aa  168  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0378559  normal  0.142728 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3665  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.29 
 
 
257 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.952724  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2401  putative metallo-beta-lactamase  39.68 
 
 
252 aa  166  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1972  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.54 
 
 
245 aa  167  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.293472 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1828  putative hydroxyacylglutathione hydrolase GloB  37.25 
 
 
252 aa  166  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1895  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.41 
 
 
257 aa  166  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00137094  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3786  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.25 
 
 
257 aa  166  5e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.554974 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_6889  predicted protein  40.09 
 
 
227 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.359449  normal  0.106822 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03213  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.4 
 
 
252 aa  165  8e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1621  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.69 
 
 
264 aa  163  3e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2529  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.84 
 
 
259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.366844  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1481  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.22 
 
 
250 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00263805  normal  0.131466 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0591  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.88 
 
 
258 aa  162  5.0000000000000005e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1364  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.25 
 
 
258 aa  162  7e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1299  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.83 
 
 
258 aa  161  1e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.744991  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1022  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.66 
 
 
269 aa  160  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0561  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.53 
 
 
250 aa  159  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0397  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  43.53 
 
 
250 aa  159  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4897  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.29 
 
 
257 aa  159  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1462  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.52 
 
 
240 aa  159  6e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0144845  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0328  Beta-lactamase-like  35.06 
 
 
257 aa  158  8e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.309918  normal  0.439224 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1765  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.6 
 
 
257 aa  157  1e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0422  metallo-beta-lactamase family protein  37.6 
 
 
257 aa  157  1e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0543677  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2530  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.66 
 
 
257 aa  156  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.785477  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1572  hydroxyacylglutathione hydrolase  38 
 
 
266 aa  157  2e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1975  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.6 
 
 
259 aa  156  4e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2116  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.66 
 
 
257 aa  156  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1595  Beta-lactamase-like  39.34 
 
 
265 aa  155  6e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2187  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.32 
 
 
266 aa  155  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2871  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.5 
 
 
263 aa  155  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00247676  normal  0.571794 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2898  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.06 
 
 
257 aa  155  7e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00113363  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1432  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.8 
 
 
259 aa  155  9e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.949505  normal  0.289854 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2291  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.6 
 
 
257 aa  154  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.276958  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2369  beta-lactamase domain-containing protein  36.68 
 
 
267 aa  154  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000987439  normal  0.0208559 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1994  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.17 
 
 
256 aa  154  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.452581  normal  0.438487 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01981  Hydroxyacylglutathione hydrolase  36.76 
 
 
263 aa  154  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0160657  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1731  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.04 
 
 
279 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00595225  normal  0.648796 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1657  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.64 
 
 
254 aa  153  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.348469 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>