More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2530 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2530  hydroxyacylglutathione hydrolase  100 
 
 		 257 aa  526  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.785477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2116  hydroxyacylglutathione hydrolase  99.22 
 
 		 257 aa  520  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0591  hydroxyacylglutathione hydrolase  63.18 
 
 		 258 aa  320  9.999999999999999e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2651  hydroxyacylglutathione hydrolase  64.06 
 
 		 258 aa  319  3e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0421465 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1975  hydroxyacylglutathione hydrolase  60.38 
 
 		 259 aa  311  7.999999999999999e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1743  hydroxyacylglutathione hydrolase  59.62 
 
 		 259 aa  309  2e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0994564 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0934  hydroxyacylglutathione hydrolase  60.47 
 
 		 259 aa  301  9e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.421322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1678  hydroxyacylglutathione hydrolase  58.98 
 
 		 256 aa  301  1e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2338  hydroxyacylglutathione hydrolase  62.93 
 
 		 259 aa  300  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4897  hydroxyacylglutathione hydrolase  58.75 
 
 		 257 aa  298  8e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1462  hydroxyacylglutathione hydrolase  61.25 
 
 		 240 aa  297  1e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0144845  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2529  hydroxyacylglutathione hydrolase  57.92 
 
 		 259 aa  288  4e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.366844  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2187  hydroxyacylglutathione hydrolase  55.26 
 
 		 266 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1972  hydroxyacylglutathione hydrolase  57.96 
 
 		 245 aa  274  9e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.293472 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2871  hydroxyacylglutathione hydrolase  55.77 
 
 		 263 aa  271  6e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00247676  normal  0.571794 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2206  beta-lactamase-like protein  52.26 
 
 		 266 aa  264  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00363789  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0870  hydroxyacylglutathione hydrolase  54.55 
 
 		 267 aa  261  8e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139904  normal  0.346308 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4144  hydroxyacylglutathione hydrolase  55 
 
 		 259 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1621  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.76 
 
 		 264 aa  259  4e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1721  hydroxyacylglutathione hydrolase  54.23 
 
 		 259 aa  257  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.918855  normal  0.991139 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3716  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.46 
 
 		 259 aa  257  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.420034  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1515  putative hydroxyacylglutathione hydrolase protein  53.73 
 
 		 284 aa  254  8e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2401  putative metallo-beta-lactamase  50.78 
 
 		 252 aa  251  9.000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1828  putative hydroxyacylglutathione hydrolase GloB  50.78 
 
 		 252 aa  251  1e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2011  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.75 
 
 		 263 aa  249  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000146784  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1253  hydroxyacylglutathione hydrolase  55.38 
 
 		 263 aa  249  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.100506  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29620  hydroxyacylglutathione hydrolase  51.92 
 
 		 258 aa  249  3e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0944915  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2327  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.37 
 
 		 263 aa  248  6e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000811011  hitchhiker  0.0000970016 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2114  hydroxyacylglutathione hydrolase  51.14 
 
 		 260 aa  248  6e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000176506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1996  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.37 
 
 		 263 aa  248  8e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0422138  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002770  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.81 
 
 		 252 aa  247  1e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.18088  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2059  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.75 
 
 		 263 aa  246  2e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000134001  decreased coverage  0.000104727 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1258  hydroxyacylglutathione hydrolase  51.88 
 
 		 273 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000343  normal  0.124604 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2563  metallo-beta-lactamase family protein  51.46 
 
 		 267 aa  245  4e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3714  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  51.54 
 
 		 259 aa  245  4e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.610808  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3469  hydroxyacylglutathione hydrolase  51.54 
 
 		 259 aa  245  6e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1595  Beta-lactamase-like  48.52 
 
 		 265 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2064  hydroxyacylglutathione hydrolase  51.15 
 
 		 257 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.455867  normal  0.0515167 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1481  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.78 
 
 		 250 aa  241  7e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00263805  normal  0.131466 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01981  Hydroxyacylglutathione hydrolase  47.88 
 
 		 263 aa  241  7.999999999999999e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0160657  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03213  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.67 
 
 		 252 aa  239  2.9999999999999997e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1022  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.35 
 
 		 269 aa  239  4e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2291  hydroxyacylglutathione hydrolase  50 
 
 		 257 aa  238  5e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.276958  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4429  hydroxyacylglutathione hydrolase  54.02 
 
 		 268 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1776  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.63 
 
 		 267 aa  238  1e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000249519  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2369  beta-lactamase domain-containing protein  49.64 
 
 		 267 aa  237  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000987439  normal  0.0208559 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1999  metallo-beta-lactamase family protein  45.63 
 
 		 265 aa  236  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2161  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.28 
 
 		 295 aa  236  2e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000853605  normal  0.0597088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2238  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.28 
 
 		 295 aa  236  2e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000229962  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1761  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.62 
 
 		 259 aa  236  4e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427726  normal  0.639702 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2788  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.96 
 
 		 268 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000589518  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1895  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.26 
 
 		 257 aa  234  8e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00137094  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1989  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.33 
 
 		 272 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000136825  hitchhiker  0.000132084 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1164  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.46 
 
 		 260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000229771  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1468  metallo-beta-lactamase family protein  53.58 
 
 		 268 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.176854  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0765  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.58 
 
 		 268 aa  233  3e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0558  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.58 
 
 		 268 aa  233  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1275  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.58 
 
 		 268 aa  233  3e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.987461  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0594  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.58 
 
 		 268 aa  233  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0806  hydroxyacylglutathione hydrolase  52.63 
 
 		 273 aa  232  5e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0137889  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1287  hydroxyacylglutathione hydrolase  52.63 
 
 		 273 aa  232  5e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000101374  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2207  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.35 
 
 		 259 aa  231  6e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.181464  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3138  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.53 
 
 		 251 aa  231  8.000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.319275  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2685  metallo-beta-lactamase family protein  47.88 
 
 		 280 aa  231  1e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0199524 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2039  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.37 
 
 		 279 aa  229  3e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2184  Beta-lactamase-like  51.88 
 
 		 255 aa  229  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1176  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.01 
 
 		 273 aa  229  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000239023  normal  0.0635677 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1052  metallo-beta-lactamase family protein  48.06 
 
 		 251 aa  229  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.199482  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1106  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.06 
 
 		 251 aa  229  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1944  hydroxyacylglutathione hydrolase  51.16 
 
 		 255 aa  229  4e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3483  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.08 
 
 		 258 aa  229  4e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1498  metallo-beta-lactamase family protein  53.58 
 
 		 268 aa  228  8e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.950921  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1602  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.58 
 
 		 268 aa  228  8e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2841  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.48 
 
 		 250 aa  228  8e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1731  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.56 
 
 		 279 aa  227  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00595225  normal  0.648796 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1007  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.3 
 
 		 251 aa  228  1e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1536  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.53 
 
 		 263 aa  228  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0733967  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2033  hydroxyacylglutathione hydrolase  52.45 
 
 		 268 aa  227  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000269745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1665  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.08 
 
 		 256 aa  226  4e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1702  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.35 
 
 		 257 aa  225  5.0000000000000005e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0461199  normal  0.908663 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1299  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.29 
 
 		 258 aa  223  3e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.744991  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0498  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.53 
 
 		 256 aa  222  6e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0378559  normal  0.142728 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1364  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.29 
 
 		 258 aa  221  7e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2021  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.11 
 
 		 258 aa  221  8e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000360558  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2406  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.76 
 
 		 263 aa  221  9e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000139632  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0561  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.41 
 
 		 250 aa  220  9.999999999999999e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0397  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  48.41 
 
 		 250 aa  220  9.999999999999999e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1994  hydroxyacylglutathione hydrolase  51.92 
 
 		 256 aa  218  1e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.452581  normal  0.438487 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1572  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.59 
 
 		 266 aa  217  2e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0746  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.53 
 
 		 251 aa  217  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.965541  normal  0.966571 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1141  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.19 
 
 		 251 aa  215  5e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2611  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.62 
 
 		 263 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00328129  normal  0.860285 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0475  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.86 
 
 		 257 aa  211  9e-54  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.178792  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1257  hydroxyacylglutathione hydrolase (glyoxalase II)  44.23 
 
 		 254 aa  211  1e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1432  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.56 
 
 		 259 aa  211  1e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.949505  normal  0.289854 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1587  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.95 
 
 		 255 aa  210  2e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.325978  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1403  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.61 
 
 		 258 aa  209  3e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0310666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0843  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.08 
 
 		 223 aa  208  7e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.55491 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3064  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.38 
 
 		 242 aa  208  8e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00018038  normal  0.0339192 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1038  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.4 
 
 		 259 aa  207  1e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.769751 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>