More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1761 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_1761  hydroxyacylglutathione hydrolase  100 
 
 
259 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427726  normal  0.639702 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3714  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  88.8 
 
 
259 aa  474  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.610808  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4144  hydroxyacylglutathione hydrolase  67.57 
 
 
259 aa  371  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1721  hydroxyacylglutathione hydrolase  67.18 
 
 
259 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.918855  normal  0.991139 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3716  hydroxyacylglutathione hydrolase  67.57 
 
 
259 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.420034  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2064  hydroxyacylglutathione hydrolase  70.38 
 
 
257 aa  367  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.455867  normal  0.0515167 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3469  hydroxyacylglutathione hydrolase  66.02 
 
 
259 aa  362  3e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3483  hydroxyacylglutathione hydrolase  69.5 
 
 
258 aa  358  4e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2184  Beta-lactamase-like  68.34 
 
 
255 aa  347  1e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29620  hydroxyacylglutathione hydrolase  64.09 
 
 
258 aa  337  9e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0944915  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1999  metallo-beta-lactamase family protein  48.67 
 
 
265 aa  252  4.0000000000000004e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03213  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.08 
 
 
252 aa  251  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2651  hydroxyacylglutathione hydrolase  52.53 
 
 
258 aa  249  3e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0421465 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002770  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.08 
 
 
252 aa  249  3e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.18088  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4897  hydroxyacylglutathione hydrolase  55.08 
 
 
257 aa  249  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1621  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.63 
 
 
264 aa  246  2e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1975  hydroxyacylglutathione hydrolase  51.33 
 
 
259 aa  246  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2338  hydroxyacylglutathione hydrolase  52.73 
 
 
259 aa  246  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2401  putative metallo-beta-lactamase  50 
 
 
252 aa  244  9.999999999999999e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2685  metallo-beta-lactamase family protein  48.08 
 
 
280 aa  243  1.9999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0199524 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1743  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.19 
 
 
259 aa  243  3e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0994564 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1678  hydroxyacylglutathione hydrolase  51.35 
 
 
256 aa  242  3.9999999999999997e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0591  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.96 
 
 
258 aa  242  3.9999999999999997e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1106  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.02 
 
 
251 aa  241  6e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1052  metallo-beta-lactamase family protein  49.02 
 
 
251 aa  241  6e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.199482  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1595  Beta-lactamase-like  48.9 
 
 
265 aa  241  1e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1776  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.62 
 
 
267 aa  238  9e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000249519  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1828  putative hydroxyacylglutathione hydrolase GloB  47.69 
 
 
252 aa  237  1e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2530  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.62 
 
 
257 aa  236  4e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.785477  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0934  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.04 
 
 
259 aa  236  4e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.421322  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1944  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.19 
 
 
255 aa  236  4e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2116  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.62 
 
 
257 aa  234  8e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2529  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.47 
 
 
259 aa  234  8e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.366844  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1022  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.69 
 
 
269 aa  232  5e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1462  hydroxyacylglutathione hydrolase  51.5 
 
 
240 aa  231  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0144845  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1972  hydroxyacylglutathione hydrolase  52.67 
 
 
245 aa  230  1e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.293472 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2187  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.1 
 
 
266 aa  229  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3138  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.45 
 
 
251 aa  229  4e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.319275  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01981  Hydroxyacylglutathione hydrolase  46.74 
 
 
263 aa  229  5e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0160657  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1994  hydroxyacylglutathione hydrolase  51.15 
 
 
256 aa  228  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.452581  normal  0.438487 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1895  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.42 
 
 
257 aa  226  3e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00137094  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1536  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.21 
 
 
263 aa  226  4e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0733967  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2207  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.66 
 
 
259 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.181464  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0870  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.89 
 
 
267 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139904  normal  0.346308 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2841  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.51 
 
 
250 aa  224  1e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2871  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.91 
 
 
263 aa  224  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00247676  normal  0.571794 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2206  beta-lactamase-like protein  46.3 
 
 
266 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00363789  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1007  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.45 
 
 
251 aa  224  1e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1515  putative hydroxyacylglutathione hydrolase protein  46.49 
 
 
284 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1572  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.77 
 
 
266 aa  221  7e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41080  putative hydroxyacylglutathione hydrolase  67.08 
 
 
160 aa  221  9e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1731  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.04 
 
 
279 aa  220  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00595225  normal  0.648796 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2059  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.58 
 
 
263 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000134001  decreased coverage  0.000104727 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1765  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.41 
 
 
257 aa  220  1.9999999999999999e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0422  metallo-beta-lactamase family protein  43.41 
 
 
257 aa  220  1.9999999999999999e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0543677  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2039  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.67 
 
 
279 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1403  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.55 
 
 
258 aa  220  1.9999999999999999e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0310666  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1996  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.21 
 
 
263 aa  219  3e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0422138  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1141  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.31 
 
 
251 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2327  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.84 
 
 
263 aa  218  7e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000811011  hitchhiker  0.0000970016 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0561  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.9 
 
 
250 aa  217  2e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0397  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  46.9 
 
 
250 aa  217  2e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2011  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.84 
 
 
263 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000146784  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2563  metallo-beta-lactamase family protein  45.62 
 
 
267 aa  216  4e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1253  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.3 
 
 
263 aa  215  5e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.100506  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2114  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.97 
 
 
260 aa  215  5e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000176506  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1702  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.4 
 
 
257 aa  215  5.9999999999999996e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0461199  normal  0.908663 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2161  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.79 
 
 
295 aa  214  8e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000853605  normal  0.0597088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2238  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.79 
 
 
295 aa  214  9e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000229962  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1884  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.45 
 
 
258 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000396006  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2369  beta-lactamase domain-containing protein  47.08 
 
 
267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000987439  normal  0.0208559 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1481  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.36 
 
 
250 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00263805  normal  0.131466 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2611  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.3 
 
 
263 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00328129  normal  0.860285 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1578  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.21 
 
 
256 aa  212  5.999999999999999e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.156565 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1587  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.35 
 
 
255 aa  211  7e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.325978  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2291  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.38 
 
 
257 aa  211  9e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.276958  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0498  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.61 
 
 
256 aa  210  2e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0378559  normal  0.142728 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2798  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.44 
 
 
272 aa  209  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.233678 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1986  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.23 
 
 
278 aa  209  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0746  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.35 
 
 
251 aa  207  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.965541  normal  0.966571 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1258  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.19 
 
 
273 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000343  normal  0.124604 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0226  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.79 
 
 
251 aa  206  4e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.107285  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1468  metallo-beta-lactamase family protein  46.18 
 
 
268 aa  205  8e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.176854  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0765  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.18 
 
 
268 aa  205  8e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0594  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.18 
 
 
268 aa  205  8e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0558  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.18 
 
 
268 aa  205  8e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1275  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.18 
 
 
268 aa  205  8e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.987461  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0328  Beta-lactamase-like  45.45 
 
 
257 aa  204  9e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.309918  normal  0.439224 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0217  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.4 
 
 
251 aa  204  9e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.950184  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0208  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.4 
 
 
251 aa  204  9e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3396  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.4 
 
 
251 aa  204  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0224  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.4 
 
 
251 aa  204  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00205  predicted hydroxyacylglutathione hydrolase  44.4 
 
 
251 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.374196  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00210  hypothetical protein  44.4 
 
 
251 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.354314  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3453  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.4 
 
 
251 aa  204  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.837088  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3786  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.7 
 
 
257 aa  203  2e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.554974 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0216  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.02 
 
 
251 aa  202  3e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00257158  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0917  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.76 
 
 
258 aa  202  4e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0932864 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0842  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.02 
 
 
254 aa  202  5e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4875  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.56 
 
 
257 aa  202  6e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>