More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2552 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2552  hydroxyacylglutathione hydrolase  100 
 
 		 256 aa  525  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.964384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4036  glyoxalase II  65.23 
 
 		 256 aa  351  8e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3582  hydroxyacylglutathione hydrolase  68.36 
 
 		 256 aa  340  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.148531 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3875  hydroxyacylglutathione hydrolase  67.97 
 
 		 256 aa  333  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.197853  normal  0.0865176 
 
 
-
 
NC_004310  BR1936  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  62.45 
 
 		 257 aa  317  1e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1863  hydroxyacylglutathione hydrolase  62.45 
 
 		 260 aa  317  1e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0923  hydroxyacylglutathione hydrolase  62.45 
 
 		 260 aa  310  1e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.319486  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1578  hydroxyacylglutathione hydrolase  57.03 
 
 		 256 aa  308  5.9999999999999995e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156565 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3080  beta-lactamase-like  57.71 
 
 		 255 aa  307  9e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120215  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2381  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.52 
 
 		 256 aa  278  5e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.239292 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1898  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.44 
 
 		 256 aa  268  4e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2019  hydroxyacylglutathione hydrolase  52.78 
 
 		 282 aa  268  4e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.612705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1986  hydroxyacylglutathione hydrolase  52.73 
 
 		 278 aa  268  5.9999999999999995e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0093  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.2 
 
 		 255 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.117082 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0069  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.59 
 
 		 255 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0373  beta-lactamase-like protein  51 
 
 		 255 aa  265  5.999999999999999e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.717136 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0343  metallo-beta-lactamase family protein  51.44 
 
 		 256 aa  264  1e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0508  hydroxyacylglutathione hydrolase  51.78 
 
 		 255 aa  262  4e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.11609  normal  0.0226917 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2691  putative hydroxyacylglutathione hydrolase  54.36 
 
 		 256 aa  260  1e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.25235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16683  glyoxalase  50 
 
 		 262 aa  259  2e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7609  putative hydroxyacylglutathione hydrolase (glyoxalase II)  50.4 
 
 		 255 aa  258  6e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0185313  normal  0.217404 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0430  hydroxyacylglutathione hydrolase  51.42 
 
 		 256 aa  258  7e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.255177 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2733  hydroxyacylglutathione hydrolase  50 
 
 		 259 aa  258  8e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.725936  normal  0.296553 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2510  hydroxyacylglutathione hydrolase  50 
 
 		 259 aa  257  1e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.484378  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2206  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.59 
 
 		 255 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0614  hydroxyacylglutathione hydrolase  49 
 
 		 255 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.362443  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2438  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.22 
 
 		 259 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0448  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.2 
 
 		 255 aa  249  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.533461  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0466  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.8 
 
 		 255 aa  247  1e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.991116  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2063  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.01 
 
 		 255 aa  246  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.136922  hitchhiker  0.00967552 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1321  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.04 
 
 		 254 aa  243  3e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47741  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2294  putative hydroxyacylglutathione hydrolase (glyoxalase II) (GLX II) protein  48.22 
 
 		 255 aa  238  8e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.198098  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0969  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.83 
 
 		 255 aa  237  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3270  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.88 
 
 		 256 aa  235  7e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2091  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.55 
 
 		 271 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.700035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0378  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.61 
 
 		 248 aa  230  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3064  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.77 
 
 		 242 aa  230  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00018038  normal  0.0339192 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0917  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.92 
 
 		 258 aa  229  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0932864 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1663  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.43 
 
 		 242 aa  229  5e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.44689 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3813  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.83 
 
 		 248 aa  228  7e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1042  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.7 
 
 		 256 aa  223  2e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_6889  predicted protein  48.46 
 
 		 227 aa  219  3e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.359449  normal  0.106822 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4875  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.8 
 
 		 257 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3786  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.2 
 
 		 257 aa  210  2e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.554974 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2445  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.86 
 
 		 257 aa  206  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0328  Beta-lactamase-like  42.8 
 
 		 257 aa  206  4e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.309918  normal  0.439224 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2798  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.07 
 
 		 272 aa  206  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.233678 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1403  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.46 
 
 		 258 aa  205  6e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0310666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0684  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.95 
 
 		 246 aa  204  9e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3665  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.08 
 
 		 257 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.952724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3716  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.54 
 
 		 259 aa  202  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.420034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1721  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.15 
 
 		 259 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.918855  normal  0.991139 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5360  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.58 
 
 		 263 aa  202  6e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2064  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.57 
 
 		 257 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.455867  normal  0.0515167 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4144  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.77 
 
 		 259 aa  198  7e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1657  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.56 
 
 		 254 aa  198  7.999999999999999e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1761  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.28 
 
 		 259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427726  normal  0.639702 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2116  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.38 
 
 		 257 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2530  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.38 
 
 		 257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.785477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2651  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.24 
 
 		 258 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0421465 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3714  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  44.44 
 
 		 259 aa  195  6e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.610808  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29620  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.54 
 
 		 258 aa  191  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0944915  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3469  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.38 
 
 		 259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2898  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.86 
 
 		 257 aa  189  4e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00113363  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1235  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.7 
 
 		 256 aa  188  7e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0229191  normal  0.0959861 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3483  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.02 
 
 		 258 aa  188  8e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0591  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.65 
 
 		 258 aa  187  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1515  putative hydroxyacylglutathione hydrolase protein  42.65 
 
 		 284 aa  186  4e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1621  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.53 
 
 		 264 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1972  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.34 
 
 		 245 aa  181  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.293472 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2401  putative metallo-beta-lactamase  40.08 
 
 		 252 aa  180  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2369  beta-lactamase domain-containing protein  41.15 
 
 		 267 aa  180  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000987439  normal  0.0208559 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2184  Beta-lactamase-like  44.18 
 
 		 255 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1944  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.31 
 
 		 255 aa  177  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2841  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.68 
 
 		 250 aa  177  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1536  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.41 
 
 		 263 aa  177  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0733967  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1572  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.77 
 
 		 266 aa  175  5e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2338  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.31 
 
 		 259 aa  175  6e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2187  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.93 
 
 		 266 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1481  hydroxyacylglutathione hydrolase  40 
 
 		 250 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00263805  normal  0.131466 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4897  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.08 
 
 		 257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0561  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.13 
 
 		 250 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0397  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  41.13 
 
 		 250 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1895  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.77 
 
 		 257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00137094  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2529  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.9 
 
 		 259 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.366844  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1052  metallo-beta-lactamase family protein  39.02 
 
 		 251 aa  173  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.199482  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1106  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.02 
 
 		 251 aa  173  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2685  metallo-beta-lactamase family protein  39.02 
 
 		 280 aa  172  3.9999999999999995e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0199524 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1999  metallo-beta-lactamase family protein  38.04 
 
 		 265 aa  171  9e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1595  Beta-lactamase-like  39.11 
 
 		 265 aa  170  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1975  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.04 
 
 		 259 aa  169  4e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03213  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.72 
 
 		 252 aa  169  4e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1678  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.56 
 
 		 256 aa  169  4e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002770  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.5 
 
 		 252 aa  168  8e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.18088  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3138  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.21 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.319275  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1743  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.64 
 
 		 259 aa  167  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0994564 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1994  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.55 
 
 		 256 aa  167  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.452581  normal  0.438487 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01981  Hydroxyacylglutathione hydrolase  39.44 
 
 		 263 aa  167  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0160657  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2206  beta-lactamase-like protein  40.52 
 
 		 266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00363789  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2161  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.23 
 
 		 295 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000853605  normal  0.0597088 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>