52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1284 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1284  metallo-beta-lactamase family protein  100 
 
 		 325 aa  674    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1495  beta-lactamase-like  47.71 
 
 		 322 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1122  beta-lactamase-like protein  43.21 
 
 		 322 aa  291  1e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000282936  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1837  beta-lactamase domain protein  42.08 
 
 		 299 aa  222  7e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3638  beta-lactamase domain-containing protein  38.32 
 
 		 286 aa  219  6e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.573408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0614  beta-lactamase-like  39.15 
 
 		 314 aa  205  8e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.381863  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1997  beta-lactamase domain-containing protein  23.89 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2285  beta-lactamase-like  23.38 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0817874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1485  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000168088  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1524  beta-lactamase domain-containing protein  25.43 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06040  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  24.38 
 
 		 303 aa  57  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.692713 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2963  beta-lactamase domain-containing protein  25.63 
 
 		 298 aa  55.8  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.955909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4851  beta-lactamase domain protein  23.32 
 
 		 296 aa  55.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2843  beta-lactamase-like protein  25.65 
 
 		 247 aa  53.5  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1793  beta-lactamase domain-containing protein  27.33 
 
 		 243 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25410  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  23.12 
 
 		 259 aa  53.1  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3924  hypothetical protein  24.54 
 
 		 242 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46150  hypothetical protein  24.54 
 
 		 242 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.217943 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1453  Beta-lactamase-like  26.34 
 
 		 241 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  21.82 
 
 		 321 aa  50.1  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2363  putative flavoprotein  27.87 
 
 		 508 aa  48.9  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  30.43 
 
 		 213 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1619  zinc-dependent hydrolase  22.08 
 
 		 261 aa  48.9  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0203  beta-lactamase domain-containing protein  23.7 
 
 		 263 aa  47.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0208476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0272  beta-lactamase domain protein  22.73 
 
 		 245 aa  47.8  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000021825  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0083  Beta-lactamase-like  25.34 
 
 		 304 aa  47.4  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  24.3 
 
 		 215 aa  46.6  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.755925 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8910  beta-lactamase domain protein  24.26 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0116  putative hydrolase  25.98 
 
 		 284 aa  45.8  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5378  beta-lactamase domain protein  32.32 
 
 		 462 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  23.24 
 
 		 323 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1251  beta-lactamase domain-containing protein  32.65 
 
 		 196 aa  45.1  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.809975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1506  cysteine desulfurase  24.82 
 
 		 753 aa  45.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2397  putative hydrolase  26.67 
 
 		 210 aa  44.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.322158 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2790  beta-lactamase domain protein  29.85 
 
 		 246 aa  44.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2127  beta-lactamase domain protein  21.8 
 
 		 213 aa  44.3  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0013409  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3064  hydroxyacylglutathione hydrolase  22.79 
 
 		 242 aa  43.5  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00018038  normal  0.0339192 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5378  beta-lactamase domain protein  29.66 
 
 		 293 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13255  normal  0.647715 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  29.55 
 
 		 354 aa  43.9  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  26.36 
 
 		 217 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2552  hydroxyacylglutathione hydrolase  20.51 
 
 		 256 aa  43.5  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.964384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1854  beta-lactamase domain protein  20.59 
 
 		 272 aa  43.9  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189866  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3296  putative hydrolase  29 
 
 		 229 aa  43.5  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4188  beta-lactamase domain-containing protein  23.93 
 
 		 361 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0757  beta-lactamase domain protein  27.84 
 
 		 244 aa  43.5  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.717339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0467  metallo-beta-lactamase family protein  23.43 
 
 		 262 aa  43.5  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.56187 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  24.16 
 
 		 214 aa  43.1  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2125  putative hydrolase  28.57 
 
 		 203 aa  43.1  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5314  beta-lactamase domain protein  23.84 
 
 		 268 aa  42.7  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.498114 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0566  beta-lactamase domain protein  23.04 
 
 		 378 aa  42.7  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00148503  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3631  beta-lactamase domain protein  32.65 
 
 		 374 aa  42.4  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.162031  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0513  beta-lactamase domain-containing protein  23.45 
 
 		 617 aa  42.4  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>