More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2285 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2285  beta-lactamase-like  100 
 
 		 311 aa  646    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0817874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06040  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.78 
 
 		 303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.692713 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1619  zinc-dependent hydrolase  34.24 
 
 		 261 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2620  beta-lactamase domain-containing protein  33.61 
 
 		 253 aa  137  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2963  beta-lactamase domain-containing protein  33.95 
 
 		 298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.955909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17250  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.5 
 
 		 347 aa  101  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.733457 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4871  beta-lactamase domain protein  28.82 
 
 		 240 aa  97.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.936336  normal  0.586773 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1929  beta-lactamase domain-containing protein  30.77 
 
 		 255 aa  95.1  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.298264 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46150  hypothetical protein  29.25 
 
 		 242 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.217943 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1524  beta-lactamase domain-containing protein  35.44 
 
 		 243 aa  87  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1485  beta-lactamase domain-containing protein  32.39 
 
 		 243 aa  86.3  6e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000168088  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1453  Beta-lactamase-like  27.14 
 
 		 241 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3924  hypothetical protein  28.77 
 
 		 242 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2843  beta-lactamase-like protein  33.71 
 
 		 247 aa  84.3  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1793  beta-lactamase domain-containing protein  27.91 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0272  beta-lactamase domain protein  26.74 
 
 		 245 aa  74.3  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000021825  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0660  beta-lactamase domain-containing protein  28.49 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000276126  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1495  beta-lactamase-like  27.12 
 
 		 322 aa  66.6  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0614  beta-lactamase-like  25.88 
 
 		 314 aa  65.5  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.381863  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  28.65 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  25.43 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  26.87 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0161  beta-lactamase domain-containing protein  25.63 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  25.71 
 
 		 211 aa  58.9  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2524  beta-lactamase domain-containing protein  27.53 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  26.6 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3058  beta-lactamase-like  24.88 
 
 		 329 aa  57.8  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1469  beta-lactamase domain-containing protein  22.3 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1284  metallo-beta-lactamase family protein  34.12 
 
 		 325 aa  56.2  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0121  beta-lactamase-like protein  27.11 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.381436  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1782  Metallo-beta-lactamase  24.73 
 
 		 217 aa  55.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  28.3 
 
 		 287 aa  55.8  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  25.37 
 
 		 213 aa  54.7  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  26.06 
 
 		 209 aa  54.7  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  23.39 
 
 		 214 aa  54.3  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0646  beta-lactamase domain protein  29.17 
 
 		 226 aa  54.3  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3638  beta-lactamase domain-containing protein  26.44 
 
 		 286 aa  53.9  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.573408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0890  glyoxylase II family protein  23.89 
 
 		 218 aa  53.9  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389063  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0685  beta-lactamase domain protein  27.4 
 
 		 267 aa  53.5  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1122  beta-lactamase-like protein  34.52 
 
 		 322 aa  53.5  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000282936  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1837  beta-lactamase domain protein  22.9 
 
 		 299 aa  53.5  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4274  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  23.63 
 
 		 306 aa  53.5  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02708  hypothetical protein  28.03 
 
 		 218 aa  52.8  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  25.1 
 
 		 318 aa  52.8  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0043  beta-lactamase domain-containing protein  29.09 
 
 		 200 aa  52.4  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  25 
 
 		 215 aa  52.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  25 
 
 		 215 aa  52.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  25 
 
 		 215 aa  52.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  25 
 
 		 215 aa  52.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  25 
 
 		 215 aa  52.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4704  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 		 325 aa  52  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0086  beta-lactamase-like  31.5 
 
 		 311 aa  52.4  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1067  hypothetical protein  25.71 
 
 		 309 aa  52  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.21331  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0436  beta-lactamase domain protein  23.21 
 
 		 306 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0583  beta-lactamase domain-containing protein  23.81 
 
 		 307 aa  51.6  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.266418 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  23.71 
 
 		 209 aa  51.2  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2719  beta-lactamase domain protein  28.09 
 
 		 218 aa  51.2  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.227848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  30.15 
 
 		 315 aa  51.6  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12601  glyoxalase II (hydroxyacylglutathione hydrolase)  26.62 
 
 		 246 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0111807  normal  0.957918 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3024  beta-lactamase domain protein  29.22 
 
 		 310 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0101087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1411  beta-lactamase domain-containing protein  27.61 
 
 		 214 aa  51.6  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.557584  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0052  beta-lactamase domain-containing protein  27.72 
 
 		 200 aa  51.6  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  25.68 
 
 		 318 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06001  metallo-beta-lactamase domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G00120)  25.85 
 
 		 309 aa  50.8  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.355889  normal  0.401572 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  24.87 
 
 		 209 aa  50.4  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  25.54 
 
 		 318 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25370  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  25.73 
 
 		 207 aa  50.8  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.555955 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0068  metallo-beta-lactamase superfamily protein  28.39 
 
 		 212 aa  50.8  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0554126  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0125  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  24.54 
 
 		 218 aa  50.8  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.477047  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  25.67 
 
 		 209 aa  50.8  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2269  beta-lactamase domain-containing protein  26.92 
 
 		 214 aa  50.8  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.289735 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  23.78 
 
 		 231 aa  50.8  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0536  beta-lactamase domain protein  42 
 
 		 226 aa  50.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0161694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0793  beta-lactamase domain-containing protein  31.86 
 
 		 556 aa  50.4  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.541294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0122  beta-lactamase-like  24.22 
 
 		 212 aa  50.1  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.151592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2824  beta-lactamase domain-containing protein  25.32 
 
 		 286 aa  50.1  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.293664  hitchhiker  0.000382872 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  28.26 
 
 		 217 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2184  beta-lactamase domain-containing protein  27.22 
 
 		 215 aa  50.1  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0861591  normal  0.0986326 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2733  beta-lactamase domain-containing protein  30.06 
 
 		 325 aa  50.1  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1235  beta-lactamase-like  26.4 
 
 		 295 aa  49.7  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.643095  normal  0.0366717 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1997  beta-lactamase domain-containing protein  32.94 
 
 		 268 aa  49.7  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1544  beta-lactamase domain protein  27.72 
 
 		 294 aa  49.7  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.393561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2112  beta-lactamase domain protein  28.35 
 
 		 310 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  22.68 
 
 		 209 aa  49.3  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0368  beta-lactamase-like protein  23.2 
 
 		 374 aa  49.3  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.967784  normal  0.392052 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2821  beta-lactamase-like  26.71 
 
 		 237 aa  49.3  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0841  Beta-lactamase-like  24.47 
 
 		 213 aa  48.9  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0225813 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1728  beta-lactamase domain-containing protein  24.85 
 
 		 215 aa  48.9  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3547  hypothetical protein  26 
 
 		 255 aa  48.9  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0051  beta-lactamase domain-containing protein  25.48 
 
 		 334 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  24.36 
 
 		 213 aa  48.9  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2893  beta-lactamase domain protein  28.36 
 
 		 271 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1776  beta-lactamase domain-containing protein  28.35 
 
 		 310 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1824  beta-lactamase domain-containing protein  24.62 
 
 		 342 aa  48.9  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00672926 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  24.17 
 
 		 324 aa  48.5  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000197877 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2600  beta-lactamase domain-containing protein  25.28 
 
 		 345 aa  48.5  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0267  beta-lactamase domain-containing protein  26.71 
 
 		 214 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0285  beta-lactamase domain-containing protein  26.71 
 
 		 214 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394027  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  29.94 
 
 		 315 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0369  beta-lactamase domain protein  24.02 
 
 		 298 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>