252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_17250 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_17250  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  100 
 
 		 347 aa  679    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.733457 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2620  beta-lactamase domain-containing protein  28.9 
 
 		 253 aa  106  8e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2285  beta-lactamase-like  30.5 
 
 		 311 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0817874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06040  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  34.89 
 
 		 303 aa  100  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.692713 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3924  hypothetical protein  32.54 
 
 		 242 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46150  hypothetical protein  32.54 
 
 		 242 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.217943 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1793  beta-lactamase domain-containing protein  32.54 
 
 		 243 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1453  Beta-lactamase-like  30.95 
 
 		 241 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2963  beta-lactamase domain-containing protein  32.06 
 
 		 298 aa  90.5  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.955909  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1619  zinc-dependent hydrolase  27.8 
 
 		 261 aa  90.1  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2843  beta-lactamase-like protein  31.47 
 
 		 247 aa  90.1  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1929  beta-lactamase domain-containing protein  29.06 
 
 		 255 aa  87.8  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.298264 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0272  beta-lactamase domain protein  30.77 
 
 		 245 aa  68.2  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000021825  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2879  AMP-dependent synthetase and ligase  30.94 
 
 		 862 aa  67.8  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4871  beta-lactamase domain protein  24.04 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.936336  normal  0.586773 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0336  beta-lactamase domain-containing protein  32.77 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1653  beta-lactamase domain-containing protein  32.43 
 
 		 238 aa  62  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.139658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4704  beta-lactamase domain protein  24.69 
 
 		 325 aa  61.2  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  26.88 
 
 		 363 aa  60.5  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  51.85 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1524  beta-lactamase domain-containing protein  31.71 
 
 		 243 aa  58.5  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3722  beta-lactamase domain-containing protein  50.98 
 
 		 206 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1485  beta-lactamase domain-containing protein  30.83 
 
 		 243 aa  58.9  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000168088  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  28.71 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0321  beta-lactamase domain-containing protein  42.59 
 
 		 202 aa  58.2  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  26.19 
 
 		 231 aa  58.5  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1067  hypothetical protein  26.13 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.21331  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1013  beta-lactamase domain protein  25.72 
 
 		 322 aa  56.2  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.151542  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0368  beta-lactamase-like protein  53.06 
 
 		 374 aa  55.5  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.967784  normal  0.392052 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  28.46 
 
 		 329 aa  55.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  33.87 
 
 		 212 aa  55.5  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  35.42 
 
 		 213 aa  55.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  22.98 
 
 		 324 aa  55.1  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000197877 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1506  beta-lactamase-like protein  28.37 
 
 		 320 aa  55.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  22.77 
 
 		 209 aa  54.3  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2600  beta-lactamase domain-containing protein  26 
 
 		 345 aa  54.7  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8202  beta-lactamase domain-containing protein  32.03 
 
 		 339 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10245  predicted protein  26.81 
 
 		 285 aa  53.9  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00334407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2687  beta-lactamase domain protein  53.06 
 
 		 195 aa  53.5  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0467  metallo-beta-lactamase family protein  47.14 
 
 		 262 aa  53.5  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.56187 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0052  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 200 aa  53.5  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  26.13 
 
 		 310 aa  53.1  0.000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8278  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  31.28 
 
 		 348 aa  53.1  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  43.14 
 
 		 206 aa  52.8  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0043  beta-lactamase domain-containing protein  51.92 
 
 		 200 aa  52.8  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06001  metallo-beta-lactamase domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G00120)  29.37 
 
 		 309 aa  52.4  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.355889  normal  0.401572 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  24.12 
 
 		 213 aa  52.4  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2888  beta-lactamase domain protein  27.67 
 
 		 296 aa  52  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3186  beta-lactamase domain-containing protein  41.89 
 
 		 271 aa  52  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  26.42 
 
 		 251 aa  52.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0660  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 279 aa  52  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000276126  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2893  beta-lactamase domain protein  40.79 
 
 		 271 aa  52  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1728  beta-lactamase domain protein  26.16 
 
 		 324 aa  52  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2131  beta-lactamase domain protein  33.85 
 
 		 337 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10570  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  45.57 
 
 		 218 aa  51.6  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.193193  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  49.02 
 
 		 208 aa  51.6  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  42.31 
 
 		 210 aa  50.8  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4870  beta-lactamase domain protein  30.88 
 
 		 341 aa  51.2  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.434908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  24.23 
 
 		 231 aa  50.8  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2059  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 350 aa  50.4  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000271524  normal  0.300872 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  35.96 
 
 		 220 aa  50.8  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1429  beta-lactamase domain-containing protein  30.11 
 
 		 306 aa  50.4  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1544  beta-lactamase domain protein  27.92 
 
 		 294 aa  50.4  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.393561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0914  beta-lactamase-like protein  43.24 
 
 		 238 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.189009  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0931  beta-lactamase domain-containing protein  43.24 
 
 		 238 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2512  beta-lactamase domain protein  50.98 
 
 		 214 aa  50.1  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  52.94 
 
 		 240 aa  49.7  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0051  beta-lactamase domain-containing protein  29.61 
 
 		 334 aa  49.7  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  46 
 
 		 208 aa  49.3  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5314  beta-lactamase domain protein  31.9 
 
 		 268 aa  48.5  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.498114 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1448  beta-lactamase-like  47.62 
 
 		 216 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0528  beta-lactamase-like protein  26.71 
 
 		 317 aa  48.9  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000304282  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3798  beta-lactamase domain protein  28.03 
 
 		 324 aa  48.9  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.273419  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0711  beta-lactamase domain-containing protein  34.48 
 
 		 217 aa  48.5  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1196  beta-lactamase domain protein  42 
 
 		 235 aa  48.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.269825  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2691  putative hydroxyacylglutathione hydrolase  28.91 
 
 		 256 aa  48.1  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.25235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5067  beta-lactamase domain-containing protein  46.77 
 
 		 215 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.512117  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2457  beta-lactamase domain-containing protein  51.06 
 
 		 327 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130811  normal  0.600713 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2460  beta-lactamase-like  35.09 
 
 		 191 aa  48.5  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  31.68 
 
 		 305 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2827  beta-lactamase domain-containing protein  24.12 
 
 		 214 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0208272 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0512  beta-lactamase domain protein  34.48 
 
 		 315 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0203  beta-lactamase domain-containing protein  40.85 
 
 		 263 aa  48.5  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0208476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4851  beta-lactamase domain protein  32.33 
 
 		 296 aa  48.5  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0793  beta-lactamase domain-containing protein  46.43 
 
 		 556 aa  48.1  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.541294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0692  beta-lactamase domain-containing protein  30.56 
 
 		 316 aa  48.1  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0390  beta-lactamase domain protein  31.28 
 
 		 318 aa  48.5  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0942  beta-lactamase domain-containing protein  35.2 
 
 		 238 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2551  putative hydrolase  31.65 
 
 		 209 aa  47.8  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.505017  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1402  beta-lactamase domain-containing protein  40.85 
 
 		 204 aa  47.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1211  beta-lactamase domain protein  44.23 
 
 		 211 aa  47.8  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000331215  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0546  beta-lactamase-like protein  24.54 
 
 		 297 aa  47.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.858223  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1745  beta-lactamase-like protein  31.25 
 
 		 335 aa  47.8  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.931232  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1666  beta-lactamase domain-containing protein  25.59 
 
 		 328 aa  47.8  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5123  beta-lactamase domain-containing protein  41.89 
 
 		 238 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  42.31 
 
 		 198 aa  47.4  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0859  beta-lactamase domain-containing protein  23.19 
 
 		 304 aa  47.4  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  24.35 
 
 		 206 aa  47.4  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1171  beta-lactamase domain protein  41.18 
 
 		 303 aa  47.4  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0890  glyoxylase II family protein  38.89 
 
 		 218 aa  47.4  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>