182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_06040 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_06040  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  100 
 
 		 303 aa  627  1e-179  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.692713 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2285  beta-lactamase-like  32.78 
 
 		 311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0817874  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1619  zinc-dependent hydrolase  31.25 
 
 		 261 aa  132  9e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2963  beta-lactamase domain-containing protein  32.93 
 
 		 298 aa  124  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.955909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2620  beta-lactamase domain-containing protein  27.76 
 
 		 253 aa  100  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17250  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  36.07 
 
 		 347 aa  100  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.733457 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1453  Beta-lactamase-like  30.13 
 
 		 241 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0272  beta-lactamase domain protein  27.71 
 
 		 245 aa  90.1  5e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000021825  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1485  beta-lactamase domain-containing protein  28.63 
 
 		 243 aa  87  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000168088  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1929  beta-lactamase domain-containing protein  30.08 
 
 		 255 aa  86.3  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.298264 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3924  hypothetical protein  30.22 
 
 		 242 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1524  beta-lactamase domain-containing protein  28.19 
 
 		 243 aa  84.7  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46150  hypothetical protein  30.22 
 
 		 242 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.217943 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2843  beta-lactamase-like protein  30.52 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1793  beta-lactamase domain-containing protein  29.69 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4871  beta-lactamase domain protein  26.94 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.936336  normal  0.586773 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0660  beta-lactamase domain-containing protein  25.41 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000276126  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  26.36 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1013  beta-lactamase domain protein  27.35 
 
 		 322 aa  60.1  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.151542  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1902  beta-lactamase domain-containing protein  29.89 
 
 		 287 aa  58.9  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.392348  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  25.11 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0614  beta-lactamase-like  28.24 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.381863  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2186  beta-lactamase domain protein  28.5 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.704345 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1031  beta-lactamase domain protein  24 
 
 		 323 aa  55.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210455  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1284  metallo-beta-lactamase family protein  25.1 
 
 		 325 aa  53.9  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  27.03 
 
 		 249 aa  53.9  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0157  Beta-lactamase-like  29.56 
 
 		 314 aa  53.1  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3186  beta-lactamase domain-containing protein  32.14 
 
 		 271 aa  53.1  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3157  beta-lactamase domain protein  27.98 
 
 		 205 aa  53.1  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1661  beta-lactamase domain protein  27.98 
 
 		 241 aa  52.4  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  23.87 
 
 		 310 aa  52  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  26.88 
 
 		 209 aa  51.6  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2059  beta-lactamase domain-containing protein  26.58 
 
 		 310 aa  51.6  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0322253 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  26.29 
 
 		 208 aa  52  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1653  beta-lactamase domain-containing protein  28.72 
 
 		 238 aa  52  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.139658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1171  beta-lactamase domain protein  25.51 
 
 		 303 aa  52  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2884  beta-lactamase domain protein  29 
 
 		 191 aa  52  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  25.59 
 
 		 209 aa  51.6  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4704  beta-lactamase domain protein  24.71 
 
 		 325 aa  51.6  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3058  beta-lactamase-like  23.89 
 
 		 329 aa  51.2  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2513  beta-lactamase domain protein  27.78 
 
 		 192 aa  51.6  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2893  beta-lactamase domain protein  30.21 
 
 		 271 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0052  beta-lactamase domain-containing protein  25.7 
 
 		 200 aa  51.2  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  24.4 
 
 		 201 aa  50.8  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  25.84 
 
 		 251 aa  50.4  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2087  hydrolase  29.82 
 
 		 224 aa  50.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6103  beta-lactamase-like protein  29.95 
 
 		 231 aa  50.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  25.12 
 
 		 209 aa  50.1  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1442  beta-lactamase domain protein  35.64 
 
 		 203 aa  49.7  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0282  beta-lactamase domain protein  43.94 
 
 		 213 aa  49.7  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.396725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3062  beta-lactamase domain-containing protein  29.75 
 
 		 297 aa  49.3  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  31.19 
 
 		 214 aa  49.7  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  22.66 
 
 		 209 aa  49.3  0.00008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3638  beta-lactamase domain-containing protein  28.42 
 
 		 286 aa  49.3  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.573408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10245  predicted protein  23.72 
 
 		 285 aa  49.3  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00334407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  25.26 
 
 		 298 aa  48.9  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0462  beta-lactamase-like  23.79 
 
 		 292 aa  48.9  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  25.62 
 
 		 210 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  24.37 
 
 		 209 aa  48.9  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1235  beta-lactamase-like  24.04 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.643095  normal  0.0366717 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5314  beta-lactamase domain protein  27.39 
 
 		 268 aa  48.5  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.498114 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1336  beta-lactamase domain-containing protein  28.43 
 
 		 256 aa  48.9  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.542543 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  22.12 
 
 		 210 aa  48.9  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1817  beta-lactamase domain protein  26.19 
 
 		 208 aa  48.5  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000015217  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06001  metallo-beta-lactamase domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G00120)  27.98 
 
 		 309 aa  48.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.355889  normal  0.401572 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0050  Beta-lactamase-like  28.73 
 
 		 334 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  25.6 
 
 		 211 aa  48.1  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  26.67 
 
 		 329 aa  48.1  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1495  beta-lactamase-like  26.59 
 
 		 322 aa  48.1  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  26.04 
 
 		 215 aa  48.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1958  beta-lactamase domain-containing protein  24.4 
 
 		 209 aa  47.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0890  glyoxylase II family protein  23.81 
 
 		 218 aa  48.1  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389063  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0066  beta-lactamase domain protein  28.96 
 
 		 334 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391302  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0900  metallo-beta-lactamase family protein  22.64 
 
 		 198 aa  47.8  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2397  beta-lactamase domain-containing protein  25.81 
 
 		 344 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.21584  normal  0.814785 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1181  beta-lactamase domain protein  26.09 
 
 		 203 aa  47.4  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0463  beta-lactamase domain protein  27.18 
 
 		 192 aa  47  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00512512  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0741  putative metallo-beta-lactamase family protein  25.81 
 
 		 344 aa  47  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.844995  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0125  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  32.99 
 
 		 218 aa  47  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.477047  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4202  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 317 aa  47  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2461  beta-lactamase domain-containing protein  25.81 
 
 		 344 aa  47  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.889355 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2346  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 226 aa  47  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0054  beta-lactamase domain protein  28.18 
 
 		 334 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3893  beta-lactamase-like  25.65 
 
 		 349 aa  46.6  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.042904 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0515  beta-lactamase domain-containing protein  28.23 
 
 		 308 aa  46.6  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0129365 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4154  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 317 aa  46.6  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1837  beta-lactamase domain protein  24.8 
 
 		 299 aa  46.6  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  23.95 
 
 		 342 aa  46.6  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1614  Beta-lactamase-like  24.6 
 
 		 339 aa  46.2  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.835771  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  27.16 
 
 		 213 aa  46.2  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4226  beta-lactamase-like  25.44 
 
 		 306 aa  46.6  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.733966  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0725  beta-lactamase domain-containing protein  22.83 
 
 		 334 aa  46.6  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0290049 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  26.24 
 
 		 212 aa  46.6  0.0006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1731  beta-lactamase domain protein  27.54 
 
 		 208 aa  46.2  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00010066  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  26.05 
 
 		 323 aa  46.2  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  24.77 
 
 		 207 aa  46.2  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0153  beta-lactamase domain-containing protein  25.21 
 
 		 296 aa  46.2  0.0007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0122  beta-lactamase-like  22.09 
 
 		 212 aa  46.2  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.151592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  26.9 
 
 		 231 aa  45.8  0.0009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  25.18 
 
 		 310 aa  45.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>