189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1653 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1653  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
238 aa  471  1e-132  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.139658  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3260  beta-lactamase domain-containing protein  44.54 
 
 
275 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3034  beta-lactamase domain-containing protein  43.67 
 
 
275 aa  139  6e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.641137 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3186  beta-lactamase domain-containing protein  37.28 
 
 
271 aa  137  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1577  beta-lactamase domain protein  40.97 
 
 
272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2893  beta-lactamase domain protein  37.91 
 
 
271 aa  125  5e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11942  hypothetical protein  37.04 
 
 
250 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1902  beta-lactamase domain-containing protein  38.1 
 
 
287 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.392348  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7059  beta-lactamase domain protein  33.05 
 
 
295 aa  109  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3131  beta-lactamase domain-containing protein  35.5 
 
 
230 aa  99.4  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.833456  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  35.07 
 
 
323 aa  98.6  8e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3402  beta-lactamase domain-containing protein  37.18 
 
 
243 aa  95.1  9e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.433473  normal  0.430357 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  32.65 
 
 
302 aa  90.5  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  33.05 
 
 
252 aa  88.2  9e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.231237 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  30.24 
 
 
299 aa  88.2  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  32.49 
 
 
298 aa  87.4  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  32.63 
 
 
321 aa  85.1  9e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  30.5 
 
 
305 aa  82.4  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  34.01 
 
 
304 aa  78.6  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3306  beta-lactamase domain protein  32.26 
 
 
315 aa  77.8  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  33.85 
 
 
318 aa  77.8  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0069  beta-lactamase-like  25.78 
 
 
362 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  34.42 
 
 
264 aa  76.3  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  30.96 
 
 
332 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  32.66 
 
 
317 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  32.12 
 
 
315 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0095  beta-lactamase domain-containing protein  27.48 
 
 
315 aa  68.9  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  31.66 
 
 
349 aa  68.2  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  30.61 
 
 
319 aa  67  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1709  beta-lactamase-like  26.29 
 
 
353 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.587452  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  30.61 
 
 
319 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  34.48 
 
 
313 aa  67.4  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  30.88 
 
 
321 aa  67  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17250  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  33.8 
 
 
347 aa  66.6  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.733457 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1125  beta-lactamase domain protein  33.82 
 
 
315 aa  66.2  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  28.89 
 
 
318 aa  66.2  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5952  putative metallo-beta-lactamase family protein  34.17 
 
 
308 aa  66.2  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  28.63 
 
 
318 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  30.35 
 
 
319 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  30.66 
 
 
319 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0666  beta-lactamase-like  28.44 
 
 
329 aa  64.3  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257894  normal  0.323841 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  28.9 
 
 
318 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4537  beta-lactamase domain protein  30.63 
 
 
314 aa  64.3  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.630097  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  28.9 
 
 
318 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  31 
 
 
319 aa  63.9  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  29.95 
 
 
319 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  29.95 
 
 
336 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  29.44 
 
 
318 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  29.95 
 
 
319 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  30.1 
 
 
318 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  28.9 
 
 
318 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  28.9 
 
 
318 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  28.9 
 
 
318 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  28.9 
 
 
318 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  28.9 
 
 
318 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  33.5 
 
 
321 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3492  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 
315 aa  63.2  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520693  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  30.19 
 
 
339 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 
249 aa  63.2  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2083  Beta-lactamase-like  24.02 
 
 
323 aa  63.2  0.000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  29.44 
 
 
318 aa  63.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  27.27 
 
 
319 aa  63.2  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  30.35 
 
 
339 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  26.26 
 
 
332 aa  62.8  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  23.29 
 
 
308 aa  62.4  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  29.59 
 
 
319 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  29.23 
 
 
342 aa  62.4  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  30.57 
 
 
315 aa  62.4  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  31.44 
 
 
313 aa  62  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  29.47 
 
 
319 aa  62  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  28.57 
 
 
319 aa  62  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0080  beta-lactamase domain protein  29.29 
 
 
319 aa  61.6  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1735  beta-lactamase domain protein  31.96 
 
 
310 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.593356  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0849  beta-lactamase domain protein  28.36 
 
 
321 aa  60.5  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185105  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  29.08 
 
 
319 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  27.91 
 
 
312 aa  60.1  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0922  beta-lactamase-like  25.76 
 
 
318 aa  59.7  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  27.93 
 
 
312 aa  60.1  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  27.72 
 
 
321 aa  60.1  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0250  beta-lactamase domain-containing protein  23.59 
 
 
246 aa  59.7  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  28.3 
 
 
335 aa  58.9  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  28.3 
 
 
335 aa  58.9  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  26.73 
 
 
337 aa  58.9  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  23.29 
 
 
310 aa  58.5  0.00000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  33.18 
 
 
327 aa  58.5  0.00000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  29.95 
 
 
319 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  29.95 
 
 
319 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2963  beta-lactamase domain-containing protein  36.54 
 
 
298 aa  58.5  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.955909  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0248  beta-lactamase domain-containing protein  23.08 
 
 
246 aa  57.8  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  27.11 
 
 
314 aa  57.8  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1231  beta-lactamase domain protein  27.45 
 
 
318 aa  57.4  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0606732 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1033  beta-lactamase domain protein  30.62 
 
 
333 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1776  beta-lactamase domain-containing protein  30.1 
 
 
310 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  24.62 
 
 
333 aa  56.6  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2112  beta-lactamase domain protein  31.44 
 
 
310 aa  57  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  27.19 
 
 
321 aa  56.2  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2620  beta-lactamase domain-containing protein  25.87 
 
 
253 aa  56.6  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  31.47 
 
 
310 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  29.59 
 
 
312 aa  55.8  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9074  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1 7-dioic acid hydratase (catechol pathway)-like protein  28.5 
 
 
637 aa  55.5  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>