204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1614 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1614  Beta-lactamase-like  100 
 
 
339 aa  700    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.835771  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1888  hypothetical protein  48.16 
 
 
321 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2395  beta-lactamase domain-containing protein  49.62 
 
 
313 aa  267  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.335507 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2674  beta-lactamase domain protein  49.44 
 
 
319 aa  265  8e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3742  Zn-dependent hydrolases  45.39 
 
 
318 aa  258  8e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443834  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1553  beta-lactamase domain protein  45.25 
 
 
322 aa  247  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163514  hitchhiker  0.000581399 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00755  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  34.35 
 
 
296 aa  155  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3062  beta-lactamase domain-containing protein  34.32 
 
 
297 aa  147  3e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1764  Na-translocating NADH-quinone reductase subunit A  30.16 
 
 
329 aa  133  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.439297  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6778  beta-lactamase domain protein  33.2 
 
 
310 aa  132  6.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.889748 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1827  beta-lactamase domain-containing protein  32.26 
 
 
291 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.021079  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2823  beta-lactamase domain-containing protein  32.23 
 
 
287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.328939  normal  0.0927352 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2195  beta-lactamase-like protein  32.28 
 
 
289 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0353  beta-lactamase-like  31.75 
 
 
309 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586247  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2384  beta-lactamase domain-containing protein  33.2 
 
 
294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0462  beta-lactamase-like  32.32 
 
 
292 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1646  beta-lactamase domain-containing protein  33.06 
 
 
292 aa  127  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01180  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  27.37 
 
 
294 aa  119  7.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.837421  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1415  beta-lactamase-like protein  29.23 
 
 
288 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0489899 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0578  beta-lactamase domain-containing protein  30.59 
 
 
313 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  27.83 
 
 
299 aa  89.7  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  27.39 
 
 
298 aa  89.4  9e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  28.02 
 
 
302 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  31.47 
 
 
310 aa  82.8  0.000000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0583  beta-lactamase domain protein  26.54 
 
 
297 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000802552  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  30.21 
 
 
315 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  30.21 
 
 
304 aa  76.6  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  28.81 
 
 
321 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  29.27 
 
 
364 aa  74.3  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  25.64 
 
 
323 aa  74.3  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  31.08 
 
 
313 aa  72.8  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1934  beta-lactamase domain-containing protein  27.14 
 
 
347 aa  72.8  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3260  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 
275 aa  72  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  27.74 
 
 
318 aa  71.6  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1308  beta-lactamase domain-containing protein  27.48 
 
 
246 aa  70.9  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  29.67 
 
 
364 aa  70.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  27.39 
 
 
315 aa  70.5  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  27.64 
 
 
313 aa  70.1  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0095  beta-lactamase domain-containing protein  27.59 
 
 
315 aa  69.7  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  28.64 
 
 
287 aa  67.4  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  27.5 
 
 
327 aa  66.6  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5952  putative metallo-beta-lactamase family protein  29.52 
 
 
308 aa  66.2  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  26.57 
 
 
249 aa  64.7  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1902  beta-lactamase domain-containing protein  27.47 
 
 
287 aa  64.3  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.392348  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7059  beta-lactamase domain protein  26 
 
 
295 aa  63.5  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  26.72 
 
 
349 aa  63.2  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  23.21 
 
 
321 aa  63.2  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  28.21 
 
 
318 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  26.98 
 
 
314 aa  61.2  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  28.21 
 
 
318 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  28.06 
 
 
318 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2893  beta-lactamase domain protein  27.13 
 
 
271 aa  60.5  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  24.71 
 
 
308 aa  60.1  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  25.78 
 
 
351 aa  60.1  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0555  beta-lactamase domain protein  22.73 
 
 
316 aa  59.7  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000575755  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3186  beta-lactamase domain-containing protein  27.56 
 
 
271 aa  60.1  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1920  beta-lactamase domain protein  24.03 
 
 
320 aa  59.3  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274405  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  26.22 
 
 
310 aa  58.2  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2197  beta-lactamase domain-containing protein  24.69 
 
 
298 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0276351  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1178  beta-lactamase domain-containing protein  25.83 
 
 
290 aa  58.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  29.02 
 
 
318 aa  58.2  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0410  beta-lactamase domain protein  29.89 
 
 
488 aa  57.8  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  29.13 
 
 
312 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  27.71 
 
 
342 aa  57.4  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1344  beta-lactamase domain protein  29.53 
 
 
311 aa  56.6  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  29.44 
 
 
251 aa  57  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  28.94 
 
 
309 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  23.86 
 
 
312 aa  56.2  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1104  beta-lactamase domain protein  25.83 
 
 
334 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  26.94 
 
 
312 aa  55.5  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3034  beta-lactamase domain-containing protein  26.26 
 
 
275 aa  55.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.641137 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1103  putative hydrolase  24.65 
 
 
312 aa  54.7  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197828  normal  0.352936 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  23.47 
 
 
333 aa  55.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1731  beta-lactamase domain protein  32 
 
 
208 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00010066  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  27.54 
 
 
312 aa  54.3  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3492  beta-lactamase domain-containing protein  25.2 
 
 
315 aa  54.3  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520693  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  21.71 
 
 
342 aa  53.9  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0161  beta-lactamase domain-containing protein  30.37 
 
 
306 aa  53.5  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1898  beta-lactamase domain-containing protein  22.64 
 
 
273 aa  53.5  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.337278  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0890  beta-lactamase-like  25.59 
 
 
317 aa  53.5  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434485  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0922  beta-lactamase-like  24.9 
 
 
318 aa  53.1  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4039  Beta-lactamase-like  25.3 
 
 
337 aa  53.1  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2059  beta-lactamase domain-containing protein  27.14 
 
 
310 aa  53.1  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0322253 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  23.29 
 
 
318 aa  52.8  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2714  metallo-beta-lactamase family protein  26.46 
 
 
325 aa  52  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1358  beta-lactamase domain-containing protein  25.15 
 
 
479 aa  52.4  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.345311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6499  beta-lactamase domain protein  31.25 
 
 
319 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.735445 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1231  beta-lactamase domain protein  24.2 
 
 
318 aa  52  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0606732 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4274  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  28.42 
 
 
306 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4229  beta-lactamase domain-containing protein  23.58 
 
 
408 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  29.61 
 
 
319 aa  52  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  26.87 
 
 
209 aa  52.4  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4160  SoxH protein-like  25.2 
 
 
312 aa  52  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.671969  normal  0.539982 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0436  beta-lactamase domain protein  28.27 
 
 
306 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1904  metallo-beta-lactamase family protein  25.76 
 
 
300 aa  51.6  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224567  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1269  beta-lactamase domain-containing protein  23.19 
 
 
331 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2963  beta-lactamase domain-containing protein  26.21 
 
 
298 aa  51.6  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.955909  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  29.22 
 
 
209 aa  51.6  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3306  beta-lactamase domain protein  25.63 
 
 
315 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  27.72 
 
 
210 aa  50.4  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>