More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0157 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0157  Beta-lactamase-like  100 
 
 		 314 aa  640    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0121  beta-lactamase-like protein  71.75 
 
 		 309 aa  426  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.381436  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0118  beta-lactamase domain protein  60.84 
 
 		 317 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.464415 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0258  putative beta lactamase protein  61.59 
 
 		 319 aa  362  5.0000000000000005e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.11853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0111  beta-lactamase domain protein  61.17 
 
 		 317 aa  362  7.0000000000000005e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.524145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4274  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  56.42 
 
 		 306 aa  334  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0436  beta-lactamase domain protein  56.49 
 
 		 306 aa  328  7e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0161  beta-lactamase domain-containing protein  53 
 
 		 306 aa  318  7e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4770  beta-lactamase domain protein  52.09 
 
 		 309 aa  309  4e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4226  beta-lactamase-like  54.24 
 
 		 306 aa  301  1e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.733966  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0431  beta-lactamase domain-containing protein  52.03 
 
 		 309 aa  300  2e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0515  beta-lactamase domain-containing protein  56.04 
 
 		 308 aa  298  1e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0129365 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0531  beta-lactamase domain protein  56.04 
 
 		 308 aa  295  5e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1264  beta-lactamase domain-containing protein  50.5 
 
 		 319 aa  290  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3580  beta-lactamase-like  50.65 
 
 		 308 aa  290  2e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4202  beta-lactamase domain-containing protein  50.84 
 
 		 317 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0583  beta-lactamase domain-containing protein  51.39 
 
 		 307 aa  283  3.0000000000000004e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.266418 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2059  beta-lactamase domain-containing protein  51.18 
 
 		 310 aa  281  8.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0322253 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0083  Beta-lactamase-like  48.81 
 
 		 304 aa  277  2e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0756  beta-lactamase domain protein  46.86 
 
 		 306 aa  241  1e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  30.63 
 
 		 329 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  26.77 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2629  Beta-lactamase-like  30.57 
 
 		 342 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  31.51 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  28.28 
 
 		 231 aa  72  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0680  beta-lactamase domain-containing protein  28.16 
 
 		 365 aa  70.5  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  25.25 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04020  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.12 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.626574 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1958  beta-lactamase domain-containing protein  27.67 
 
 		 209 aa  67  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0311  beta-lactamase domain-containing protein  25.85 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000202771  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0390  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0253  metallo-beta-lactamase family protein  30.24 
 
 		 365 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.921693 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4113  beta-lactamase domain protein  27.5 
 
 		 355 aa  65.5  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.011437  normal  0.053603 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2186  beta-lactamase domain protein  30 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.704345 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0329  beta-lactamase domain-containing protein  26.55 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000424657  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  24.6 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4822  beta-lactamase domain-containing protein  24.79 
 
 		 357 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.405979  normal  0.833796 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4736  cyclic nucleotide-binding protein  25.51 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  29.7 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0777  beta-lactamase domain-containing protein  27.33 
 
 		 352 aa  62.8  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.493847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  26.09 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0182  beta-lactamase domain-containing protein  28.12 
 
 		 356 aa  62  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  29.87 
 
 		 215 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  29.87 
 
 		 215 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2059  beta-lactamase domain protein  32.99 
 
 		 350 aa  61.6  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000271524  normal  0.300872 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1522  Beta-lactamase-like  31.85 
 
 		 214 aa  61.6  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  30.52 
 
 		 215 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3086  metallo-beta-lactamase family protein  25.77 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.825394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  29.87 
 
 		 215 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.63 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.63 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.63 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1652  beta-lactamase domain-containing protein  24.89 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.685243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.63 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  29.41 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0465  beta-lactamase domain protein  26.81 
 
 		 357 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.63 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  29.87 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  29.87 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2141  Beta-lactamase-like  28.42 
 
 		 354 aa  60.5  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1975  metallo-beta-lactamase superfamily protein  29.55 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2832  beta-lactamase domain-containing protein  23.14 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.422682  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  29.87 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  29.87 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2561  metallo-beta-lactamase family protein  29.55 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219407  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2798  hydroxyacylglutathione hydrolase  25.66 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.233678 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2652  beta-lactamase domain-containing protein  29.55 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0560187  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  30.63 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1372  beta-lactamase domain protein  25.91 
 
 		 328 aa  60.1  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  0.529651 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1494  beta-lactamase domain-containing protein  28.77 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.321503  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2884  beta-lactamase domain protein  29.41 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1728  beta-lactamase domain-containing protein  29.38 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0521  beta-lactamase domain protein  26 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000535463  hitchhiker  0.000000708931 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2417  beta-lactamase domain-containing protein  25.82 
 
 		 371 aa  59.3  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0630  hypothetical protein  25.79 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4251  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.67 
 
 		 357 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.342604  normal  0.241726 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0582  metallo-beta-lactamase family protein  28.1 
 
 		 331 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0248  beta-lactamase domain-containing protein  23.96 
 
 		 246 aa  58.5  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2879  beta-lactamase domain protein  29.86 
 
 		 216 aa  58.9  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.191235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0250  beta-lactamase domain-containing protein  23.96 
 
 		 246 aa  58.9  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0729  beta-lactamase domain protein  27.31 
 
 		 344 aa  58.9  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  27.91 
 
 		 214 aa  58.5  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4164  beta-lactamase domain protein  31.37 
 
 		 205 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420537  normal  0.04389 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3993  beta-lactamase domain-containing protein  26.14 
 
 		 321 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582662 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2635  beta-lactamase domain protein  24.02 
 
 		 349 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2508  beta-lactamase domain protein  31.25 
 
 		 214 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523411 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  31.29 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  28.19 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1986  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.29 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  23.64 
 
 		 342 aa  57.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05851  putative hydroxyacylglutathione hydrolase  27.27 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.597895  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3844  beta-lactamase-like  26.5 
 
 		 366 aa  58.5  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1402  beta-lactamase domain-containing protein  28.71 
 
 		 204 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0271  beta-lactamase domain protein  24.24 
 
 		 425 aa  57.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000349222  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0310  beta-lactamase-like  26.22 
 
 		 348 aa  57.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0400  metallo-beta-lactamase family protein  28.1 
 
 		 359 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1152  beta-lactamase domain-containing protein  25.88 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  hitchhiker  0.0056375 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1211  beta-lactamase domain protein  32 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000331215  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  32.89 
 
 		 213 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3058  beta-lactamase-like  24.78 
 
 		 329 aa  57.4  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>