More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0248 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0248  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
246 aa  499  1e-140  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0250  beta-lactamase domain-containing protein  97.56 
 
 
246 aa  491  9.999999999999999e-139  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1308  beta-lactamase domain-containing protein  45.78 
 
 
246 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  41.7 
 
 
249 aa  194  1e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  30.84 
 
 
298 aa  100  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  27.31 
 
 
299 aa  97.4  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  29.81 
 
 
302 aa  96.7  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0116  beta-lactamase domain-containing protein  31.77 
 
 
242 aa  95.9  6e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000189379  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1125  beta-lactamase domain protein  27.67 
 
 
315 aa  79.7  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6499  beta-lactamase domain protein  27.66 
 
 
319 aa  79.7  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.735445 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4537  beta-lactamase domain protein  27.52 
 
 
314 aa  78.2  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.630097  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6778  beta-lactamase domain protein  27.73 
 
 
310 aa  75.9  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.889748 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  25.33 
 
 
342 aa  75.1  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  23.7 
 
 
333 aa  73.9  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0756  beta-lactamase domain protein  25.93 
 
 
306 aa  74.3  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  27.67 
 
 
312 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0016  beta-lactamase domain protein  27.32 
 
 
246 aa  73.6  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000373362  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1235  beta-lactamase-like  29.03 
 
 
295 aa  72  0.000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.643095  normal  0.0366717 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 
323 aa  71.2  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  27.67 
 
 
264 aa  70.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  27.85 
 
 
318 aa  69.3  0.00000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  23.85 
 
 
312 aa  68.2  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0080  beta-lactamase domain protein  27.55 
 
 
319 aa  68.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  25.24 
 
 
304 aa  68.2  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5095  beta-lactamase domain protein  24.58 
 
 
293 aa  67  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.046641  normal  0.029207 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  24.03 
 
 
319 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  24.03 
 
 
319 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1344  beta-lactamase domain protein  25.13 
 
 
311 aa  65.9  0.0000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5378  beta-lactamase domain protein  25.22 
 
 
293 aa  65.9  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13255  normal  0.647715 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  22.48 
 
 
319 aa  65.5  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3492  beta-lactamase domain-containing protein  22.92 
 
 
315 aa  64.7  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520693  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2893  beta-lactamase domain protein  27.23 
 
 
271 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  23.73 
 
 
319 aa  64.7  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3186  beta-lactamase domain-containing protein  26.18 
 
 
271 aa  64.7  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1178  beta-lactamase domain-containing protein  26.11 
 
 
290 aa  65.1  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0736  beta-lactamase domain-containing protein  26.96 
 
 
266 aa  64.3  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0019476  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1269  beta-lactamase domain-containing protein  25.46 
 
 
331 aa  64.3  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  26.56 
 
 
349 aa  63.5  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  24.66 
 
 
312 aa  63.5  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1646  beta-lactamase domain-containing protein  24.24 
 
 
292 aa  63.5  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  26.01 
 
 
305 aa  63.5  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  22.6 
 
 
321 aa  63.5  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0922  beta-lactamase-like  24.46 
 
 
318 aa  62.8  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  23.64 
 
 
319 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  26.97 
 
 
317 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  21.24 
 
 
332 aa  62.4  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0578  beta-lactamase domain-containing protein  28.5 
 
 
313 aa  62  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  23.26 
 
 
319 aa  62  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3306  beta-lactamase domain protein  22.22 
 
 
315 aa  62  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  22.86 
 
 
318 aa  62  0.000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1231  beta-lactamase domain protein  25.23 
 
 
318 aa  62  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0606732 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3260  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 
275 aa  61.2  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1621  Beta-lactamase-like  26.92 
 
 
334 aa  61.6  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.683443  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  24.03 
 
 
318 aa  61.6  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  21.99 
 
 
319 aa  61.6  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18970  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  28.37 
 
 
319 aa  61.6  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0850103  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2612  beta-lactamase domain protein  23.71 
 
 
342 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.584413  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  22.48 
 
 
335 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  22.48 
 
 
335 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0583  beta-lactamase domain protein  24.52 
 
 
297 aa  60.5  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000802552  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  25.73 
 
 
319 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7059  beta-lactamase domain protein  22.76 
 
 
295 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2733  beta-lactamase domain-containing protein  24.67 
 
 
325 aa  61.2  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4154  beta-lactamase domain-containing protein  25.81 
 
 
317 aa  61.2  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  22.43 
 
 
342 aa  60.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  26.97 
 
 
438 aa  60.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0906  Beta-lactamase-like  24.89 
 
 
316 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3062  beta-lactamase domain-containing protein  25.32 
 
 
297 aa  60.5  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03565  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00280)  26.39 
 
 
302 aa  59.7  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00000315394  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5154  beta-lactamase domain protein  24.89 
 
 
317 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692962  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  25.73 
 
 
319 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0353  beta-lactamase-like  28.37 
 
 
309 aa  59.3  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586247  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  25.73 
 
 
319 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  25.73 
 
 
336 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1870  beta-lactamase domain-containing protein  23.71 
 
 
591 aa  59.3  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  23.04 
 
 
318 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  23.04 
 
 
318 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  23.04 
 
 
318 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  23.04 
 
 
318 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  23.04 
 
 
318 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  23.04 
 
 
318 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1017  beta-lactamase-like  26.74 
 
 
316 aa  59.3  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751913  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  23.04 
 
 
318 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0069  beta-lactamase-like  23.39 
 
 
362 aa  58.5  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  26.34 
 
 
308 aa  58.2  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  24 
 
 
287 aa  57.8  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  24.27 
 
 
319 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  25 
 
 
319 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  23.27 
 
 
318 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0890  beta-lactamase-like  25.4 
 
 
317 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434485  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2823  beta-lactamase domain-containing protein  25.57 
 
 
287 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.328939  normal  0.0927352 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3125  beta-lactamase domain-containing protein  22.42 
 
 
313 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265077  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  24.27 
 
 
339 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1033  beta-lactamase domain protein  24.76 
 
 
333 aa  58.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  25 
 
 
319 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2106  beta-lactamase domain protein  24.29 
 
 
315 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.105061  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  28.43 
 
 
309 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  24.27 
 
 
339 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1345  beta-lactamase domain-containing protein  27.83 
 
 
230 aa  57.8  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2500  beta-lactamase domain protein  24.29 
 
 
315 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.397877 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>