More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0121 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0121  beta-lactamase-like protein  100 
 
 		 309 aa  622  1e-177  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.381436  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0157  Beta-lactamase-like  71.75 
 
 		 314 aa  424  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0118  beta-lactamase domain protein  63.11 
 
 		 317 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.464415 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0111  beta-lactamase domain protein  63.11 
 
 		 317 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.524145  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0258  putative beta lactamase protein  58.9 
 
 		 319 aa  341  9e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.11853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0436  beta-lactamase domain protein  54.33 
 
 		 306 aa  323  3e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4274  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  54 
 
 		 306 aa  318  7e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0161  beta-lactamase domain-containing protein  53.33 
 
 		 306 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4770  beta-lactamase domain protein  54.97 
 
 		 309 aa  311  6.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0431  beta-lactamase domain-containing protein  50.83 
 
 		 309 aa  289  5.0000000000000004e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4202  beta-lactamase domain-containing protein  52.12 
 
 		 317 aa  288  6e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4226  beta-lactamase-like  48.69 
 
 		 306 aa  287  2e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.733966  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0515  beta-lactamase domain-containing protein  52.13 
 
 		 308 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0129365 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0531  beta-lactamase domain protein  52.44 
 
 		 308 aa  281  9e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3580  beta-lactamase-like  48.7 
 
 		 308 aa  278  1e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2059  beta-lactamase domain-containing protein  49.2 
 
 		 310 aa  273  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0322253 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1264  beta-lactamase domain-containing protein  47.71 
 
 		 319 aa  273  3e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0583  beta-lactamase domain-containing protein  48.65 
 
 		 307 aa  262  6e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.266418 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0083  Beta-lactamase-like  47.99 
 
 		 304 aa  245  8e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0756  beta-lactamase domain protein  45.85 
 
 		 306 aa  230  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  31.7 
 
 		 329 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  28.19 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  29.02 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1986  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.71 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  27.7 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  27.41 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  27.08 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  26.96 
 
 		 231 aa  67  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04020  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  28.93 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.626574 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  33 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  29.85 
 
 		 217 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_002936  DET0785  metallo-beta-lactamase family protein  27.05 
 
 		 205 aa  64.7  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.721139  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0680  beta-lactamase domain-containing protein  29.34 
 
 		 365 aa  64.3  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  28.5 
 
 		 210 aa  64.7  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0390  beta-lactamase domain protein  31.37 
 
 		 318 aa  65.1  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  29.25 
 
 		 208 aa  64.7  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2798  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.05 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.233678 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5569  beta-lactamase domain-containing protein  30.63 
 
 		 363 aa  65.1  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0506555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2186  beta-lactamase domain protein  30.85 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.704345 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  28.63 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0729  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 		 344 aa  64.7  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1663  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.61 
 
 		 242 aa  63.9  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.44689 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2719  beta-lactamase domain protein  30.05 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.227848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  28.25 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0285  beta-lactamase domain-containing protein  28.64 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394027  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2821  beta-lactamase-like  28.64 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  27.14 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1306  metallo-beta-lactamase family protein  25.93 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  31.5 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3235  metallo-beta-lactamase family protein  26.8 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1522  Beta-lactamase-like  31.12 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  27.6 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2629  Beta-lactamase-like  29.49 
 
 		 342 aa  62.8  0.000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3014  beta-lactamase domain protein  25.58 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0267  beta-lactamase domain-containing protein  28.14 
 
 		 214 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0051  beta-lactamase domain-containing protein  25.94 
 
 		 334 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0582  metallo-beta-lactamase family protein  28.51 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0711  beta-lactamase domain-containing protein  27.64 
 
 		 217 aa  61.6  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  31.68 
 
 		 207 aa  61.6  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  25.32 
 
 		 212 aa  61.6  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2059  beta-lactamase domain protein  32.43 
 
 		 350 aa  61.2  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000271524  normal  0.300872 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2285  beta-lactamase-like  27.11 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0817874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1975  metallo-beta-lactamase superfamily protein  27.55 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  29.35 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2281  metallo-beta-lactamase family protein  28.92 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.858667  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0093  metallo-beta-lactamase family protein  28.92 
 
 		 383 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0400  metallo-beta-lactamase family protein  28.51 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3268  Beta-lactamase-like  30.25 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0213  beta-lactamase domain-containing protein  28.64 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.325973 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2007  metallo-beta-lactamase family protein  28.92 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2853  beta-lactamase domain protein  32.37 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0560  beta-lactamase domain-containing protein  30.32 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3844  beta-lactamase-like  27.85 
 
 		 366 aa  60.8  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3089  metallo-beta-lactamase family protein  28.92 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  31.01 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  28.64 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0420  metallo-beta-lactamase family protein  28.92 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611131  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00776  probable metallo-beta-lactamase  27.9 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0095  beta-lactamase domain-containing protein  27.43 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0182  beta-lactamase domain-containing protein  27.98 
 
 		 356 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3127  beta-lactamase domain protein  29.72 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.257865  normal  0.300589 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2901  beta-lactamase domain-containing protein  29.72 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.605946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0777  beta-lactamase domain-containing protein  24.43 
 
 		 352 aa  60.5  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.493847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2652  beta-lactamase domain-containing protein  27.55 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0560187  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2141  Beta-lactamase-like  27.7 
 
 		 354 aa  60.5  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2561  metallo-beta-lactamase family protein  27.55 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219407  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  22.34 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0199  beta-lactamase domain-containing protein  28.64 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604325  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1084  beta-lactamase domain protein  29.51 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  25.23 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0418  beta-lactamase domain protein  24.63 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2691  putative hydroxyacylglutathione hydrolase  31.11 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.25235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0630  hypothetical protein  26 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2576  beta-lactamase domain-containing protein  28.63 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.835238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0465  beta-lactamase domain protein  25.4 
 
 		 357 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4155  beta-lactamase domain protein  22.47 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000681201 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2799  beta-lactamase domain protein  28.63 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  27.15 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0467  metallo-beta-lactamase family protein  30.81 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.56187 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0253  metallo-beta-lactamase family protein  29.65 
 
 		 365 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.921693 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>