More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5569 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5569  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 363 aa  741    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0506555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2417  beta-lactamase domain-containing protein  68.59 
 
 		 371 aa  508  1e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0253  metallo-beta-lactamase family protein  66.37 
 
 		 365 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.921693 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4274  Beta-lactamase-like  62.95 
 
 		 357 aa  451  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0680  beta-lactamase domain-containing protein  60.06 
 
 		 365 aa  431  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4696  beta-lactamase domain-containing protein  59.43 
 
 		 400 aa  414  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.750931  normal  0.0866563 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2635  beta-lactamase domain protein  53.58 
 
 		 349 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0777  beta-lactamase domain-containing protein  52.94 
 
 		 352 aa  374  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.493847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0368  beta-lactamase-like protein  48.89 
 
 		 374 aa  297  2e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.967784  normal  0.392052 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2629  Beta-lactamase-like  46.11 
 
 		 342 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2397  beta-lactamase domain-containing protein  44.25 
 
 		 344 aa  271  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.21584  normal  0.814785 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0741  putative metallo-beta-lactamase family protein  44.25 
 
 		 344 aa  271  2e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.844995  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01454  metallo-beta-lactamase family protein  39.65 
 
 		 343 aa  266  5.999999999999999e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1982  beta-lactamase domain-containing protein  40.54 
 
 		 361 aa  265  7e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0729  beta-lactamase domain protein  41.23 
 
 		 344 aa  264  2e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0465  beta-lactamase domain protein  42.37 
 
 		 357 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0101  beta-lactamase-like protein  44.76 
 
 		 359 aa  259  6e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0103  Beta-lactamase-like  40.52 
 
 		 341 aa  258  1e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0139  beta-lactamase domain protein  42.09 
 
 		 359 aa  258  1e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.486193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0131  beta-lactamase domain protein  42.09 
 
 		 359 aa  258  1e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4736  cyclic nucleotide-binding protein  42.86 
 
 		 359 aa  257  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4825  beta-lactamase-like  39.76 
 
 		 354 aa  256  6e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.601465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4193  beta-lactamase-like  38.5 
 
 		 394 aa  255  7e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3370  hypothetical protein  43.23 
 
 		 362 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0093  metallo-beta-lactamase family protein  42.4 
 
 		 383 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0132  Beta-lactamase-like  43.22 
 
 		 358 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0420  metallo-beta-lactamase family protein  43.47 
 
 		 359 aa  250  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611131  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0400  metallo-beta-lactamase family protein  43.47 
 
 		 359 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2007  metallo-beta-lactamase family protein  43.47 
 
 		 359 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4251  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  42.53 
 
 		 357 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.342604  normal  0.241726 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2281  metallo-beta-lactamase family protein  43.47 
 
 		 359 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.858667  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3089  metallo-beta-lactamase family protein  43.47 
 
 		 359 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0281  hypothetical protein  42.37 
 
 		 359 aa  248  9e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.18209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2461  beta-lactamase domain-containing protein  42.09 
 
 		 344 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.889355 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4822  beta-lactamase domain-containing protein  40.51 
 
 		 357 aa  246  4e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.405979  normal  0.833796 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3086  metallo-beta-lactamase family protein  39.18 
 
 		 349 aa  245  6.999999999999999e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.825394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0923  beta-lactamase domain protein  35.83 
 
 		 354 aa  245  8e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526967  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0839  beta-lactamase-like  37.04 
 
 		 354 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.228122 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0380  beta-lactamase domain-containing protein  42.54 
 
 		 359 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.335712 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0182  beta-lactamase domain-containing protein  43.34 
 
 		 356 aa  243  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4562  Beta-lactamase-like  37.32 
 
 		 354 aa  243  5e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.809352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2974  beta-lactamase domain-containing protein  42.74 
 
 		 384 aa  243  5e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2311  beta-lactamase-like  42.7 
 
 		 359 aa  242  7e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2925  beta-lactamase domain-containing protein  42.7 
 
 		 359 aa  242  7e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2940  beta-lactamase domain-containing protein  42.42 
 
 		 359 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.571743 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0310  beta-lactamase-like  38.26 
 
 		 348 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6268  Beta-lactamase-like  42.49 
 
 		 359 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2837  beta-lactamase domain-containing protein  42.45 
 
 		 358 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.9285 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0864  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase superfamily protein  36.55 
 
 		 352 aa  235  7e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2141  Beta-lactamase-like  38.78 
 
 		 354 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3844  beta-lactamase-like  39.77 
 
 		 366 aa  231  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2123  beta-lactamase domain-containing protein  37.12 
 
 		 369 aa  231  2e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.747407  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3893  beta-lactamase-like  38.39 
 
 		 349 aa  231  2e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.042904 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4200  beta-lactamase domain-containing protein  40.06 
 
 		 363 aa  229  5e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000948581 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0582  metallo-beta-lactamase family protein  42.25 
 
 		 331 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3058  beta-lactamase-like  36.68 
 
 		 329 aa  227  3e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0347  metallo-beta-lactamase family protein  42.33 
 
 		 326 aa  223  6e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607947  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0433  beta-lactamase domain-containing protein  36.76 
 
 		 340 aa  213  5.999999999999999e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0151814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4932  beta-lactamase domain-containing protein  36.45 
 
 		 335 aa  206  6e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5264  beta-lactamase-like  35.38 
 
 		 353 aa  159  8e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3993  beta-lactamase domain-containing protein  30.43 
 
 		 321 aa  140  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582662 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1152  beta-lactamase domain-containing protein  30.94 
 
 		 321 aa  137  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  hitchhiker  0.0056375 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2834  beta-lactamase domain protein  29.34 
 
 		 324 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1004  beta-lactamase domain-containing protein  29.82 
 
 		 320 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.217464 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4113  beta-lactamase domain protein  29.2 
 
 		 355 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.011437  normal  0.053603 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0158  beta-lactamase domain-containing protein  29.41 
 
 		 314 aa  110  3e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.625085 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1439  beta-lactamase domain protein  28.27 
 
 		 329 aa  110  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000967067  normal  0.166741 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1745  beta-lactamase-like protein  29.78 
 
 		 335 aa  108  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.931232  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08650  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.63 
 
 		 346 aa  104  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.637388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8202  beta-lactamase domain-containing protein  30.21 
 
 		 339 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1879  beta-lactamase domain-containing protein  28.79 
 
 		 322 aa  102  1e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  26.89 
 
 		 324 aa  100  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000197877 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2888  beta-lactamase domain-containing protein  34.52 
 
 		 368 aa  100  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1728  beta-lactamase domain protein  28.92 
 
 		 324 aa  97.8  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  24.69 
 
 		 310 aa  97.1  4e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2650  beta-lactamase domain-containing protein  24.43 
 
 		 324 aa  97.1  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8278  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  31.53 
 
 		 348 aa  97.1  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6747  hypothetical protein  48.31 
 
 		 214 aa  96.7  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0405186  normal  0.715012 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1372  beta-lactamase domain protein  27.84 
 
 		 328 aa  95.5  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  0.529651 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1013  beta-lactamase domain protein  25.66 
 
 		 322 aa  92.8  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.151542  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2059  beta-lactamase domain protein  28.61 
 
 		 350 aa  92.4  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000271524  normal  0.300872 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2556  beta-lactamase domain-containing protein  25.98 
 
 		 323 aa  91.7  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0428  beta-lactamase domain-containing protein  29.97 
 
 		 366 aa  90.9  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1031  beta-lactamase domain protein  26.55 
 
 		 323 aa  90.5  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210455  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2457  beta-lactamase domain-containing protein  30.15 
 
 		 327 aa  90.1  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130811  normal  0.600713 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3655  beta-lactamase domain protein  30.19 
 
 		 332 aa  89.7  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114597  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1440  beta-lactamase domain-containing protein  27.36 
 
 		 331 aa  89.4  9e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.482344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4516  beta-lactamase domain-containing protein  28.53 
 
 		 346 aa  87.8  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0438  hypothetical protein  27.64 
 
 		 328 aa  86.7  5e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000571233  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0050  Beta-lactamase-like  29.63 
 
 		 334 aa  86.7  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4704  beta-lactamase domain protein  24.85 
 
 		 325 aa  85.9  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0390  beta-lactamase domain protein  29.55 
 
 		 318 aa  85.5  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1528  beta-lactamase-like protein  27.44 
 
 		 331 aa  84  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0999562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0066  beta-lactamase domain protein  28.53 
 
 		 334 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391302  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2879  AMP-dependent synthetase and ligase  26.18 
 
 		 862 aa  79  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11930  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  27.22 
 
 		 354 aa  79  0.0000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.985203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1079  beta-lactamase domain protein  27.76 
 
 		 332 aa  78.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0383209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0054  beta-lactamase domain protein  28.09 
 
 		 334 aa  76.6  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05440  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  26.11 
 
 		 352 aa  76.6  0.0000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.853516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3988  beta-lactamase domain protein  29.38 
 
 		 351 aa  75.9  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>