More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0560 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0560  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
267 aa  541  1e-153  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  32.3 
 
 
209 aa  144  1e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  38.39 
 
 
210 aa  132  6.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  33.33 
 
 
217 aa  132  7.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0711  beta-lactamase domain-containing protein  35.32 
 
 
217 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  35.32 
 
 
205 aa  124  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  33.18 
 
 
212 aa  124  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0785  metallo-beta-lactamase family protein  32.89 
 
 
205 aa  123  3e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.721139  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  30.38 
 
 
251 aa  119  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  32.89 
 
 
214 aa  118  9e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  31.98 
 
 
209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  33.19 
 
 
211 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  32.88 
 
 
213 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  33.63 
 
 
209 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  29.28 
 
 
207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  31.82 
 
 
207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  34.53 
 
 
209 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  33.93 
 
 
208 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0282  beta-lactamase domain-containing protein  34.04 
 
 
240 aa  107  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  33.93 
 
 
219 aa  106  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0418  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
212 aa  106  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  32.73 
 
 
213 aa  106  5e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  31.36 
 
 
205 aa  105  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00776  probable metallo-beta-lactamase  28.89 
 
 
213 aa  105  6e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
213 aa  105  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2512  beta-lactamase domain protein  31.25 
 
 
214 aa  105  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  30.26 
 
 
209 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
209 aa  104  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  30.8 
 
 
215 aa  105  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.755925 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  33.63 
 
 
209 aa  103  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0113  beta-lactamase-like  34.39 
 
 
224 aa  104  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.110968 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2853  beta-lactamase domain protein  34.5 
 
 
210 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  30.63 
 
 
209 aa  104  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  32.3 
 
 
213 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  28.51 
 
 
210 aa  104  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  32.74 
 
 
209 aa  102  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0536  beta-lactamase domain protein  32.3 
 
 
226 aa  102  5e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0161694  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0317  beta-lactamase domain-containing protein  31.05 
 
 
214 aa  102  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  30.91 
 
 
205 aa  102  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0786  metallo-beta-lactamase family protein  35.29 
 
 
208 aa  102  7e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0221878  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2576  beta-lactamase domain-containing protein  31.05 
 
 
214 aa  102  8e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.835238  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2799  beta-lactamase domain protein  31.05 
 
 
214 aa  102  8e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130329  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2186  beta-lactamase domain protein  33.18 
 
 
210 aa  102  9e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.704345 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0233  beta-lactamase-like  31.91 
 
 
230 aa  102  9e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  27.68 
 
 
216 aa  101  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5067  beta-lactamase domain protein  30.6 
 
 
212 aa  101  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.533186  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  30.3 
 
 
209 aa  101  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1211  beta-lactamase domain protein  33.78 
 
 
211 aa  101  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000331215  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0539  Zn-dependent hydrolase, including glyoxylase  34.55 
 
 
210 aa  101  1e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0442594  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  32.7 
 
 
214 aa  101  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  37.1 
 
 
210 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1522  Beta-lactamase-like  32.74 
 
 
214 aa  101  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3235  metallo-beta-lactamase family protein  31.44 
 
 
213 aa  100  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  32.29 
 
 
209 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2508  beta-lactamase domain protein  30.59 
 
 
214 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.523411 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  27.43 
 
 
209 aa  100  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  32.29 
 
 
209 aa  100  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3014  beta-lactamase domain protein  32.02 
 
 
213 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  32.29 
 
 
209 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  32.29 
 
 
209 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  32.29 
 
 
209 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3054  metallo-beta-lactamase family protein  28.96 
 
 
214 aa  99.8  5e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  32.74 
 
 
208 aa  99  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4485  metallo-beta-lactamase family protein  32.74 
 
 
208 aa  99  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  31.36 
 
 
207 aa  99  6e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0220  beta-lactamase domain protein  30.94 
 
 
212 aa  99.4  6e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1500  beta-lactamase domain-containing protein  27.8 
 
 
214 aa  99  7e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  29.65 
 
 
206 aa  99  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0228  beta-lactamase domain-containing protein  31.39 
 
 
212 aa  99  7e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0715  Beta-lactamase-like  31.67 
 
 
222 aa  99  8e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  31.36 
 
 
213 aa  99  8e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1435  beta-lactamase domain-containing protein  27.8 
 
 
214 aa  98.6  9e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  31.84 
 
 
209 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  32.9 
 
 
218 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  26.15 
 
 
201 aa  98.6  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1731  beta-lactamase domain protein  32.44 
 
 
208 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00010066  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4155  beta-lactamase domain protein  30.36 
 
 
212 aa  97.4  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000681201 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1493  beta-lactamase domain-containing protein  25.79 
 
 
214 aa  97.1  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3268  Beta-lactamase-like  31.67 
 
 
216 aa  96.3  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0571  beta-lactamase domain protein  30.59 
 
 
221 aa  96.3  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695514  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  32.47 
 
 
218 aa  96.3  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3466  beta-lactamase domain protein  32.89 
 
 
218 aa  95.9  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3433  beta-lactamase-like protein  30.77 
 
 
222 aa  95.9  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111848  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  29.44 
 
 
198 aa  95.5  9e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2403  metallo-beta-lactamase family protein  28.89 
 
 
213 aa  94.7  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1817  beta-lactamase domain protein  30.77 
 
 
208 aa  94.7  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000015217  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3631  beta-lactamase domain protein  32.47 
 
 
218 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0394  putative metallo-beta-lactamase family protein  30.53 
 
 
215 aa  95.1  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2821  beta-lactamase-like  30.34 
 
 
237 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3222  beta-lactamase domain protein  35.27 
 
 
266 aa  94.7  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.076596  normal  0.400192 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  26.94 
 
 
206 aa  95.1  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2524  beta-lactamase domain-containing protein  31.72 
 
 
215 aa  95.1  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0369  beta-lactamase domain-containing protein  28.64 
 
 
201 aa  94.7  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3268  hypothetical protein  32.59 
 
 
224 aa  94  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3138  beta-lactamase domain protein  32.14 
 
 
218 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0167  beta-lactamase-like  30.22 
 
 
212 aa  94  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0031  beta-lactamase domain-containing protein  29.91 
 
 
214 aa  94  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.789051  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1949  beta-lactamase domain protein  29.3 
 
 
208 aa  94  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2364  beta-lactamase domain protein  32.75 
 
 
231 aa  94  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  32.74 
 
 
210 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>