270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1264 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1264  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 319 aa  643    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4202  beta-lactamase domain-containing protein  67.71 
 
 		 317 aa  421  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2059  beta-lactamase domain-containing protein  63.17 
 
 		 310 aa  385  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0322253 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0515  beta-lactamase domain-containing protein  61.04 
 
 		 308 aa  354  1e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0129365 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0531  beta-lactamase domain protein  60.39 
 
 		 308 aa  350  2e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3580  beta-lactamase-like  55.37 
 
 		 308 aa  340  2e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4226  beta-lactamase-like  55.37 
 
 		 306 aa  340  2e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.733966  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4770  beta-lactamase domain protein  52.1 
 
 		 309 aa  325  5e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0431  beta-lactamase domain-containing protein  52.12 
 
 		 309 aa  325  6e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0583  beta-lactamase domain-containing protein  52.13 
 
 		 307 aa  295  8e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.266418 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0118  beta-lactamase domain protein  50 
 
 		 317 aa  281  1e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.464415 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0157  Beta-lactamase-like  50.5 
 
 		 314 aa  278  6e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0111  beta-lactamase domain protein  50.32 
 
 		 317 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.524145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0121  beta-lactamase-like protein  47.71 
 
 		 309 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.381436  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0258  putative beta lactamase protein  51.04 
 
 		 319 aa  267  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.11853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0436  beta-lactamase domain protein  46.49 
 
 		 306 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4274  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  46.64 
 
 		 306 aa  252  7e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0161  beta-lactamase domain-containing protein  50.6 
 
 		 306 aa  242  7e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0083  Beta-lactamase-like  42.14 
 
 		 304 aa  219  5e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0756  beta-lactamase domain protein  37.58 
 
 		 306 aa  176  5e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  29.57 
 
 		 329 aa  82.4  0.000000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  28.99 
 
 		 333 aa  67  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1494  beta-lactamase domain-containing protein  29.75 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.321503  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01300  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  28.46 
 
 		 329 aa  62.8  0.000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.528285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2083  Beta-lactamase-like  27.67 
 
 		 323 aa  62.4  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0329  beta-lactamase domain-containing protein  23.48 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000424657  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0311  beta-lactamase domain-containing protein  22.69 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000202771  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3562  beta-lactamase domain protein  33.99 
 
 		 228 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000949082  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0007  beta-lactamase domain protein  27.62 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.963887 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2355  beta-lactamase domain protein  25.7 
 
 		 444 aa  56.2  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  30.05 
 
 		 342 aa  55.8  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  27.5 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1869  Beta-lactamase-like  27.24 
 
 		 330 aa  55.8  0.0000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.356372  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  26.98 
 
 		 213 aa  55.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1103  putative hydrolase  27.55 
 
 		 312 aa  55.5  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197828  normal  0.352936 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2964  beta-lactamase-like  30.52 
 
 		 292 aa  55.1  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.410641  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1975  metallo-beta-lactamase superfamily protein  27.22 
 
 		 215 aa  55.8  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  28.02 
 
 		 314 aa  55.5  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2561  metallo-beta-lactamase family protein  27.22 
 
 		 215 aa  55.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219407  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2652  beta-lactamase domain-containing protein  27.22 
 
 		 215 aa  55.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0560187  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  23.7 
 
 		 211 aa  55.1  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0057  hypothetical protein  26.4 
 
 		 295 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0213  beta-lactamase domain-containing protein  29.9 
 
 		 214 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.325973 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2821  beta-lactamase-like  29.9 
 
 		 237 aa  53.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  26.13 
 
 		 302 aa  53.1  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0285  beta-lactamase domain-containing protein  29.9 
 
 		 214 aa  53.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394027  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1453  Beta-lactamase-like  28.77 
 
 		 241 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  28.21 
 
 		 309 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0199  beta-lactamase domain-containing protein  29.38 
 
 		 214 aa  52.8  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604325  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1782  beta-lactamase domain protein  31.06 
 
 		 215 aa  53.1  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0194  beta-lactamase domain-containing protein  29.38 
 
 		 214 aa  53.1  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.00000000306881 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3151  metallo-beta-lactamase family protein  30.41 
 
 		 214 aa  52.8  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03565  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00280)  24.5 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00000315394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1475  hypothetical protein  24.88 
 
 		 317 aa  52  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1401  beta-lactamase domain-containing protein  24.88 
 
 		 317 aa  52  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1595  Beta-lactamase-like  33.33 
 
 		 265 aa  52.4  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1319  beta-lactamase domain protein  28.24 
 
 		 302 aa  52.4  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0269  Beta-lactamase-like  27.33 
 
 		 297 aa  52  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120465  normal  0.961982 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  28.57 
 
 		 215 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2185  beta-lactamase domain protein  27.89 
 
 		 305 aa  52.4  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.714423  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00690  hypothetical protein  26 
 
 		 295 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.696824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0376  beta-lactamase domain protein  28.4 
 
 		 308 aa  52  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1728  beta-lactamase domain-containing protein  28.89 
 
 		 215 aa  51.2  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04020  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  29.8 
 
 		 222 aa  51.2  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.626574 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0328  Beta-lactamase-like  26.85 
 
 		 257 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.309918  normal  0.439224 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3388  Beta-lactamase-like  28.87 
 
 		 241 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 215 aa  51.6  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  28.8 
 
 		 321 aa  51.6  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0267  beta-lactamase domain-containing protein  29.38 
 
 		 214 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0203  beta-lactamase domain-containing protein  27.35 
 
 		 263 aa  51.2  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0208476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1077  beta-lactamase domain protein  27.16 
 
 		 226 aa  51.6  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  24.62 
 
 		 299 aa  50.8  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0044  metallo-beta-lactamase superfamily protein  29.38 
 
 		 214 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1662  beta-lactamase domain protein  30.24 
 
 		 212 aa  50.8  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  27.95 
 
 		 215 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  27.95 
 
 		 215 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  27.95 
 
 		 215 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  27.95 
 
 		 215 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2054  beta-lactamase domain protein  30.43 
 
 		 215 aa  50.8  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.128768  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3822  metallo-beta-lactamase family protein  29.38 
 
 		 214 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  25.44 
 
 		 304 aa  50.4  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1991  beta-lactamase domain protein  26.24 
 
 		 310 aa  50.4  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3058  beta-lactamase-like  25.74 
 
 		 329 aa  50.4  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2909  metallo-beta-lactamase family protein  28.87 
 
 		 214 aa  50.1  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.457315  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2969  metallo-beta-lactamase family protein  28.87 
 
 		 214 aa  50.1  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3903  metallo-beta-lactamase family protein  28.87 
 
 		 214 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3400  metallo-beta-lactamase family protein  28.87 
 
 		 214 aa  50.1  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00696268  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1632  metallo-beta-lactamase family protein  28.87 
 
 		 214 aa  50.1  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2417  beta-lactamase domain-containing protein  26.59 
 
 		 371 aa  49.7  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5569  beta-lactamase domain-containing protein  25.75 
 
 		 363 aa  49.7  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0506555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1621  Beta-lactamase-like  31.51 
 
 		 334 aa  49.7  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.683443  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  22.86 
 
 		 249 aa  49.7  0.00007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  27.33 
 
 		 215 aa  49.7  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0402  beta-lactamase domain protein  27.17 
 
 		 214 aa  49.7  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5818  beta-lactamase domain protein  29.02 
 
 		 294 aa  49.7  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  27.33 
 
 		 215 aa  49.3  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  27.33 
 
 		 215 aa  49.3  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  27.33 
 
 		 215 aa  49.3  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1235  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.92 
 
 		 256 aa  49.3  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0229191  normal  0.0959861 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2142  metallo-beta-lactamase family protein  27.5 
 
 		 214 aa  49.3  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.84321  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>