226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4226 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4226  beta-lactamase-like  100 
 
 		 306 aa  633  1e-180  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.733966  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0431  beta-lactamase domain-containing protein  74.92 
 
 		 309 aa  481  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3580  beta-lactamase-like  59.74 
 
 		 308 aa  367  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0515  beta-lactamase domain-containing protein  62.09 
 
 		 308 aa  365  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0129365 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0531  beta-lactamase domain protein  61.11 
 
 		 308 aa  357  9.999999999999999e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4202  beta-lactamase domain-containing protein  58.69 
 
 		 317 aa  356  2.9999999999999997e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2059  beta-lactamase domain-containing protein  59.8 
 
 		 310 aa  355  6.999999999999999e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0322253 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4770  beta-lactamase domain protein  55 
 
 		 309 aa  340  1e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1264  beta-lactamase domain-containing protein  55.37 
 
 		 319 aa  340  2e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0583  beta-lactamase domain-containing protein  53 
 
 		 307 aa  313  1.9999999999999998e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.266418 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0157  Beta-lactamase-like  54.24 
 
 		 314 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4274  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  53.54 
 
 		 306 aa  275  7e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0121  beta-lactamase-like protein  48.69 
 
 		 309 aa  275  8e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.381436  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0436  beta-lactamase domain protein  53.36 
 
 		 306 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0161  beta-lactamase domain-containing protein  54.44 
 
 		 306 aa  269  4e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0118  beta-lactamase domain protein  47.57 
 
 		 317 aa  268  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.464415 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0258  putative beta lactamase protein  47.57 
 
 		 319 aa  261  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.11853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0111  beta-lactamase domain protein  48.54 
 
 		 317 aa  260  2e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.524145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0083  Beta-lactamase-like  44.55 
 
 		 304 aa  258  1e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0756  beta-lactamase domain protein  44.74 
 
 		 306 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  29.1 
 
 		 329 aa  96.3  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0311  beta-lactamase domain-containing protein  24.53 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000202771  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0007  beta-lactamase domain protein  23.93 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.963887 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0329  beta-lactamase domain-containing protein  24.3 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000424657  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  29.04 
 
 		 313 aa  62  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2964  beta-lactamase-like  29.95 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.410641  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0213  beta-lactamase domain-containing protein  30.41 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.325973 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0269  Beta-lactamase-like  28.14 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120465  normal  0.961982 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  24.64 
 
 		 333 aa  58.5  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0267  beta-lactamase domain-containing protein  30.41 
 
 		 214 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0467  metallo-beta-lactamase family protein  25.22 
 
 		 262 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.56187 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2821  beta-lactamase-like  30.41 
 
 		 237 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3235  metallo-beta-lactamase family protein  26.94 
 
 		 213 aa  58.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0285  beta-lactamase domain-containing protein  30.41 
 
 		 214 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394027  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0194  beta-lactamase domain-containing protein  29.38 
 
 		 214 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.00000000306881 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  30.37 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0199  beta-lactamase domain-containing protein  29.9 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604325  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0740  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  0.429662 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4317  putative metallo-beta-lactamase family protein  28.21 
 
 		 214 aa  57  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3388  Beta-lactamase-like  29.9 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3151  metallo-beta-lactamase family protein  28.35 
 
 		 214 aa  55.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0785  metallo-beta-lactamase family protein  25.26 
 
 		 205 aa  55.1  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.721139  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1522  Beta-lactamase-like  31.71 
 
 		 214 aa  54.7  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3268  Beta-lactamase-like  28.57 
 
 		 216 aa  54.3  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3876  beta-lactamase domain protein  25.68 
 
 		 402 aa  53.9  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0044  metallo-beta-lactamase superfamily protein  28.89 
 
 		 214 aa  53.9  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  24.23 
 
 		 249 aa  53.9  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  25.26 
 
 		 217 aa  53.5  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3822  metallo-beta-lactamase family protein  28.89 
 
 		 214 aa  53.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2909  metallo-beta-lactamase family protein  28.33 
 
 		 214 aa  53.1  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.457315  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3400  metallo-beta-lactamase family protein  28.33 
 
 		 214 aa  53.1  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00696268  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1632  metallo-beta-lactamase family protein  28.33 
 
 		 214 aa  53.1  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3903  metallo-beta-lactamase family protein  28.33 
 
 		 214 aa  53.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2969  metallo-beta-lactamase family protein  28.33 
 
 		 214 aa  53.1  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  27.97 
 
 		 207 aa  52.8  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2620  beta-lactamase domain-containing protein  25.56 
 
 		 253 aa  52.8  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0339  beta-lactamase domain-containing protein  20.33 
 
 		 396 aa  52.4  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000206565  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1079  beta-lactamase domain protein  25.82 
 
 		 332 aa  52.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0383209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0402  beta-lactamase domain protein  25.37 
 
 		 214 aa  52  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  27.8 
 
 		 313 aa  52.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0376  beta-lactamase domain protein  27.06 
 
 		 308 aa  51.2  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2916  beta-lactamase-like protein  29.14 
 
 		 239 aa  51.6  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1344  beta-lactamase domain protein  27.64 
 
 		 311 aa  51.2  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0694  beta-lactamase domain protein  23.74 
 
 		 396 aa  50.8  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1415  beta-lactamase-like protein  26.86 
 
 		 288 aa  51.2  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0489899 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1494  beta-lactamase domain-containing protein  23.01 
 
 		 307 aa  51.6  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.321503  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0923  hydroxyacylglutathione hydrolase  25.97 
 
 		 260 aa  50.8  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.319486  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5067  beta-lactamase domain-containing protein  23.04 
 
 		 215 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.512117  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3433  beta-lactamase-like protein  28.88 
 
 		 222 aa  50.4  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1033  beta-lactamase domain protein  26.86 
 
 		 333 aa  50.4  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2185  beta-lactamase domain protein  25.44 
 
 		 305 aa  50.4  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.714423  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3474  metallo-beta-lactamase family protein  23.63 
 
 		 299 aa  50.4  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0280  beta-lactamase-like protein  27.04 
 
 		 305 aa  50.4  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.888975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1652  beta-lactamase domain-containing protein  24.49 
 
 		 326 aa  50.1  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.685243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1319  beta-lactamase domain protein  24.37 
 
 		 302 aa  50.1  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  24.38 
 
 		 304 aa  49.7  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3086  metallo-beta-lactamase family protein  25.18 
 
 		 349 aa  50.1  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.825394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04020  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  27.64 
 
 		 222 aa  50.1  0.00005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.626574 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1562  beta-lactamase domain-containing protein  24.78 
 
 		 252 aa  50.1  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.20369  hitchhiker  0.0000036598 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  24.18 
 
 		 214 aa  49.7  0.00006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  26.82 
 
 		 251 aa  49.3  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1595  Beta-lactamase-like  30.34 
 
 		 265 aa  48.9  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0082  beta-lactamase domain protein  24.32 
 
 		 414 aa  48.9  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.143007  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2284  uncharacterized flavoprotein  24.07 
 
 		 411 aa  48.9  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0014767  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2493  beta-lactamase-like  29.73 
 
 		 232 aa  48.9  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1991  beta-lactamase domain protein  32.11 
 
 		 310 aa  48.9  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2142  metallo-beta-lactamase family protein  27.33 
 
 		 214 aa  48.9  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.84321  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0203  beta-lactamase domain-containing protein  23.35 
 
 		 263 aa  48.9  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0208476  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0804  flavodoxin  24.69 
 
 		 402 aa  48.5  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1936  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  25.98 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  26.67 
 
 		 312 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  22.99 
 
 		 213 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00755  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  23.92 
 
 		 296 aa  47.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2556  beta-lactamase domain-containing protein  25.74 
 
 		 323 aa  47.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  31.01 
 
 		 220 aa  48.1  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  24.41 
 
 		 231 aa  48.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0418  beta-lactamase domain protein  23.72 
 
 		 212 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1646  beta-lactamase domain-containing protein  26.05 
 
 		 292 aa  47.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1863  hydroxyacylglutathione hydrolase  25.98 
 
 		 260 aa  47.8  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  30.17 
 
 		 208 aa  47.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>