More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2059 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2059  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 310 aa  630  1e-179  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0322253 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4202  beta-lactamase domain-containing protein  69.97 
 
 		 317 aa  418  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1264  beta-lactamase domain-containing protein  63.17 
 
 		 319 aa  385  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0515  beta-lactamase domain-containing protein  64.52 
 
 		 308 aa  373  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0129365 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0531  beta-lactamase domain protein  64.19 
 
 		 308 aa  369  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4226  beta-lactamase-like  59.8 
 
 		 306 aa  355  6.999999999999999e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.733966  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3580  beta-lactamase-like  59.03 
 
 		 308 aa  354  8.999999999999999e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4770  beta-lactamase domain protein  55.45 
 
 		 309 aa  347  1e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0431  beta-lactamase domain-containing protein  57.68 
 
 		 309 aa  343  2e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0583  beta-lactamase domain-containing protein  52 
 
 		 307 aa  283  2.0000000000000002e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.266418 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0157  Beta-lactamase-like  51.18 
 
 		 314 aa  268  5.9999999999999995e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0121  beta-lactamase-like protein  49.2 
 
 		 309 aa  262  6.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.381436  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0118  beta-lactamase domain protein  48.5 
 
 		 317 aa  261  8.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.464415 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0258  putative beta lactamase protein  48.58 
 
 		 319 aa  245  6.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.11853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4274  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  52.89 
 
 		 306 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0111  beta-lactamase domain protein  47.57 
 
 		 317 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.524145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0436  beta-lactamase domain protein  52.48 
 
 		 306 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0161  beta-lactamase domain-containing protein  49.61 
 
 		 306 aa  240  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0083  Beta-lactamase-like  44.75 
 
 		 304 aa  225  8e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0756  beta-lactamase domain protein  41.95 
 
 		 306 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  30.34 
 
 		 329 aa  95.5  9e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  28.5 
 
 		 349 aa  65.9  0.0000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  28.07 
 
 		 313 aa  63.9  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  25.18 
 
 		 352 aa  63.5  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  28.64 
 
 		 333 aa  61.6  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  24.75 
 
 		 249 aa  62  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  28.36 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  26.24 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  27.03 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  28.63 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0630  hypothetical protein  28.95 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0269  Beta-lactamase-like  28.57 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120465  normal  0.961982 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  31.28 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0353  beta-lactamase-like  22.78 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586247  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  25.6 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1306  metallo-beta-lactamase family protein  25.48 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  30.73 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0203  beta-lactamase domain-containing protein  28.76 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0208476  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  30.17 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  30.17 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1522  Beta-lactamase-like  32.78 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  30.17 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  35.25 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  25.91 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2674  beta-lactamase domain protein  25.91 
 
 		 319 aa  57  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0740  beta-lactamase domain protein  31.17 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  0.429662 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  26 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  30.17 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  30.17 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  30.17 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0007  beta-lactamase domain protein  28.12 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.963887 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  23.04 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0467  metallo-beta-lactamase family protein  27.16 
 
 		 262 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.56187 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  30.17 
 
 		 215 aa  55.8  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  27.75 
 
 		 251 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.96 
 
 		 215 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.96 
 
 		 215 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.96 
 
 		 215 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  22.67 
 
 		 324 aa  54.3  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000197877 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  24.75 
 
 		 299 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.96 
 
 		 215 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2186  beta-lactamase domain protein  32.67 
 
 		 210 aa  55.1  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.704345 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.96 
 
 		 215 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3235  metallo-beta-lactamase family protein  26.74 
 
 		 213 aa  53.9  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2395  beta-lactamase domain-containing protein  26.73 
 
 		 313 aa  53.9  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.335507 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1079  beta-lactamase domain protein  27.52 
 
 		 332 aa  53.9  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0383209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3433  beta-lactamase-like protein  29.86 
 
 		 222 aa  53.5  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1614  Beta-lactamase-like  27.14 
 
 		 339 aa  53.5  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.835771  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  25.52 
 
 		 313 aa  53.1  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  27.59 
 
 		 220 aa  53.1  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2964  beta-lactamase-like  29.08 
 
 		 292 aa  52.8  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.410641  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1649  beta-lactamase domain-containing protein  27.96 
 
 		 333 aa  52.8  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.658515 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2026  beta-lactamase domain protein  26.17 
 
 		 209 aa  52.8  0.000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000455404 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2397  putative hydrolase  26.67 
 
 		 210 aa  52.8  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2964  Beta-lactamase-like  28.81 
 
 		 318 aa  52.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0057  hypothetical protein  26.27 
 
 		 295 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1713  metallo-beta-lactamase family protein  28 
 
 		 212 aa  52  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06040  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  26.58 
 
 		 303 aa  51.6  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.692713 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0213  beta-lactamase domain-containing protein  24.86 
 
 		 214 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.325973 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0571  Zn-dependent hydrolase  24.75 
 
 		 260 aa  51.2  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  24.49 
 
 		 312 aa  51.2  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  25.73 
 
 		 287 aa  51.2  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  25 
 
 		 314 aa  51.2  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1562  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 252 aa  51.6  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.20369  hitchhiker  0.0000036598 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0462  beta-lactamase-like  26.14 
 
 		 292 aa  51.2  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2184  beta-lactamase domain-containing protein  31.4 
 
 		 215 aa  51.2  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0861591  normal  0.0986326 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1958  beta-lactamase domain-containing protein  26.22 
 
 		 209 aa  51.2  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0095  beta-lactamase domain-containing protein  25.98 
 
 		 315 aa  51.2  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1402  beta-lactamase domain-containing protein  26.96 
 
 		 204 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147744  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1619  zinc-dependent hydrolase  24.87 
 
 		 261 aa  50.8  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3466  beta-lactamase domain protein  27.01 
 
 		 218 aa  50.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4537  beta-lactamase domain protein  24.07 
 
 		 314 aa  50.8  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.630097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0561  beta-lactamase-like  23.83 
 
 		 260 aa  50.4  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0194  beta-lactamase domain-containing protein  26.06 
 
 		 214 aa  50.1  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.00000000306881 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3052  beta-lactamase domain protein  29.41 
 
 		 318 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.944882  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4192  beta-lactamase domain protein  28.66 
 
 		 297 aa  50.1  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0199  beta-lactamase domain-containing protein  24.18 
 
 		 214 aa  50.1  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604325  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00690  hypothetical protein  26.27 
 
 		 295 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.696824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1588  beta-lactamase domain-containing protein  28.43 
 
 		 237 aa  50.1  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0646  beta-lactamase domain protein  24.76 
 
 		 226 aa  49.7  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>