More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4274 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4274  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  100 
 
 		 306 aa  619  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0436  beta-lactamase domain protein  93.79 
 
 		 306 aa  585  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0161  beta-lactamase domain-containing protein  77.38 
 
 		 306 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0157  Beta-lactamase-like  56.42 
 
 		 314 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0258  putative beta lactamase protein  57.62 
 
 		 319 aa  317  2e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.11853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0118  beta-lactamase domain protein  56.46 
 
 		 317 aa  317  2e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.464415 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0121  beta-lactamase-like protein  54 
 
 		 309 aa  302  4.0000000000000003e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.381436  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0111  beta-lactamase domain protein  55.72 
 
 		 317 aa  301  7.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.524145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4770  beta-lactamase domain protein  57.43 
 
 		 309 aa  282  6.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0583  beta-lactamase domain-containing protein  49.66 
 
 		 307 aa  281  1e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.266418 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4202  beta-lactamase domain-containing protein  50.68 
 
 		 317 aa  276  4e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4226  beta-lactamase-like  53.54 
 
 		 306 aa  275  7e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.733966  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0431  beta-lactamase domain-containing protein  52.76 
 
 		 309 aa  273  3e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3580  beta-lactamase-like  53.75 
 
 		 308 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0531  beta-lactamase domain protein  55.79 
 
 		 308 aa  255  6e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0515  beta-lactamase domain-containing protein  55.37 
 
 		 308 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0129365 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1264  beta-lactamase domain-containing protein  46.64 
 
 		 319 aa  252  6e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0756  beta-lactamase domain protein  48.86 
 
 		 306 aa  251  1e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0083  Beta-lactamase-like  48.37 
 
 		 304 aa  248  1e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2059  beta-lactamase domain-containing protein  52.89 
 
 		 310 aa  244  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0322253 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  31.36 
 
 		 329 aa  90.9  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  26.9 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  26.44 
 
 		 231 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0390  beta-lactamase domain protein  28.85 
 
 		 318 aa  65.5  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01300  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  28.57 
 
 		 329 aa  64.3  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.528285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2186  beta-lactamase domain protein  31.53 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.704345 
 
 
-
 
NC_002950  PG1306  metallo-beta-lactamase family protein  29.15 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0991  hypothetical protein  28 
 
 		 317 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4245  hypothetical protein  27.27 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1958  beta-lactamase domain-containing protein  27.1 
 
 		 209 aa  61.6  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3993  beta-lactamase domain-containing protein  28.81 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582662 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0329  beta-lactamase domain-containing protein  23.29 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000424657  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0694  beta-lactamase domain protein  24.26 
 
 		 396 aa  59.7  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3876  beta-lactamase domain protein  24.49 
 
 		 402 aa  59.7  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2417  beta-lactamase domain-containing protein  26.02 
 
 		 371 aa  58.5  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3968  beta-lactamase domain-containing protein  26.09 
 
 		 317 aa  58.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0386675  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0839  beta-lactamase-like  25.1 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.228122 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  27.87 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4206  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  26.8 
 
 		 317 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1152  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  hitchhiker  0.0056375 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0923  beta-lactamase domain protein  25.94 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526967  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  24.76 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3882  Zn-dependent hydrolase  27.27 
 
 		 317 aa  57  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3890  zinc metallohydrolase  26.52 
 
 		 317 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.489775  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1132  beta-lactamase domain-containing protein  27.54 
 
 		 399 aa  57  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4159  hypothetical protein  26.52 
 
 		 317 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04020  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  27.84 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.626574 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0339  beta-lactamase domain-containing protein  22.27 
 
 		 396 aa  56.6  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000206565  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20140  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  29.58 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.428747 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1649  beta-lactamase domain-containing protein  24.62 
 
 		 333 aa  55.8  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.658515 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4562  Beta-lactamase-like  25.1 
 
 		 354 aa  55.8  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.809352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0051  beta-lactamase domain-containing protein  28.76 
 
 		 334 aa  55.8  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  28.14 
 
 		 321 aa  55.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0311  beta-lactamase domain-containing protein  20.93 
 
 		 291 aa  55.1  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000202771  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4269  hypothetical protein  26.4 
 
 		 317 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0740  beta-lactamase domain protein  33.77 
 
 		 304 aa  55.5  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  0.429662 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4188  beta-lactamase domain-containing protein  30.64 
 
 		 361 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  30.36 
 
 		 217 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2963  beta-lactamase domain-containing protein  26.98 
 
 		 298 aa  54.3  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.955909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  27.12 
 
 		 213 aa  54.3  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06350  uncharacterized flavoprotein  26.67 
 
 		 420 aa  54.7  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.882044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0069  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.53 
 
 		 255 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3058  beta-lactamase-like  23.73 
 
 		 329 aa  54.3  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  30.59 
 
 		 209 aa  53.9  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2461  beta-lactamase domain-containing protein  25.88 
 
 		 344 aa  54.3  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.889355 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0269  Beta-lactamase-like  25.45 
 
 		 297 aa  54.3  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120465  normal  0.961982 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4825  beta-lactamase-like  23.71 
 
 		 354 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.601465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25370  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  26.53 
 
 		 207 aa  53.9  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.555955 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0777  beta-lactamase domain-containing protein  24.17 
 
 		 352 aa  53.9  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.493847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1319  beta-lactamase domain protein  27.43 
 
 		 302 aa  53.9  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2832  beta-lactamase domain-containing protein  25.86 
 
 		 317 aa  54.3  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.422682  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5378  beta-lactamase domain protein  27.75 
 
 		 293 aa  53.9  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13255  normal  0.647715 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2285  beta-lactamase-like  23.63 
 
 		 311 aa  53.5  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0817874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3235  metallo-beta-lactamase family protein  26.73 
 
 		 213 aa  53.1  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  23.9 
 
 		 342 aa  52.8  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3086  metallo-beta-lactamase family protein  27.14 
 
 		 349 aa  52.8  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.825394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  28.83 
 
 		 209 aa  52.8  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1731  beta-lactamase domain protein  26.82 
 
 		 208 aa  52.8  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00010066  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1743  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.99 
 
 		 259 aa  52.8  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0994564 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1614  Beta-lactamase-like  28.42 
 
 		 339 aa  52.4  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.835771  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0680  beta-lactamase domain-containing protein  25.1 
 
 		 365 aa  52.4  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  23.89 
 
 		 287 aa  52.4  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0614  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.76 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.362443  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1975  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.99 
 
 		 259 aa  52.4  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0093  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.86 
 
 		 255 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.117082 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2397  beta-lactamase domain-containing protein  25.5 
 
 		 344 aa  52  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.21584  normal  0.814785 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4696  beta-lactamase domain-containing protein  28.2 
 
 		 400 aa  51.6  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.750931  normal  0.0866563 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1308  beta-lactamase domain-containing protein  22.75 
 
 		 246 aa  51.2  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1619  zinc-dependent hydrolase  26.44 
 
 		 261 aa  50.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0082  beta-lactamase domain protein  23.08 
 
 		 414 aa  51.2  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.143007  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0373  beta-lactamase-like protein  28.48 
 
 		 255 aa  51.2  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.717136 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0004  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  23.33 
 
 		 407 aa  51.2  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.351849  normal  0.58747 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0168  beta-lactamase domain protein  26.24 
 
 		 395 aa  51.6  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000343113 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1991  beta-lactamase domain protein  29.71 
 
 		 310 aa  51.2  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0321  beta-lactamase domain protein  21.37 
 
 		 396 aa  50.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0944004  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0559  hydroxyacylglutathione hydrolase  25.57 
 
 		 246 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.199984  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4155  beta-lactamase domain protein  25.37 
 
 		 212 aa  51.2  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000681201 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  27.43 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0864  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase superfamily protein  23.28 
 
 		 352 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2635  beta-lactamase domain protein  26.58 
 
 		 349 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>