283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0339 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0339  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
396 aa  811    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000206565  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1132  beta-lactamase domain-containing protein  65.49 
 
 
399 aa  560  1e-158  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0694  beta-lactamase domain protein  54.55 
 
 
396 aa  476  1e-133  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0286  beta-lactamase domain protein  51.64 
 
 
398 aa  462  1e-129  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0232  flavodoxin  50.76 
 
 
401 aa  410  1e-113  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0804  flavodoxin  47.75 
 
 
402 aa  392  1e-108  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3876  beta-lactamase domain protein  46.55 
 
 
402 aa  385  1e-106  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0082  beta-lactamase domain protein  42.82 
 
 
414 aa  322  5e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.143007  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2027  flavodoxin/nitric oxide synthase  39.6 
 
 
404 aa  317  3e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.719198  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0504  beta-lactamase domain protein  41.83 
 
 
405 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1485  beta-lactamase-like protein  39.75 
 
 
417 aa  278  1e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000931355  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2284  uncharacterized flavoprotein  35.56 
 
 
411 aa  266  5.999999999999999e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0014767  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1287  Beta-lactamase-like  37.06 
 
 
399 aa  266  5.999999999999999e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000705459 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06350  uncharacterized flavoprotein  37.36 
 
 
420 aa  263  3e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.882044  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2795  rubredoxin-oxygen oxidoreductase, putative  37.56 
 
 
395 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057389  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1078  metallo-beta-lactamase family protein  38.42 
 
 
408 aa  259  6e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0138  beta-lactamase domain protein  34.92 
 
 
401 aa  256  4e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.392817 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3253  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.1 
 
 
397 aa  256  7e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.233858  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1203  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  35.07 
 
 
405 aa  251  1e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2363  putative flavoprotein  34.01 
 
 
508 aa  247  3e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3960  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  34.25 
 
 
479 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02560  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  34.25 
 
 
479 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.54657  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2846  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  34.25 
 
 
479 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2994  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  34.25 
 
 
479 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2833  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  34.25 
 
 
479 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0125184 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02525  hypothetical protein  34.25 
 
 
479 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.459726  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0979  beta-lactamase domain protein  34 
 
 
479 aa  243  6e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00228257  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1002  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  34 
 
 
479 aa  243  6e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0118173  hitchhiker  0.000199326 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3167  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  34 
 
 
479 aa  241  1e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3699  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  34.51 
 
 
402 aa  242  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2889  beta-lactamase domain-containing protein  33.5 
 
 
410 aa  241  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.726482  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0262  beta-lactamase domain-containing protein  33.77 
 
 
387 aa  241  1e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2054  putative flavoprotein  35.77 
 
 
884 aa  241  2e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0448617  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3642  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  33.42 
 
 
392 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2960  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  34 
 
 
479 aa  239  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1187  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  35.1 
 
 
396 aa  239  5e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000111538  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1198  beta-lactamase domain-containing protein  35.71 
 
 
384 aa  239  8e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.523487  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3182  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  33.75 
 
 
482 aa  238  9e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001301  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  34.18 
 
 
500 aa  238  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.410803  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2991  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  33.75 
 
 
479 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69588  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3026  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  33.75 
 
 
479 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000635155 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3042  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  33.75 
 
 
479 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0301118 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2942  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  34.61 
 
 
397 aa  236  4e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0065497  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4053  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  34.18 
 
 
498 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0321  beta-lactamase domain protein  32.49 
 
 
396 aa  234  3e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0944004  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3149  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  33.5 
 
 
479 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.540983  normal  0.0409708 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0876  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.67 
 
 
394 aa  233  4.0000000000000004e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.0000000000000351493  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3033  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  33.42 
 
 
485 aa  233  4.0000000000000004e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.583429  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1583  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  35.23 
 
 
504 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.652829  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2654  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.33 
 
 
396 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3294  rubredoxin-oxygen oxidoreductase, putative  34.09 
 
 
404 aa  233  6e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2516  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
405 aa  232  8.000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.264357  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1021  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  33.16 
 
 
505 aa  231  2e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.527208  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2199  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  36.44 
 
 
499 aa  231  2e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3652  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  33.95 
 
 
493 aa  231  2e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0323  beta-lactamase domain-containing protein  33.67 
 
 
392 aa  230  3e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.625439  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0399  beta-lactamase domain protein  30.89 
 
 
396 aa  229  7e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3243  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  32.83 
 
 
404 aa  229  9e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.39456  hitchhiker  0.0000871777 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2179  flavodoxin  35.09 
 
 
393 aa  228  1e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.438585  normal  0.181254 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0284  metallo-beta-lactamase family protein  33.08 
 
 
399 aa  228  1e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3260  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  32.91 
 
 
494 aa  228  1e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0437217  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2294  beta-lactamase domain protein  32.07 
 
 
397 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000125791  hitchhiker  0.00000061463 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1435  beta-lactamase domain protein  32.35 
 
 
400 aa  228  2e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0275  metallo-beta-lactamase family flavodoxin  33.08 
 
 
399 aa  228  2e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0371  beta-lactamase domain-containing protein  32.25 
 
 
395 aa  227  3e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000174578  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2871  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  31.96 
 
 
397 aa  225  9e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000136277  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2180  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  30.38 
 
 
397 aa  224  2e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1269  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  32.14 
 
 
878 aa  223  4.9999999999999996e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0063  beta-lactamase domain protein  32.65 
 
 
400 aa  221  9.999999999999999e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3353  flavoprotein A  34.57 
 
 
403 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00104416  normal  0.102932 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2479  beta-lactamase domain protein  31.81 
 
 
402 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1091  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  31.89 
 
 
878 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.224862  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0168  beta-lactamase domain protein  31.62 
 
 
395 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000343113 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1770  beta-lactamase domain protein  36.34 
 
 
393 aa  219  6e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0784  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  32.91 
 
 
503 aa  219  7e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0906108  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1933  beta-lactamase domain-containing protein  34.35 
 
 
396 aa  219  7.999999999999999e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.837392  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0186  beta-lactamase domain protein  31.62 
 
 
395 aa  218  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.617182  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2383  beta-lactamase-like protein  32.83 
 
 
404 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3195  rubredoxin-oxygen oxidoreductase  31.73 
 
 
418 aa  216  5e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00034081  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1581  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  30.2 
 
 
401 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0482  beta-lactamase domain-containing protein  35.11 
 
 
387 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0202  beta-lactamase domain-containing protein  31.12 
 
 
402 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0005  beta-lactamase domain protein  31.25 
 
 
407 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2821  beta-lactamase domain-containing protein  32.58 
 
 
404 aa  213  5.999999999999999e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000596505  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2086  beta-lactamase domain-containing protein  32.83 
 
 
394 aa  212  7.999999999999999e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2480  beta-lactamase domain protein  33.16 
 
 
394 aa  211  1e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.877522  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0410  beta-lactamase domain-containing protein  32.09 
 
 
387 aa  211  2e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22500  beta-lactamase domain protein  33.07 
 
 
391 aa  209  6e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000416658  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0425  beta-lactamase domain-containing protein  34.16 
 
 
387 aa  206  5e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0026  beta-lactamase domain-containing protein  30.65 
 
 
407 aa  206  7e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0432  beta-lactamase domain-containing protein  30.71 
 
 
404 aa  205  1e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.253728  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2008  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  30.73 
 
 
407 aa  205  1e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0795  beta-lactamase-like  32.56 
 
 
395 aa  205  1e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0893314  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0614  beta-lactamase domain protein  32.83 
 
 
395 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2265  beta-lactamase domain protein  30.56 
 
 
407 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1413  beta-lactamase domain-containing protein  34.2 
 
 
392 aa  200  3e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1509  beta-lactamase domain-containing protein  33.08 
 
 
387 aa  199  9e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0012  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.05 
 
 
400 aa  198  1.0000000000000001e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.143481  normal  0.0465587 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0005  beta-lactamase domain protein  29.69 
 
 
407 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1920  beta-lactamase domain protein  31.98 
 
 
393 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>