225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0262 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0262  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
387 aa  802    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0063  beta-lactamase domain protein  55.36 
 
 
400 aa  447  1.0000000000000001e-124  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2480  beta-lactamase domain protein  53.08 
 
 
394 aa  437  1e-121  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.877522  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22500  beta-lactamase domain protein  55.64 
 
 
391 aa  426  1e-118  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000416658  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2795  rubredoxin-oxygen oxidoreductase, putative  50 
 
 
395 aa  382  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057389  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2654  flavodoxin/nitric oxide synthase  49.87 
 
 
396 aa  374  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0410  beta-lactamase domain-containing protein  47.88 
 
 
387 aa  374  1e-102  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1509  beta-lactamase domain-containing protein  47.61 
 
 
387 aa  369  1e-101  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3253  flavodoxin/nitric oxide synthase  46.23 
 
 
397 aa  369  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.233858  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2383  beta-lactamase-like protein  47.85 
 
 
404 aa  366  1e-100  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0138  beta-lactamase domain protein  46.56 
 
 
401 aa  365  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.392817 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0425  beta-lactamase domain-containing protein  47.62 
 
 
387 aa  367  1e-100  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1287  Beta-lactamase-like  45.01 
 
 
399 aa  353  2.9999999999999997e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000705459 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0202  beta-lactamase domain-containing protein  44.59 
 
 
402 aa  347  2e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0323  beta-lactamase domain-containing protein  43.57 
 
 
392 aa  345  7e-94  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.625439  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3353  flavoprotein A  45.01 
 
 
403 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00104416  normal  0.102932 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2516  beta-lactamase domain protein  44.56 
 
 
405 aa  342  5.999999999999999e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.264357  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2479  beta-lactamase domain protein  44.13 
 
 
402 aa  337  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3294  rubredoxin-oxygen oxidoreductase, putative  44.88 
 
 
404 aa  335  1e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3642  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  43.46 
 
 
392 aa  334  2e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0482  beta-lactamase domain-containing protein  46.95 
 
 
387 aa  334  2e-90  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3243  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  46.05 
 
 
404 aa  333  3e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.39456  hitchhiker  0.0000871777 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2265  beta-lactamase domain protein  45.34 
 
 
407 aa  332  6e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2012  beta-lactamase domain protein  43.15 
 
 
402 aa  330  4e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000125952  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0432  beta-lactamase domain-containing protein  46.02 
 
 
404 aa  321  9.999999999999999e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.253728  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1203  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  42.26 
 
 
405 aa  319  6e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3195  rubredoxin-oxygen oxidoreductase  42.05 
 
 
418 aa  318  7e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00034081  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1187  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  43.16 
 
 
396 aa  318  7e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000111538  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3699  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  42.11 
 
 
402 aa  317  3e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0012  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.75 
 
 
400 aa  315  9e-85  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.143481  normal  0.0465587 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2821  beta-lactamase domain-containing protein  44.32 
 
 
404 aa  315  9.999999999999999e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000596505  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2871  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  40.69 
 
 
397 aa  310  2e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000136277  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2942  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  40.63 
 
 
397 aa  301  9e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0065497  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1581  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  40.26 
 
 
401 aa  301  2e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2180  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  39.34 
 
 
397 aa  294  2e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001301  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  37.89 
 
 
500 aa  289  6e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.410803  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4053  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  39.35 
 
 
498 aa  286  4e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0979  beta-lactamase domain protein  39.11 
 
 
479 aa  285  9e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00228257  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1002  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  39.11 
 
 
479 aa  285  9e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0118173  hitchhiker  0.000199326 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2960  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  39.47 
 
 
479 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3026  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  39.47 
 
 
479 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000635155 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3652  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  37.98 
 
 
493 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3042  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  39.47 
 
 
479 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0301118 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2991  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  39.47 
 
 
479 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69588  normal  0.0152929 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02560  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  39.21 
 
 
479 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.54657  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02525  hypothetical protein  39.21 
 
 
479 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.459726  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2846  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  39.21 
 
 
479 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2994  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  39.21 
 
 
479 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3960  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  39.21 
 
 
479 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2833  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  39.21 
 
 
479 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0125184 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1583  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  39.69 
 
 
504 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.652829  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2199  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  38.86 
 
 
499 aa  282  6.000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3167  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  38.95 
 
 
479 aa  281  1e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3149  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  39.21 
 
 
479 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.540983  normal  0.0409708 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3182  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  38.85 
 
 
482 aa  279  6e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3033  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  38.48 
 
 
485 aa  278  1e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.583429  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1021  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  38.73 
 
 
505 aa  275  9e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.527208  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0321  beta-lactamase domain protein  38.44 
 
 
396 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0944004  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3260  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  38.36 
 
 
494 aa  273  3e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0437217  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1153  beta-lactamase domain-containing protein  41.91 
 
 
405 aa  273  5.000000000000001e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.187317  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0784  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  37.93 
 
 
503 aa  263  3e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0906108  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0450  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.48 
 
 
407 aa  259  6e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0386  beta-lactamase domain-containing protein  37.47 
 
 
407 aa  258  1e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.458991 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0456  beta-lactamase domain-containing protein  37.82 
 
 
407 aa  253  3e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0457  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.71 
 
 
406 aa  253  3e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0399  beta-lactamase domain protein  37.24 
 
 
396 aa  251  1e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2363  putative flavoprotein  36.79 
 
 
508 aa  245  8e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0284  metallo-beta-lactamase family protein  33.67 
 
 
399 aa  243  3e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0275  metallo-beta-lactamase family flavodoxin  33.67 
 
 
399 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1435  beta-lactamase domain protein  34.7 
 
 
400 aa  243  5e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0955  beta-lactamase domain-containing protein  38.02 
 
 
409 aa  242  6e-63  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.86403  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0339  beta-lactamase domain-containing protein  33.77 
 
 
396 aa  241  1e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000206565  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2294  beta-lactamase domain protein  36.53 
 
 
397 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000125791  hitchhiker  0.00000061463 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2054  putative flavoprotein  34.19 
 
 
884 aa  238  1e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0448617  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0004  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  35.26 
 
 
407 aa  237  2e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.351849  normal  0.58747 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1554  beta-lactamase-like  36.25 
 
 
410 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0457538  normal  0.358726 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0876  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.21 
 
 
394 aa  234  2.0000000000000002e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.0000000000000351493  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0005  beta-lactamase domain protein  34.48 
 
 
407 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1269  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  34.19 
 
 
878 aa  231  1e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1132  beta-lactamase domain-containing protein  33.85 
 
 
399 aa  232  1e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1091  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  33.93 
 
 
878 aa  230  3e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.224862  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0694  beta-lactamase domain protein  34.99 
 
 
396 aa  225  9e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0005  beta-lactamase domain protein  33.68 
 
 
407 aa  224  3e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0456333 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0005  beta-lactamase domain protein  35.58 
 
 
407 aa  224  3e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0006  beta-lactamase domain protein  34.3 
 
 
425 aa  223  6e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1451  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  33.08 
 
 
423 aa  220  3e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1933  beta-lactamase domain-containing protein  35.29 
 
 
396 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.837392  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1770  beta-lactamase domain protein  37.37 
 
 
393 aa  219  8.999999999999998e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2179  flavodoxin  34.81 
 
 
393 aa  218  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.438585  normal  0.181254 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1198  beta-lactamase domain-containing protein  36.06 
 
 
384 aa  217  2e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.523487  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0026  beta-lactamase domain-containing protein  34.05 
 
 
407 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2008  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  33.78 
 
 
407 aa  212  9e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3876  beta-lactamase domain protein  32.88 
 
 
402 aa  211  2e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0783  metallo-beta-lactamase family protein  35 
 
 
406 aa  210  3e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0371  beta-lactamase domain-containing protein  33.68 
 
 
395 aa  210  4e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000174578  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0286  beta-lactamase domain protein  32.19 
 
 
398 aa  209  5e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0770  metallo-beta-lactamase family protein  34.72 
 
 
406 aa  207  2e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.226143  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1920  beta-lactamase domain protein  35.13 
 
 
393 aa  206  4e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3191  hypothetical protein  31.88 
 
 
431 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0795  beta-lactamase-like  34.19 
 
 
395 aa  205  1e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0893314  normal  0.11395 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>