More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2054 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1269  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  44.71 
 
 
878 aa  743    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1091  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  45.06 
 
 
878 aa  746    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.224862  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2054  putative flavoprotein  100 
 
 
884 aa  1811    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0448617  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2363  putative flavoprotein  61.79 
 
 
508 aa  548  1e-154  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1435  beta-lactamase domain protein  56 
 
 
400 aa  473  1e-132  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0284  metallo-beta-lactamase family protein  52.37 
 
 
399 aa  436  1e-120  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0275  metallo-beta-lactamase family flavodoxin  52.12 
 
 
399 aa  433  1e-120  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2294  beta-lactamase domain protein  51.01 
 
 
397 aa  421  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000125791  hitchhiker  0.00000061463 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0005  beta-lactamase domain protein  43.53 
 
 
407 aa  368  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0456333 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0005  beta-lactamase domain protein  44.08 
 
 
407 aa  360  7e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0006  beta-lactamase domain protein  42.79 
 
 
425 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2008  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  42.75 
 
 
407 aa  351  4e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0005  beta-lactamase domain protein  42.79 
 
 
407 aa  349  1e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0004  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  42.96 
 
 
407 aa  348  3e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.351849  normal  0.58747 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0026  beta-lactamase domain-containing protein  43.03 
 
 
407 aa  347  5e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0399  beta-lactamase domain protein  41.69 
 
 
396 aa  335  2e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0186  beta-lactamase domain protein  42.11 
 
 
395 aa  329  1.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.617182  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0371  beta-lactamase domain-containing protein  41.29 
 
 
395 aa  328  3e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000174578  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0168  beta-lactamase domain protein  41.35 
 
 
395 aa  326  1e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000343113 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1451  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  41.5 
 
 
423 aa  325  2e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3930  beta-lactamase domain-containing protein  38.48 
 
 
421 aa  296  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452663  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3191  hypothetical protein  37.66 
 
 
431 aa  290  6e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3191  flavodoxin  37.95 
 
 
409 aa  290  8e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0415851  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2460  NAD(FAD)-dependent dehydrogenase or nitrite reductase  37.08 
 
 
501 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000440664  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1287  Beta-lactamase-like  36.03 
 
 
399 aa  251  5e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000705459 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3699  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  36.39 
 
 
402 aa  248  4e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3253  flavodoxin/nitric oxide synthase  35.4 
 
 
397 aa  246  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.233858  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4053  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  34.74 
 
 
498 aa  246  1.9999999999999999e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1203  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  35.68 
 
 
405 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22500  beta-lactamase domain protein  36.76 
 
 
391 aa  243  1e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000416658  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1498  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.77 
 
 
393 aa  243  1e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1581  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  34.48 
 
 
401 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0339  beta-lactamase domain-containing protein  35.1 
 
 
396 aa  241  4e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000206565  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1495  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.74 
 
 
392 aa  241  5e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00643528  hitchhiker  0.000000064217 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3496  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.05 
 
 
520 aa  241  5.999999999999999e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0784  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  34.24 
 
 
503 aa  240  6.999999999999999e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0906108  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1021  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  34 
 
 
505 aa  240  1e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.527208  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2199  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  34.69 
 
 
499 aa  239  1e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1187  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  33.83 
 
 
396 aa  239  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000111538  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0262  beta-lactamase domain-containing protein  34.19 
 
 
387 aa  238  3e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1583  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  32.92 
 
 
504 aa  237  8e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.652829  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3042  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  32.15 
 
 
479 aa  236  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0301118 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1809  flavoprotein  35.37 
 
 
571 aa  236  1.0000000000000001e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2991  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  32.15 
 
 
479 aa  235  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69588  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3026  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  32.15 
 
 
479 aa  236  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000635155 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3182  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  34.17 
 
 
482 aa  236  2.0000000000000002e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2960  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  32.49 
 
 
479 aa  236  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3033  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  31.82 
 
 
485 aa  235  3e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.583429  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2846  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  31.82 
 
 
479 aa  235  3e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3960  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  31.4 
 
 
479 aa  234  5e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0410  beta-lactamase domain-containing protein  32.91 
 
 
387 aa  234  6e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2994  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  31.4 
 
 
479 aa  234  7.000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2833  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  31.4 
 
 
479 aa  234  7.000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0125184 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02560  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  31.4 
 
 
479 aa  233  8.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.54657  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001301  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  32.76 
 
 
500 aa  233  8.000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.410803  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02525  hypothetical protein  31.4 
 
 
479 aa  233  8.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.459726  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0425  beta-lactamase domain-containing protein  32.91 
 
 
387 aa  233  1e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0102  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.42 
 
 
399 aa  233  1e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000657276  hitchhiker  8.86215e-18 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1439  flavin reductase-like, FMN-binding  35.14 
 
 
579 aa  233  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1857  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.92 
 
 
574 aa  233  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0979  beta-lactamase domain protein  31.2 
 
 
479 aa  232  2e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00228257  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2179  flavodoxin  32.65 
 
 
393 aa  232  2e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.438585  normal  0.181254 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1002  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  31.2 
 
 
479 aa  232  2e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0118173  hitchhiker  0.000199326 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4140  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  32.27 
 
 
572 aa  232  2e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3652  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  32.51 
 
 
493 aa  232  3e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3167  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  31.2 
 
 
479 aa  231  3e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3149  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  31.93 
 
 
479 aa  232  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.540983  normal  0.0409708 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3260  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  33.25 
 
 
494 aa  232  3e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0437217  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3353  flavoprotein A  34.51 
 
 
403 aa  231  4e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00104416  normal  0.102932 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.77 
 
 
576 aa  231  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0876298  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2383  beta-lactamase-like protein  34.15 
 
 
404 aa  231  5e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3604  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.46 
 
 
576 aa  228  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0302  flavin reductase-like, FMN-binding  35.38 
 
 
575 aa  228  3e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225736  normal  0.971222 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0479  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.38 
 
 
575 aa  228  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3642  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  32.5 
 
 
392 aa  228  4e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1509  beta-lactamase domain-containing protein  32.41 
 
 
387 aa  228  5.0000000000000005e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2516  beta-lactamase domain protein  32.18 
 
 
405 aa  227  6e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.264357  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1371  flavin reductase-like, FMN-binding  34.76 
 
 
576 aa  227  8e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0719317 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2965  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirB  34.69 
 
 
817 aa  226  2e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2871  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  34.18 
 
 
397 aa  224  4e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000136277  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1163  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  36.1 
 
 
582 aa  224  6e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1132  beta-lactamase domain-containing protein  35.65 
 
 
399 aa  224  7e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0202  beta-lactamase domain-containing protein  32.92 
 
 
402 aa  224  7e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1131  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  33.16 
 
 
435 aa  222  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.456139  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3294  rubredoxin-oxygen oxidoreductase, putative  34.06 
 
 
404 aa  223  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2265  beta-lactamase domain protein  33.41 
 
 
407 aa  223  1.9999999999999999e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0321  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
396 aa  222  3e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0944004  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3195  rubredoxin-oxygen oxidoreductase  32.35 
 
 
418 aa  221  5e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00034081  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0323  beta-lactamase domain-containing protein  30.92 
 
 
392 aa  220  1e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.625439  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0286  beta-lactamase domain protein  30.75 
 
 
398 aa  219  2e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0694  beta-lactamase domain protein  30.42 
 
 
396 aa  219  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2358  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.42 
 
 
422 aa  218  5e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000491843  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_949  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  33.16 
 
 
435 aa  217  8e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00214218  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2180  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  33.99 
 
 
397 aa  217  9e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2771  beta-lactamase-like protein  36.78 
 
 
378 aa  217  9e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2530  flavoprotein  34.77 
 
 
582 aa  217  9e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.707378 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0960  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.65 
 
 
435 aa  216  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000270205  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1198  beta-lactamase domain-containing protein  32.15 
 
 
384 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.523487  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0783  metallo-beta-lactamase family protein  35.04 
 
 
406 aa  216  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2795  rubredoxin-oxygen oxidoreductase, putative  32.49 
 
 
395 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>