247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2771 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2771  beta-lactamase-like protein  100 
 
 
378 aa  769    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0783  metallo-beta-lactamase family protein  51.99 
 
 
406 aa  363  2e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0770  metallo-beta-lactamase family protein  51.99 
 
 
406 aa  362  6e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.226143  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0275  metallo-beta-lactamase family flavodoxin  38.63 
 
 
399 aa  246  4e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0284  metallo-beta-lactamase family protein  38.36 
 
 
399 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2294  beta-lactamase domain protein  37.8 
 
 
397 aa  235  9e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000125791  hitchhiker  0.00000061463 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1269  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  37.11 
 
 
878 aa  233  3e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1091  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  36.84 
 
 
878 aa  232  9e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.224862  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2008  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  34.96 
 
 
407 aa  227  2e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2054  putative flavoprotein  36.78 
 
 
884 aa  228  2e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0448617  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0005  beta-lactamase domain protein  33.51 
 
 
407 aa  226  3e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1451  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  36.02 
 
 
423 aa  224  1e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0006  beta-lactamase domain protein  34.42 
 
 
425 aa  224  2e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0005  beta-lactamase domain protein  36.25 
 
 
407 aa  224  3e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2363  putative flavoprotein  34.67 
 
 
508 aa  224  3e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2383  beta-lactamase-like protein  35.15 
 
 
404 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0262  beta-lactamase domain-containing protein  37.76 
 
 
387 aa  217  2.9999999999999998e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0026  beta-lactamase domain-containing protein  34.44 
 
 
407 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1435  beta-lactamase domain protein  35.2 
 
 
400 aa  216  4e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2846  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  36.12 
 
 
479 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3960  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  36.12 
 
 
479 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02560  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  36.12 
 
 
479 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.54657  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2833  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  36.12 
 
 
479 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0125184 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02525  hypothetical protein  36.12 
 
 
479 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.459726  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2994  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  36.12 
 
 
479 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3167  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  36.12 
 
 
479 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0979  beta-lactamase domain protein  35.85 
 
 
479 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00228257  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1002  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  35.85 
 
 
479 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0118173  hitchhiker  0.000199326 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0399  beta-lactamase domain protein  36.17 
 
 
396 aa  212  7.999999999999999e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1021  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  35.37 
 
 
505 aa  212  7.999999999999999e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.527208  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0410  beta-lactamase domain-containing protein  35.95 
 
 
387 aa  211  1e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0202  beta-lactamase domain-containing protein  32.62 
 
 
402 aa  212  1e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3042  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  35.31 
 
 
479 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0301118 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2991  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  35.31 
 
 
479 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69588  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3026  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  35.36 
 
 
479 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000635155 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2960  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  35.31 
 
 
479 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3149  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  35.31 
 
 
479 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.540983  normal  0.0409708 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0784  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  35.37 
 
 
503 aa  210  3e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0906108  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3033  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  38.34 
 
 
485 aa  210  4e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.583429  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2479  beta-lactamase domain protein  33.05 
 
 
402 aa  209  9e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3294  rubredoxin-oxygen oxidoreductase, putative  35.26 
 
 
404 aa  208  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3182  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  35.18 
 
 
482 aa  207  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0482  beta-lactamase domain-containing protein  37.5 
 
 
387 aa  206  4e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3260  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  35.11 
 
 
494 aa  206  5e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0437217  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2942  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  37.99 
 
 
397 aa  206  5e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0065497  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3642  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  33.7 
 
 
392 aa  206  5e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0371  beta-lactamase domain-containing protein  32.09 
 
 
395 aa  206  8e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000174578  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1583  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  37.69 
 
 
504 aa  206  8e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.652829  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3253  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.18 
 
 
397 aa  205  8e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.233858  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0005  beta-lactamase domain protein  31.99 
 
 
407 aa  205  1e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0456333 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0004  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  34.44 
 
 
407 aa  204  2e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.351849  normal  0.58747 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3652  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  38.04 
 
 
493 aa  203  3e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1203  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  36.47 
 
 
405 aa  203  3e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0138  beta-lactamase domain protein  32.88 
 
 
401 aa  204  3e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.392817 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4053  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  37.69 
 
 
498 aa  203  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1287  Beta-lactamase-like  34.23 
 
 
399 aa  202  7e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000705459 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22500  beta-lactamase domain protein  36.56 
 
 
391 aa  202  8e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000416658  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3930  beta-lactamase domain-containing protein  33.42 
 
 
421 aa  202  9e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452663  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3195  rubredoxin-oxygen oxidoreductase  34.15 
 
 
418 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00034081  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001301  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  36.81 
 
 
500 aa  201  3e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.410803  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0323  beta-lactamase domain-containing protein  33.6 
 
 
392 aa  199  9e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.625439  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2199  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  37.42 
 
 
499 aa  198  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1509  beta-lactamase domain-containing protein  34.44 
 
 
387 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3191  hypothetical protein  32.52 
 
 
431 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3191  flavodoxin  32.97 
 
 
409 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0415851  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0425  beta-lactamase domain-containing protein  34.74 
 
 
387 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1187  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  37.69 
 
 
396 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000111538  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2871  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  32.97 
 
 
397 aa  197  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000136277  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3699  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  35.87 
 
 
402 aa  196  5.000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1198  beta-lactamase domain-containing protein  34.15 
 
 
384 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.523487  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0321  beta-lactamase domain protein  34.76 
 
 
396 aa  196  8.000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0944004  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1581  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  36.06 
 
 
401 aa  194  2e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2795  rubredoxin-oxygen oxidoreductase, putative  31.47 
 
 
395 aa  191  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057389  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1933  beta-lactamase domain-containing protein  33.53 
 
 
396 aa  192  1e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.837392  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2516  beta-lactamase domain protein  31 
 
 
405 aa  191  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.264357  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3243  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  32.72 
 
 
404 aa  191  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.39456  hitchhiker  0.0000871777 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0168  beta-lactamase domain protein  30.58 
 
 
395 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000343113 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0186  beta-lactamase domain protein  31.32 
 
 
395 aa  188  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.617182  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3353  flavoprotein A  34.74 
 
 
403 aa  186  4e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00104416  normal  0.102932 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0339  beta-lactamase domain-containing protein  32.39 
 
 
396 aa  186  7e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000206565  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1413  beta-lactamase domain-containing protein  34.64 
 
 
392 aa  185  9e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2012  beta-lactamase domain protein  32.92 
 
 
402 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000125952  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2086  beta-lactamase domain-containing protein  33.63 
 
 
394 aa  183  4.0000000000000006e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2179  flavodoxin  33.44 
 
 
393 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.438585  normal  0.181254 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2654  flavodoxin/nitric oxide synthase  30 
 
 
396 aa  181  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0432  beta-lactamase domain-containing protein  32.55 
 
 
404 aa  181  1e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.253728  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2265  beta-lactamase domain protein  35.4 
 
 
407 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0876  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.48 
 
 
394 aa  179  4.999999999999999e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.0000000000000351493  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1132  beta-lactamase domain-containing protein  31.42 
 
 
399 aa  178  1e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1770  beta-lactamase domain protein  34.24 
 
 
393 aa  177  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2480  beta-lactamase domain protein  32.23 
 
 
394 aa  177  2e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.877522  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0063  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
400 aa  177  2e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2821  beta-lactamase domain-containing protein  32.73 
 
 
404 aa  176  6e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000596505  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0795  beta-lactamase-like  33.14 
 
 
395 aa  176  8e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0893314  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2284  uncharacterized flavoprotein  32.45 
 
 
411 aa  175  9e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0014767  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2180  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  31.52 
 
 
397 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0614  beta-lactamase domain protein  32.51 
 
 
395 aa  171  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0174  ATPase domain-containing protein  33.04 
 
 
394 aa  171  2e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0286  beta-lactamase domain protein  30.56 
 
 
398 aa  168  1e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0012  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.35 
 
 
400 aa  168  1e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.143481  normal  0.0465587 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>