More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2199 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02560  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  70.48 
 
 		 479 aa  752    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.54657  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0979  beta-lactamase domain protein  70.28 
 
 		 479 aa  752    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00228257  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3033  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  70.71 
 
 		 485 aa  754    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.583429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001301  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  80.08 
 
 		 500 aa  850    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.410803  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3182  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  69.88 
 
 		 482 aa  746    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02525  hypothetical protein  70.48 
 
 		 479 aa  752    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.459726  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3149  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  70.71 
 
 		 479 aa  753    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.540983  normal  0.0409708 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2991  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  70.71 
 
 		 479 aa  757    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69588  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3260  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  72.32 
 
 		 494 aa  773    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0437217  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0784  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  70.78 
 
 		 503 aa  747    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0906108  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4053  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  76.41 
 
 		 498 aa  823    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1002  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  70.28 
 
 		 479 aa  752    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0118173  hitchhiker  0.000199326 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1021  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  71.06 
 
 		 505 aa  778    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.527208  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2199  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  100 
 
 		 499 aa  1048    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3167  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  70.08 
 
 		 479 aa  749    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3042  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  71.11 
 
 		 479 aa  758    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0301118 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3652  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  79.44 
 
 		 493 aa  838    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2846  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  70.28 
 
 		 479 aa  752    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3026  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  70.91 
 
 		 479 aa  757    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000635155 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2960  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  70.91 
 
 		 479 aa  755    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1583  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  77.62 
 
 		 504 aa  827    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.652829  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2994  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  70.28 
 
 		 479 aa  752    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3960  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  70.08 
 
 		 479 aa  750    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2833  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  70.28 
 
 		 479 aa  750    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0125184 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3699  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  58.73 
 
 		 402 aa  495  1e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1203  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  56.05 
 
 		 405 aa  475  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2871  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  52.66 
 
 		 397 aa  458  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000136277  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1187  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  52.28 
 
 		 396 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000111538  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1581  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  53.45 
 
 		 401 aa  441  9.999999999999999e-123  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3642  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  50.51 
 
 		 392 aa  425  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2180  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  50.76 
 
 		 397 aa  415  1e-114  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2942  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  49.75 
 
 		 397 aa  411  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0065497  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0321  beta-lactamase domain protein  47.37 
 
 		 396 aa  393  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0944004  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1287  Beta-lactamase-like  41.81 
 
 		 399 aa  346  7e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000705459 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0432  beta-lactamase domain-containing protein  40.94 
 
 		 404 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.253728  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2265  beta-lactamase domain protein  40.85 
 
 		 407 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2383  beta-lactamase-like protein  40.25 
 
 		 404 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3253  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.34 
 
 		 397 aa  301  2e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.233858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2516  beta-lactamase domain protein  37.85 
 
 		 405 aa  297  2e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.264357  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3243  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  36.68 
 
 		 404 aa  292  1e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.39456  hitchhiker  0.0000871777 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3294  rubredoxin-oxygen oxidoreductase, putative  38.1 
 
 		 404 aa  290  6e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2795  rubredoxin-oxygen oxidoreductase, putative  37.66 
 
 		 395 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057389  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0410  beta-lactamase domain-containing protein  38.13 
 
 		 387 aa  286  5.999999999999999e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3353  flavoprotein A  38.99 
 
 		 403 aa  286  7e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00104416  normal  0.102932 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0262  beta-lactamase domain-containing protein  38.86 
 
 		 387 aa  282  8.000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1153  beta-lactamase domain-containing protein  39.3 
 
 		 405 aa  282  1e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.187317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2821  beta-lactamase domain-containing protein  37.44 
 
 		 404 aa  281  1e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000596505  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0323  beta-lactamase domain-containing protein  37.28 
 
 		 392 aa  276  5e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.625439  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0386  beta-lactamase domain-containing protein  38.18 
 
 		 407 aa  276  5e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.458991 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1554  beta-lactamase-like  39.36 
 
 		 410 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0457538  normal  0.358726 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0138  beta-lactamase domain protein  35.13 
 
 		 401 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.392817 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0450  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.53 
 
 		 407 aa  274  3e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0482  beta-lactamase domain-containing protein  38.78 
 
 		 387 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0425  beta-lactamase domain-containing protein  37.63 
 
 		 387 aa  273  5.000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0456  beta-lactamase domain-containing protein  38.65 
 
 		 407 aa  271  2e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22500  beta-lactamase domain protein  36.44 
 
 		 391 aa  271  2e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000416658  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0202  beta-lactamase domain-containing protein  36.2 
 
 		 402 aa  269  1e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1509  beta-lactamase domain-containing protein  36.62 
 
 		 387 aa  269  1e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3195  rubredoxin-oxygen oxidoreductase  37.41 
 
 		 418 aa  266  5e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00034081  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2654  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.52 
 
 		 396 aa  266  8.999999999999999e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0457  flavodoxin/nitric oxide synthase  39.52 
 
 		 406 aa  261  2e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2480  beta-lactamase domain protein  36.39 
 
 		 394 aa  259  6e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.877522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0012  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.16 
 
 		 400 aa  258  1e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.143481  normal  0.0465587 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2479  beta-lactamase domain protein  34.16 
 
 		 402 aa  251  3e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0955  beta-lactamase domain-containing protein  36.97 
 
 		 409 aa  249  5e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.86403  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0063  beta-lactamase domain protein  35.22 
 
 		 400 aa  249  1e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2294  beta-lactamase domain protein  34.85 
 
 		 397 aa  247  3e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000125791  hitchhiker  0.00000061463 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2012  beta-lactamase domain protein  33.84 
 
 		 402 aa  244  3e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000125952  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2054  putative flavoprotein  34.69 
 
 		 884 aa  239  6.999999999999999e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0448617  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0339  beta-lactamase domain-containing protein  36.44 
 
 		 396 aa  231  2e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000206565  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1451  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  34.32 
 
 		 423 aa  229  1e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1132  beta-lactamase domain-containing protein  34.92 
 
 		 399 aa  227  3e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2363  putative flavoprotein  32.47 
 
 		 508 aa  222  9.999999999999999e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0284  metallo-beta-lactamase family protein  32.99 
 
 		 399 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0399  beta-lactamase domain protein  33 
 
 		 396 aa  221  3e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0275  metallo-beta-lactamase family flavodoxin  32.99 
 
 		 399 aa  221  3e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1269  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  29.25 
 
 		 878 aa  220  3.9999999999999997e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1091  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  29.25 
 
 		 878 aa  219  6e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.224862  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2179  flavodoxin  31.04 
 
 		 393 aa  217  4e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.438585  normal  0.181254 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1198  beta-lactamase domain-containing protein  34.16 
 
 		 384 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.523487  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1435  beta-lactamase domain protein  33.42 
 
 		 400 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0694  beta-lactamase domain protein  31.99 
 
 		 396 aa  214  2.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0371  beta-lactamase domain-containing protein  32.75 
 
 		 395 aa  212  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000174578  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1770  beta-lactamase domain protein  31.51 
 
 		 393 aa  204  3e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0795  beta-lactamase-like  32.41 
 
 		 395 aa  203  4e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0893314  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2508  beta-lactamase domain protein  30.05 
 
 		 571 aa  203  6e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00548626  normal  0.224479 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0005  beta-lactamase domain protein  32.76 
 
 		 407 aa  202  9e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0481  beta-lactamase domain protein  30.84 
 
 		 576 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0286  beta-lactamase domain protein  30.48 
 
 		 398 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3606  beta-lactamase domain protein  29.47 
 
 		 571 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0783  metallo-beta-lactamase family protein  34.16 
 
 		 406 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1369  flavin reductase-like, FMN-binding  31.83 
 
 		 575 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.018202 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1933  beta-lactamase domain-containing protein  34.28 
 
 		 396 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.837392  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0770  metallo-beta-lactamase family protein  34.16 
 
 		 406 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.226143  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1078  metallo-beta-lactamase family protein  34.72 
 
 		 408 aa  197  3e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2008  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  31.76 
 
 		 407 aa  197  3e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1809  flavoprotein  29.97 
 
 		 571 aa  197  4.0000000000000005e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3191  hypothetical protein  30.66 
 
 		 431 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0186  beta-lactamase domain protein  31.16 
 
 		 395 aa  196  7e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.617182  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0168  beta-lactamase domain protein  30.65 
 
 		 395 aa  196  7e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000343113 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>