247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0005 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0005  beta-lactamase domain protein  73.71 
 
 
407 aa  659    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0456333 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0006  beta-lactamase domain protein  75.18 
 
 
425 aa  669    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0005  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
407 aa  846    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0004  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  81.57 
 
 
407 aa  720    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.351849  normal  0.58747 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2008  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  81.57 
 
 
407 aa  728    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0005  beta-lactamase domain protein  82.31 
 
 
407 aa  725    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0026  beta-lactamase domain-containing protein  82.8 
 
 
407 aa  728    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1435  beta-lactamase domain protein  48.25 
 
 
400 aa  374  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2294  beta-lactamase domain protein  45.15 
 
 
397 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000125791  hitchhiker  0.00000061463 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2363  putative flavoprotein  44.56 
 
 
508 aa  371  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0284  metallo-beta-lactamase family protein  47.81 
 
 
399 aa  367  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0275  metallo-beta-lactamase family flavodoxin  47.56 
 
 
399 aa  364  1e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1269  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  47 
 
 
878 aa  363  3e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1091  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  47 
 
 
878 aa  362  7.0000000000000005e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.224862  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2054  putative flavoprotein  44.08 
 
 
884 aa  360  3e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0448617  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1451  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  41.83 
 
 
423 aa  323  3e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3191  hypothetical protein  38.68 
 
 
431 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0186  beta-lactamase domain protein  39.55 
 
 
395 aa  312  5.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.617182  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0168  beta-lactamase domain protein  39.55 
 
 
395 aa  311  2e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000343113 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0371  beta-lactamase domain-containing protein  39.29 
 
 
395 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000174578  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3930  beta-lactamase domain-containing protein  37.47 
 
 
421 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452663  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3191  flavodoxin  37.79 
 
 
409 aa  301  2e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0415851  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0399  beta-lactamase domain protein  37.15 
 
 
396 aa  291  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1809  flavoprotein  36.71 
 
 
571 aa  257  3e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2966  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.1 
 
 
575 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.928033 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0410  beta-lactamase domain-containing protein  34.19 
 
 
387 aa  241  2e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3699  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  35.48 
 
 
402 aa  239  6.999999999999999e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0302  flavin reductase-like, FMN-binding  34.55 
 
 
575 aa  236  6e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225736  normal  0.971222 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1187  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  34.51 
 
 
396 aa  236  7e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000111538  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3294  rubredoxin-oxygen oxidoreductase, putative  32.84 
 
 
404 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0425  beta-lactamase domain-containing protein  32.9 
 
 
387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2821  beta-lactamase domain-containing protein  33.09 
 
 
404 aa  233  6e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000596505  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1581  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  33.69 
 
 
401 aa  231  1e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1287  Beta-lactamase-like  31.94 
 
 
399 aa  232  1e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000705459 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1203  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  34.52 
 
 
405 aa  231  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3604  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.17 
 
 
576 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3243  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  32.19 
 
 
404 aa  230  3e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.39456  hitchhiker  0.0000871777 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2871  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  34.5 
 
 
397 aa  230  4e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000136277  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.61 
 
 
576 aa  229  7e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0876298  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0323  beta-lactamase domain-containing protein  32.66 
 
 
392 aa  228  1e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.625439  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0666  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.16 
 
 
575 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0685  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.16 
 
 
575 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3353  flavoprotein A  32.92 
 
 
403 aa  226  4e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00104416  normal  0.102932 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3253  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.23 
 
 
397 aa  225  1e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.233858  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1509  beta-lactamase domain-containing protein  32.13 
 
 
387 aa  224  2e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2479  beta-lactamase domain protein  32.09 
 
 
402 aa  224  3e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0262  beta-lactamase domain-containing protein  35.58 
 
 
387 aa  224  3e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0479  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.2 
 
 
575 aa  223  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2383  beta-lactamase-like protein  32.34 
 
 
404 aa  222  8e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1163  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  32.15 
 
 
582 aa  222  8e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2179  flavodoxin  32.49 
 
 
393 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.438585  normal  0.181254 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0202  beta-lactamase domain-containing protein  31.76 
 
 
402 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2994  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  33.75 
 
 
479 aa  220  3e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02560  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  33.75 
 
 
479 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.54657  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3960  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  33.75 
 
 
479 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02525  hypothetical protein  33.75 
 
 
479 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.459726  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2846  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  33.75 
 
 
479 aa  220  5e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2833  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  33.75 
 
 
479 aa  219  5e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0125184 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2795  rubredoxin-oxygen oxidoreductase, putative  32.4 
 
 
395 aa  219  7e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057389  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0979  beta-lactamase domain protein  33.5 
 
 
479 aa  218  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00228257  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1002  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  33.5 
 
 
479 aa  218  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0118173  hitchhiker  0.000199326 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0482  beta-lactamase domain-containing protein  33.59 
 
 
387 aa  218  1e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2960  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  33.5 
 
 
479 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4140  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  31.65 
 
 
572 aa  218  1e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3167  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  33.75 
 
 
479 aa  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1802  flavin reductase-like, FMN-binding  33.33 
 
 
574 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3042  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  33.25 
 
 
479 aa  217  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0301118 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2991  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  33.25 
 
 
479 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69588  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3026  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  33.25 
 
 
479 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000635155 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1371  flavin reductase-like, FMN-binding  35.46 
 
 
576 aa  216  7e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0719317 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1439  flavin reductase-like, FMN-binding  30.69 
 
 
579 aa  216  8e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0339  beta-lactamase domain-containing protein  31.25 
 
 
396 aa  214  1.9999999999999998e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000206565  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0694  beta-lactamase domain protein  31.58 
 
 
396 aa  214  1.9999999999999998e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1583  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  33.25 
 
 
504 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.652829  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3149  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  33 
 
 
479 aa  213  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.540983  normal  0.0409708 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3642  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  31.49 
 
 
392 aa  212  7.999999999999999e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1369  flavin reductase-like, FMN-binding  31.91 
 
 
575 aa  211  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.018202 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1021  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  31.93 
 
 
505 aa  212  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.527208  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1857  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.28 
 
 
574 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119390  Diflavin flavoprotein A 1-like protein  34.12 
 
 
638 aa  211  2e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.254321  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2654  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.35 
 
 
396 aa  211  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1132  beta-lactamase domain-containing protein  31.66 
 
 
399 aa  211  2e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00481  flavoprotein  32.82 
 
 
589 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0321  beta-lactamase domain protein  30.9 
 
 
396 aa  210  3e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0944004  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0770  flavin reductase-like, FMN-binding  31.48 
 
 
574 aa  210  4e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3652  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  32.19 
 
 
493 aa  209  6e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3195  rubredoxin-oxygen oxidoreductase  30.4 
 
 
418 aa  209  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00034081  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4053  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  32.08 
 
 
498 aa  208  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2265  beta-lactamase domain protein  30.42 
 
 
407 aa  207  2e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0286  beta-lactamase domain protein  31.04 
 
 
398 aa  208  2e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3260  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  31.19 
 
 
494 aa  207  3e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0437217  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0784  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  31.68 
 
 
503 aa  207  3e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0906108  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1376  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  30.83 
 
 
591 aa  206  4e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3182  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  31.34 
 
 
482 aa  206  4e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2942  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  32.24 
 
 
397 aa  206  4e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0065497  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2771  beta-lactamase-like protein  36.25 
 
 
378 aa  207  4e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001301  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  33.09 
 
 
500 aa  206  5e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.410803  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2180  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  31.14 
 
 
397 aa  206  8e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00501  flavoprotein  32.05 
 
 
591 aa  205  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2180  flavoprotein  28.35 
 
 
582 aa  204  3e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>