222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1933 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1933  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 396 aa  810    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.837392  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2086  beta-lactamase domain-containing protein  62.94 
 
 		 394 aa  533  1e-150  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0614  beta-lactamase domain protein  62.28 
 
 		 395 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1413  beta-lactamase domain-containing protein  58.88 
 
 		 392 aa  499  1e-140  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1770  beta-lactamase domain protein  58.48 
 
 		 393 aa  498  1e-139  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0795  beta-lactamase-like  57.83 
 
 		 395 aa  483  1e-135  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0893314  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1920  beta-lactamase domain protein  59.44 
 
 		 393 aa  480  1e-134  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0876  flavodoxin/nitric oxide synthase  54.85 
 
 		 394 aa  469  1.0000000000000001e-131  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.0000000000000351493  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0320  beta-lactamase domain-containing protein  55.75 
 
 		 388 aa  462  1e-129  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.333267  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1198  beta-lactamase domain-containing protein  53.65 
 
 		 384 aa  443  1e-123  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.523487  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0174  ATPase domain-containing protein  51.79 
 
 		 394 aa  421  1e-116  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2179  flavodoxin  43.93 
 
 		 393 aa  344  1e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.438585  normal  0.181254 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0399  beta-lactamase domain protein  36.39 
 
 		 396 aa  243  5e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3353  flavoprotein A  38.89 
 
 		 403 aa  238  1e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00104416  normal  0.102932 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0168  beta-lactamase domain protein  37.53 
 
 		 395 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000343113 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0186  beta-lactamase domain protein  37.28 
 
 		 395 aa  231  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.617182  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22500  beta-lactamase domain protein  36.78 
 
 		 391 aa  230  4e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000416658  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0323  beta-lactamase domain-containing protein  32.56 
 
 		 392 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.625439  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0371  beta-lactamase domain-containing protein  34.19 
 
 		 395 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000174578  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0262  beta-lactamase domain-containing protein  35.29 
 
 		 387 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1287  Beta-lactamase-like  35.11 
 
 		 399 aa  219  7.999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000705459 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0339  beta-lactamase domain-containing protein  34.35 
 
 		 396 aa  219  7.999999999999999e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000206565  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2654  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.91 
 
 		 396 aa  217  4e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1269  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  31.83 
 
 		 878 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1091  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  31.83 
 
 		 878 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.224862  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2294  beta-lactamase domain protein  34.3 
 
 		 397 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000125791  hitchhiker  0.00000061463 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3253  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.02 
 
 		 397 aa  214  1.9999999999999998e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.233858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2516  beta-lactamase domain protein  32.74 
 
 		 405 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.264357  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2383  beta-lactamase-like protein  35.18 
 
 		 404 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0482  beta-lactamase domain-containing protein  32.38 
 
 		 387 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0410  beta-lactamase domain-containing protein  31.59 
 
 		 387 aa  211  2e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1509  beta-lactamase domain-containing protein  32.2 
 
 		 387 aa  210  4e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1132  beta-lactamase domain-containing protein  33.59 
 
 		 399 aa  209  5e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0425  beta-lactamase domain-containing protein  32.9 
 
 		 387 aa  209  9e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0284  metallo-beta-lactamase family protein  33.07 
 
 		 399 aa  207  3e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0275  metallo-beta-lactamase family flavodoxin  33.07 
 
 		 399 aa  207  3e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2795  rubredoxin-oxygen oxidoreductase, putative  33.07 
 
 		 395 aa  206  5e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057389  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2363  putative flavoprotein  33.59 
 
 		 508 aa  206  5e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1435  beta-lactamase domain protein  32.91 
 
 		 400 aa  204  2e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2054  putative flavoprotein  32.43 
 
 		 884 aa  204  3e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0448617  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0694  beta-lactamase domain protein  30.57 
 
 		 396 aa  202  7e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3652  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  31.88 
 
 		 493 aa  202  7e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001301  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  31.41 
 
 		 500 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.410803  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0138  beta-lactamase domain protein  31.49 
 
 		 401 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.392817 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1187  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  33.25 
 
 		 396 aa  199  6e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000111538  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1581  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  30.25 
 
 		 401 aa  199  7e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2199  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  34.28 
 
 		 499 aa  198  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1485  beta-lactamase-like protein  33.85 
 
 		 417 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000931355  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3642  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  29.92 
 
 		 392 aa  197  3e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1451  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  33.5 
 
 		 423 aa  196  6e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0955  beta-lactamase domain-containing protein  30.81 
 
 		 409 aa  195  1e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.86403  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0450  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.37 
 
 		 407 aa  195  1e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1554  beta-lactamase-like  30.98 
 
 		 410 aa  194  3e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0457538  normal  0.358726 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1203  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  32.74 
 
 		 405 aa  194  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1583  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  32.73 
 
 		 504 aa  193  4e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.652829  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3191  hypothetical protein  34.17 
 
 		 431 aa  193  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0386  beta-lactamase domain-containing protein  29.06 
 
 		 407 aa  193  5e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.458991 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0432  beta-lactamase domain-containing protein  33 
 
 		 404 aa  192  8e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.253728  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0456  beta-lactamase domain-containing protein  29.58 
 
 		 407 aa  191  1e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2942  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  32.96 
 
 		 397 aa  192  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0065497  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02560  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  31.28 
 
 		 479 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.54657  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0979  beta-lactamase domain protein  31.28 
 
 		 479 aa  191  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00228257  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0783  metallo-beta-lactamase family protein  33.42 
 
 		 406 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2846  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  31.28 
 
 		 479 aa  191  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2994  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  31.28 
 
 		 479 aa  191  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3960  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  31.28 
 
 		 479 aa  191  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1002  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  31.28 
 
 		 479 aa  191  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0118173  hitchhiker  0.000199326 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02525  hypothetical protein  31.28 
 
 		 479 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.459726  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0286  beta-lactamase domain protein  32.07 
 
 		 398 aa  190  4e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2833  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  31.03 
 
 		 479 aa  190  4e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0125184 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3930  beta-lactamase domain-containing protein  34.38 
 
 		 421 aa  190  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3260  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  32.14 
 
 		 494 aa  189  5.999999999999999e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0437217  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2991  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  32.68 
 
 		 479 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69588  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3042  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  32.68 
 
 		 479 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0301118 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3026  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  32.68 
 
 		 479 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000635155 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2960  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  32.68 
 
 		 479 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3167  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  31.43 
 
 		 479 aa  189  5.999999999999999e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0457  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.81 
 
 		 406 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1021  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  33.33 
 
 		 505 aa  189  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.527208  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0770  metallo-beta-lactamase family protein  32.92 
 
 		 406 aa  188  1e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.226143  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0063  beta-lactamase domain protein  34.59 
 
 		 400 aa  188  2e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3876  beta-lactamase domain protein  30.73 
 
 		 402 aa  188  2e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3033  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  30.56 
 
 		 485 aa  188  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.583429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4053  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  31.17 
 
 		 498 aa  187  3e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3191  flavodoxin  33.77 
 
 		 409 aa  187  4e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0415851  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2480  beta-lactamase domain protein  34.16 
 
 		 394 aa  186  8e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.877522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3195  rubredoxin-oxygen oxidoreductase  29.97 
 
 		 418 aa  185  9e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00034081  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2265  beta-lactamase domain protein  31.53 
 
 		 407 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3149  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  32.39 
 
 		 479 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.540983  normal  0.0409708 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0202  beta-lactamase domain-containing protein  29.87 
 
 		 402 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3699  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  32.48 
 
 		 402 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3182  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  30.26 
 
 		 482 aa  183  4.0000000000000006e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0232  flavodoxin  31.22 
 
 		 401 aa  181  2e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0784  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  33.71 
 
 		 503 aa  180  4.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0906108  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2479  beta-lactamase domain protein  30.23 
 
 		 402 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3243  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  30.79 
 
 		 404 aa  179  8e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.39456  hitchhiker  0.0000871777 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3294  rubredoxin-oxygen oxidoreductase, putative  32.36 
 
 		 404 aa  177  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2889  beta-lactamase domain-containing protein  30.38 
 
 		 410 aa  176  7e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.726482  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.54 
 
 		 576 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0876298  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1153  beta-lactamase domain-containing protein  30.94 
 
 		 405 aa  175  9.999999999999999e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.187317  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>